Exd1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Exd1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-07315

品系全称

C57BL/6JCya-Exd1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-241624-Exd1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Exd1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-07315) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
exonuclease 3'-5' domain containing 1
基因别称
4932702D22Rik,Exdl1,mExd1
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172857 | Ensembl: ENSMUST00000060009
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~7
敲除长度
~8.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:3045306Mice homozygous for a knock-out allele are fertile and viable, but exhibit defective biogenesis of antisense piRNAs and activation of transposons in male germ cells.
Exd1,也称为Exonuclease domain-containing 1,是一种编码具有核酸外切酶结构域的蛋白质的基因。Exd1蛋白在多种生物学过程中发挥作用,包括RNA加工、基因表达调控和细胞应激反应等。Exd1蛋白的结构特征使其能够与核酸分子相互作用,从而影响基因的表达和RNA的稳定性。此外,Exd1还参与了细胞应激反应的调控,例如在盐胁迫下,植物中的AtSIEK蛋白(一种Exd1样蛋白)通过与FRY2/CPL1相互作用,协同调节植物对盐胁迫的响应。因此,Exd1基因在多种生物学过程中发挥着重要的作用。

在哺乳动物中,Exd1基因的调控与piRNA的生物合成有关。piRNA是一类小RNA分子,它们在生殖细胞中指导PIWI蛋白抑制转座子。Yang等人(2015)的研究发现,Exd1蛋白与TDRD12蛋白相互作用,形成PET(PIWI-EXD1-Tdrd12)复合物,参与核内piRNA的生物合成。PET复合物中,Exd1蛋白的功能作为RNA适配器,促进核内piRNA的产生。该研究还发现,Exd1蛋白的缺失会降低MILI蛋白切割产生的序列数量,从而影响MIWI2蛋白介导的piRNA的生物合成,并导致LINE1转座子的去抑制。这表明,Exd1蛋白在维持生殖细胞中piRNA的产生和转座子抑制中发挥着关键的作用[2]。

此外,Exd1基因还与脑内的基因表达调控有关。Jensen等人(2020)的研究发现,在AGAT(l-arginine:glycine amidinotransferase)缺乏的小鼠脑中,Exd1基因的表达发生了显著的变化。AGAT是一种参与精氨酸代谢的酶,其缺乏会导致同精氨酸(hArg)和肌酸(creatine)的产生减少。该研究发现,Exd1基因的表达受到hArg的调控,并且与脑内的氨基酸代谢、肌酸代谢、脑部髓鞘形成和神经元兴奋性等生物学过程相关。此外,实验性脑卒中模型中也发现了Exd1基因表达的显著变化,表明Exd1基因可能参与脑卒中的病理过程[1]。

综上所述,Exd1基因编码的蛋白在多种生物学过程中发挥着重要的作用。Exd1蛋白参与RNA加工、基因表达调控和细胞应激反应等过程。在哺乳动物中,Exd1蛋白与piRNA的生物合成有关,而植物中的AtSIEK蛋白则参与植物对盐胁迫的响应。Exd1基因在脑内的表达受到hArg的调控,并且与脑内的多种生物学过程相关。这些研究表明,Exd1基因在维持生殖细胞中piRNA的产生和转座子抑制、植物对盐胁迫的响应以及脑内基因表达调控等方面发挥着重要的作用[1][2]。

参考文献:
1. Jensen, Märit, Müller, Christian, Schwedhelm, Edzard, Zeller, Tanja, Choe, Chi-Un. 2020. Homoarginine- and Creatine-Dependent Gene Regulation in Murine Brains with l-Arginine:Glycine Amidinotransferase Deficiency. In International journal of molecular sciences, 21, . doi:10.3390/ijms21051865. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32182846/
2. Yang, Zhaolin, Chen, Kuan-Ming, Pandey, Radha Raman, McCarthy, Andrew A, Pillai, Ramesh S. 2015. PIWI Slicing and EXD1 Drive Biogenesis of Nuclear piRNAs from Cytosolic Targets of the Mouse piRNA Pathway. In Molecular cell, 61, 138-52. doi:10.1016/j.molcel.2015.11.009. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26669262/