Phf20l1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Phf20l1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-07080

品系全称

C57BL/6JCya-Phf20l1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-239510-Phf20l1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Phf20l1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-07080) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
PHD finger protein 20-like 1
基因别称
CGI-72,E130113K22Rik
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001081409.1 | Ensembl: ENSMUST00000229160
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~7
敲除长度
~9434 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
PHF20L1,即植物同源结构域指蛋白20样1,是一种重要的表观遗传调控因子,属于Tudor结构域蛋白家族。Tudor结构域蛋白能够识别并结合组蛋白和非组蛋白上的甲基赖氨酸/精氨酸残基,参与调控染色质结构、转录、基因组稳定性和RNA代谢等生物学过程。PHF20L1含有N端Tudor结构域和C端植物同源结构域,能够与单甲基化的赖氨酸残基结合,参与多种生物学过程。

PHF20L1在多种癌症中发挥重要作用。在乳腺癌中,PHF20L1的启动子区甲基化状态与乳腺癌的亚型和预后相关[1]。研究发现,PHF20L1的基因扩增和过表达在侵袭性较高的乳腺癌亚型中更为常见,并与患者生存期缩短相关[6]。此外,PHF20L1还能通过调节DNA甲基化酶1(DNMT1)蛋白的稳定性,影响DNA甲基化水平,进而影响基因表达[6]。

PHF20L1还与SOX2蛋白的稳定性有关。研究发现,MLL1/WDR5复合物能够与SOX2蛋白相互作用,促进其泛素化和降解,而PHF20L1能够与SOX2蛋白结合,抑制其泛素化和降解,从而稳定SOX2蛋白[2]。此外,PHF20L1的表达与1型糖尿病的发病年龄相关,在淋巴细胞、胰腺和脾脏中,PHF20L1表达水平升高与1型糖尿病发病年龄降低相关[5]。

PHF20L1还与HSV-1病毒基因组在感染人成纤维细胞后的命运相关。研究发现,HSV-1病毒基因组与H3K27me2和PHF20L1蛋白存在异质性关联,这种关联受到病毒基因组在细胞核内定位和转录活性的影响[3][9]。此外,PHF20L1还能够与单甲基化的视网膜母细胞瘤肿瘤抑制蛋白(pRb)相互作用,参与调控G1-S期检查点,维持pRb的活性[7]。

在结直肠癌中,PHF20L1能够通过抑制HIC1的表达,促进PAX2的表达,进而促进结直肠癌细胞的增殖、上皮间质转化和血管生成,以及肝转移[4]。此外,PHF20L1还与其他基因发生融合,如APPBP2-PHF20L1、BCAS3-HOXB9等,这些融合基因可能与乳腺癌的发生和发展有关[8]。

综上所述,PHF20L1是一种重要的表观遗传调控因子,在多种癌症中发挥重要作用。PHF20L1能够通过多种机制影响基因表达和细胞生物学过程,如调节DNA甲基化、稳定SOX2蛋白、影响pRb活性等。PHF20L1的研究有助于深入理解表观遗传调控在癌症发生和发展中的作用机制,为癌症的诊断、治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Sierra-Ramirez, Jose Alfredo, Seseña-Mendez, Emmanuel, Godinez-Victoria, Marycarmen, Hernandez-Caballero, Marta Elena. . An insight into the promoter methylation of PHF20L1 and the gene association with metastasis in breast cancer. In Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University, 30, 507-515. doi:10.17219/acem/133426. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33847474/
2. Wang, Qianqian, Yu, Min, Ma, Yue, Lan, Rongfeng, Lu, Fei. 2018. PHF20L1 antagonizes SOX2 proteolysis triggered by the MLL1/WDR5 complexes. In Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology, 98, 1627-1641. doi:10.1038/s41374-018-0106-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30089852/
3. Francois, Alison K, Rohani, Ali, Loftus, Matt, Kashatus, David, Cliffe, Anna R. 2024. Single-genome analysis reveals a heterogeneous association of the herpes simplex virus genome with H3K27me2 and the reader PHF20L1 following infection of human fibroblasts. In mBio, 15, e0327823. doi:10.1128/mbio.03278-23. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38411116/
4. Zhu, Qing-Chao, Sun, Jian-Hua, Liang, Ming-Jun, Zhang, Zheng-Yun, Xia, Yang. 2022. PHF20L1 mediates PAX2 expression to promote angiogenesis and liver metastasis in colorectal cancer through regulating HIC1. In Biological chemistry, 403, 917-928. doi:10.1515/hsz-2022-0103. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35357096/
5. Syreeni, A, Sandholm, N, Sidore, C, Harjutsalo, V, Groop, P-H. 2020. Genome-wide search for genes affecting the age at diagnosis of type 1 diabetes. In Journal of internal medicine, 289, 662-674. doi:10.1111/joim.13187. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33179336/
6. Jiang, Yuanyuan, Liu, Lanxin, Shan, Wenqi, Yang, Zeng-Quan. 2015. An integrated genomic analysis of Tudor domain-containing proteins identifies PHD finger protein 20-like 1 (PHF20L1) as a candidate oncogene in breast cancer. In Molecular oncology, 10, 292-302. doi:10.1016/j.molonc.2015.10.013. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26588862/
7. Carr, Simon M, Munro, Shonagh, Sagum, Cari A, Bedford, Mark T, La Thangue, Nicholas B. 2017. Tudor-domain protein PHF20L1 reads lysine methylated retinoblastoma tumour suppressor protein. In Cell death and differentiation, 24, 2139-2149. doi:10.1038/cdd.2017.135. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28841214/
8. Schulte, Ina, Batty, Elizabeth M, Pole, Jessica C M, Howarth, Karen D, Edwards, Paul A W. 2012. Structural analysis of the genome of breast cancer cell line ZR-75-30 identifies twelve expressed fusion genes. In BMC genomics, 13, 719. doi:10.1186/1471-2164-13-719. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23260012/
9. Francois, Alison K, Rohani, Ali, Loftus, Matt, Kashatus, David, Cliffe, Anna R. 2023. Single-genome analysis reveals heterogeneous association of the Herpes Simplex Virus genome with H3K27me2 and the reader PHF20L1 following infection of human fibroblasts. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2023.12.03.569766. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38076966/