Setdb2-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Setdb2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-07036

品系全称

C57BL/6JCya-Setdb2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-239122-Setdb2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Setdb2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-07036) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SET domain, bifurcated 2
基因别称
Clld8,Gm293,KMT1F
染色体号
Chr 14 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001320720 | Ensembl: ENSMUST00000161459
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~7
敲除长度
~13.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2685139Mice homozygous for a hypomorphic allele exhibit altered response to infection and improved patology following superinfection of influenza virus-infected mice with S. pneumonia.
SETDB2,全称为SET domain, bifurcated 2,是一种重要的组蛋白甲基转移酶,属于KMT1家族。该家族成员通常负责将甲基基团添加到组蛋白H3的第9位赖氨酸(H3K9)上,这一修饰与基因沉默相关。SETDB2主要在哺乳动物细胞中发挥作用,通过调节染色质结构和基因表达来影响多种生物学过程,包括细胞分化、组织维持、炎症反应和疾病发生等。

SETDB2在维持组织完整性方面发挥着关键作用。研究表明,SETDB2通过抑制转录因子与特定基因启动子和增强子元件的结合,来确保细胞分化和组织维持过程中的基因转录稳态[1]。SETDB2在多种组织中都有表达,包括血液、肌肉和神经组织,并在这些组织的分化过程中发挥重要作用。例如,在血液系统发育过程中,SETDB2的表达水平与细胞分化和成熟相关,其缺失会导致细胞分化障碍和造血功能异常[1]。

SETDB2还参与调节巨噬细胞的表型和功能。巨噬细胞是免疫系统中的重要细胞类型,参与炎症反应和免疫防御。研究表明,SETDB2在巨噬细胞中发挥着抑制炎症反应和促进组织修复的作用。SETDB2通过抑制NF-κB信号通路,抑制炎症基因的表达,从而减轻炎症反应[2]。此外,SETDB2还参与调节巨噬细胞的极化过程,促进巨噬细胞从促炎表型向修复表型的转变[2]。

SETDB2在血管炎症和动脉粥样硬化发生发展中发挥重要作用。研究表明,SETDB2在动脉粥样硬化病变中表达上调,并且主要在促炎M1巨噬细胞中表达。SETDB2的缺失可以促进血管炎症,并加速动脉粥样硬化的发生发展[3]。SETDB2的缺失还导致巨噬细胞在动脉粥样硬化病变中的积累,并抑制巨噬细胞的吞噬作用,从而加剧炎症反应[3]。

SETDB2在治疗引起的细胞重编程中也发挥重要作用。研究表明,SETDB2的过表达与治疗耐药性相关,并且SETDB2的过表达与IFN信号通路和表观遗传修饰的改变相关[4]。SETDB2的激活可以导致H3K9me3水平的升高,从而抑制基因表达,并促进细胞耐药性的形成[4]。

SETDB2还与遗传性状相关。研究表明,SETDB2的基因多态性与手性偏侧相关。SETDB2可以调节左右轴的分化,并影响手性偏侧的形成[6]。SETDB2的基因多态性还与乳腺癌的发生发展相关。SETDB2在乳腺癌细胞中过表达,并且其过表达与乳腺癌干细胞的维持相关[5]。

SETDB2在急性淋巴细胞白血病(ALL)中发挥重要的致癌作用。SETDB2在ALL细胞中过表达,并且其过表达与ALL的发生发展和耐药性相关[7]。SETDB2通过抑制细胞周期抑制剂CDKN2C的表达,促进ALL细胞的增殖和存活[7]。

综上所述,SETDB2是一种重要的组蛋白甲基转移酶,参与调节染色质结构和基因表达,影响多种生物学过程,包括细胞分化、组织维持、炎症反应和疾病发生等。SETDB2在多种疾病中发挥重要作用,包括动脉粥样硬化、糖尿病、乳腺癌和急性淋巴细胞白血病等。SETDB2的研究有助于深入理解组蛋白甲基化修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Padeken, Jan, Methot, Stephen P, Gasser, Susan M. 2022. Establishment of H3K9-methylated heterochromatin and its functions in tissue differentiation and maintenance. In Nature reviews. Molecular cell biology, 23, 623-640. doi:10.1038/s41580-022-00483-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35562425/
2. Kimball, Andrew S, Davis, Frank M, denDekker, Aaron, Kunkel, Steve L, Gallagher, Katherine A. 2019. The Histone Methyltransferase Setdb2 Modulates Macrophage Phenotype and Uric Acid Production in Diabetic Wound Repair. In Immunity, 51, 258-271.e5. doi:10.1016/j.immuni.2019.06.015. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31350176/
3. Zhang, Xinbo, Sun, Jonathan, Canfrán-Duque, Alberto, Osborne, Timothy F, Fernández-Hernando, Carlos. 2021. Deficiency of histone lysine methyltransferase SETDB2 in hematopoietic cells promotes vascular inflammation and accelerates atherosclerosis. In JCI insight, 6, . doi:10.1172/jci.insight.147984. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34003795/
4. Torrano, Joachim, Al Emran, Abdullah, Hammerlindl, Heinz, Schaider, Helmut. 2019. Emerging roles of H3K9me3, SETDB1 and SETDB2 in therapy-induced cellular reprogramming. In Clinical epigenetics, 11, 43. doi:10.1186/s13148-019-0644-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30850015/
5. Ying, Liu, Fei, Xie, Jialun, Li, Jing, Li, Jing, Feng. 2020. SETDB2 promoted breast cancer stem cell maintenance by interaction with and stabilization of ΔNp63α protein. In International journal of biological sciences, 16, 2180-2191. doi:10.7150/ijbs.43611. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32549764/
6. Ocklenburg, Sebastian, Arning, Larissa, Gerding, Wanda M, Beste, Christian, Akkad, Denis A. 2015. Left-Right Axis Differentiation and Functional Lateralization: a Haplotype in the Methyltransferase Encoding Gene SETDB2 Might Mediate Handedness in Healthy Adults. In Molecular neurobiology, 53, 6355-6361. doi:10.1007/s12035-015-9534-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26572639/
7. Lin, Chiou-Hong, Wong, Stephen Hon-Kit, Kurzer, Jason H, Feng, Xuhui, Cleary, Michael L. . SETDB2 Links E2A-PBX1 to Cell-Cycle Dysregulation in Acute Leukemia through CDKN2C Repression. In Cell reports, 23, 1166-1177. doi:10.1016/j.celrep.2018.03.124. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29694893/