Rbm41-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Rbm41-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06875

品系全称

C57BL/6JCya-Rbm41em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-237073-Rbm41-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rbm41-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06875) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RNA binding motif protein 41
基因别称
D330023I21Rik
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001290630 | Ensembl: ENSMUST00000113011
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~5.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2444923Male chimeras hemizygous for a gene trapped allele appear normal at E9.5.
Rbm41是一种在真核细胞中发挥重要作用的RNA结合蛋白。它在RNA剪接过程中扮演关键角色,尤其是在小剪接体(minor spliceosome)的组装和功能中。小剪接体主要负责剪接由非U2型剪接位点定义的内含子,与主要剪接体(major spliceosome)区分开来。Rbm41的发现为我们理解非U2型内含子的剪接机制提供了新的视角。

Rbm41蛋白具有一个高度保守的RNA识别基序(RRM),这个基序能够识别并结合RNA分子的特定结构,如3'-末端茎环结构。这种结合能力对于Rbm41在小剪接体中的功能至关重要。此外,Rbm41的N端区域具有独特的结构,这个区域对于其与其他蛋白质的相互作用和功能发挥同样重要。

在非U2型内含子的剪接过程中,Rbm41与U11/U12-65K蛋白形成对比。U11/U12-65K是U11/U12 di-snRNP的一个已知独特成分,同样具有RRM结构域,能够与U12和U6atac snRNA的3'-末端茎环结构结合。然而,U11/U12-65K的N端区域在剪接过程中与U11 snRNP相互作用,识别内含子,而Rbm41则与DHX8 RNA解旋酶结合,参与剪接后的步骤。

Rbm41与DHX8的结合对于剪接体释放成熟的mRNA至关重要。Rbm41与被切除的U12型内含子套索结构相关联,存在于U12 mono-snRNP中,并且在Cajal体中富集。这些发现表明Rbm41在小剪接体的组装/解组装循环的后期阶段发挥作用。相比之下,U11/U12-65K在剪接体的早期阶段发挥作用,其N端区域与U11 snRNP相互作用,参与内含子的识别。

虽然Rbm41敲除细胞仍然存活,但它们在U12型3'剪接位点的使用上表现出变化。这一发现强调了U12 snRNA的3'-末端茎环结构作为动态结合平台的重要性,U11/U12-65K和Rbm41蛋白在不同的剪接阶段发挥作用。这些发现为我们理解小剪接体的复杂功能和剪接过程中的动态变化提供了新的见解[1]。

综上所述,Rbm41是一种重要的RNA结合蛋白,在小剪接体的组装和功能中发挥关键作用。它与U11/U12-65K蛋白形成对比,两者在剪接过程中具有不同的功能和作用阶段。Rbm41的研究为我们理解非U2型内含子的剪接机制提供了新的视角,有助于深入理解RNA剪接的复杂性和调控机制。

参考文献:
1. Norppa, Antto J, Chowdhury, Iftekhar, van Rooijen, Laura E, Varjosalo, Markku, Frilander, Mikko J. . Distinct functions for the paralogous RBM41 and U11/U12-65K proteins in the minor spliceosome. In Nucleic acids research, 52, 4037-4052. doi:10.1093/nar/gkae070. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38499487/