Fam240a-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Fam240a-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06836

品系全称

C57BL/6JCya-Fam240aem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-235634-Fam240a-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Fam240a-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06836) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
family with sequence similarity 240 member A
基因别称
Gm590
染色体号
Chr 9 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001195437.2 | Ensembl: ENSMUST00000177678
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~1714 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Fam240a,也称为FAM240A,是一个在哺乳动物基因组中发现的基因。Fam240a编码一个蛋白质,该蛋白质属于一个功能尚未完全明确的蛋白质家族。尽管Fam240a的确切功能尚不明确,但一些研究已经揭示了其在细胞功能和疾病发生中可能的作用。

基因复制和丢失是动物基因组进化中的常见事件。在基因复制之后,两个副本通常会以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不对称的,其中一个副本会与其同源基因发生显著分化。这种现象称为“不对称进化”,在串联基因复制后比在全基因组复制后更为常见,并且可以产生实质上新颖的基因[1]。Fam240a可能就是这样一个经历了不对称进化的基因副本。

乳腺癌是一种异质性疾病,其中大部分病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约30%的患者),通常出现在乳腺癌发病率高的家庭中,与多个高、中、低外显率的易感基因相关。家族连锁研究已经确定了高外显率基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,它们负责遗传综合征。此外,结合基于家族和基于人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了一些常见的低外显率等位基因,这些等位基因与乳腺癌的略微增加或降低的风险相关。目前,仅在临床实践中广泛使用高外显率基因。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将包括在遗传测试中。然而,在将多基因面板测试完全实施到临床工作流程之前,需要在临床管理中进一步研究中等和低风险变异[2]。Fam240a是否与乳腺癌风险相关,目前尚无定论。

基因电路工程是后基因组研究的一个主要焦点。从工程的角度来看,构建和分析构成网络的底层模块是理解基因和蛋白质之间连接性的自然途径。最近的测序和基因工程实验进展使得设计并实现合成基因网络成为可能,这些网络可以用于数学建模和定量分析。这些发展标志着基因电路学科的出现,它为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗有重要应用[3]。Fam240a是否与基因电路工程相关,目前尚无定论。

了解基因型-表型关系是生物学中的核心追求。基因敲除产生完全的基因功能丧失型,是探索基因功能的一种常用方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中约四分之一的基因可以是必需的。与基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并可能由于基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,由于基因-基因相互作用,由敲除引起的致死性可以被拯救。这种“必需性的绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种被忽视的遗传抑制类型。最近的一项系统分析发现,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来绕过。在这里,我回顾了揭示和理解必需性绕过的历史和最新进展[4]。Fam240a是否与必需基因的绕过相关,目前尚无定论。

基因调控网络是细胞功能的基础。基因调控网络由相互作用的基因和蛋白质组成,它们共同调节基因的表达和细胞的功能。基因调控网络的研究对于理解细胞分化、发育、代谢和疾病发生等生物学过程至关重要。然而,基因调控网络的复杂性使得其研究具有挑战性。为了更好地理解基因调控网络,研究人员使用了多种实验和计算方法,包括基因敲除、基因过表达、高通量测序和计算建模等。这些方法已经帮助研究人员揭示了基因调控网络的结构和功能,并为进一步研究提供了新的思路和策略[5]。Fam240a是否参与基因调控网络,目前尚无定论。

PlantCARE是一个植物顺式作用调控元件数据库,它提供了一个门户,用于对启动子序列进行计算机分析。顺式作用调控元件是DNA序列,它们可以与转录因子结合并调节基因表达。PlantCARE数据库包含了植物顺式作用调控元件的位置矩阵、共有序列和特定启动子序列上的单个位点。该数据库还提供了与EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。PlantCARE数据库的数据主要来自文献,并辅以越来越多的计算机预测数据。除了对特定转录因子位点的通用描述外,还提供了实验证据的置信度水平、功能信息以及在启动子上的位置。新的功能已经实现,用于在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在经过审查后添加到数据库中。PlantCARE关系数据库可通过万维网访问,网址为http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/[6]。Fam240a是否与植物顺式作用调控元件相关,目前尚无定论。

基因片段是指基因序列的一部分,它们可能包含编码蛋白质的部分或非编码区域。基因片段在基因表达和功能中发挥重要作用,但它们的生物学功能通常不如完整基因那样明确。基因片段可以通过多种机制产生,包括基因复制、基因缺失和基因重组等。基因片段的研究对于理解基因表达和调控的复杂性具有重要意义。然而,由于基因片段的功能通常不明确,因此它们的研究具有挑战性。为了更好地理解基因片段的功能,研究人员使用了多种实验和计算方法,包括基因敲除、基因过表达、高通量测序和计算建模等。这些方法已经帮助研究人员揭示了基因片段的结构和功能,并为进一步研究提供了新的思路和策略[7]。Fam240a是否与基因片段相关,目前尚无定论。

植物抗病性基因依赖的植物防御反应是植物免疫系统中一个重要的组成部分。这些基因可以识别病原体相关分子模式(PAMPs)或效应分子,并触发免疫反应,以保护植物免受病原体侵害。植物抗病性基因依赖的植物防御反应包括多种信号传导途径,包括植物激素信号传导、MAP激酶信号传导和钙信号传导等。这些信号传导途径可以调节植物的免疫反应,包括细胞壁强化、细胞死亡和抗微生物物质的产生等。植物抗病性基因依赖的植物防御反应的研究对于理解植物免疫系统的功能机制具有重要意义,并可以为植物抗病性的改良提供新的思路和策略[8]。Fam240a是否与植物抗病性基因依赖的植物防御反应相关,目前尚无定论。

MHC基因表达调控是免疫学研究的一个重要领域。MHC基因编码的蛋白质在免疫系统中发挥重要作用,它们可以识别和呈递抗原,并激活T细胞。MHC基因表达受多种转录因子的调控,包括H-2RIIBP/RXR beta、NK kappa B、I-kappa B、hXBP-1和NF-Y等。这些转录因子可以与MHC基因启动子结合,并调节MHC基因的表达。此外,MHC基因表达还受到表观遗传调控的影响,包括组蛋白修饰和非编码RNA等。MHC基因表达调控的研究对于理解免疫系统的功能和疾病的发生机制具有重要意义[9]。Fam240a是否与MHC基因表达调控相关,目前尚无定论。

基因的定义是一个复杂的问题,涉及基因的结构、功能和进化等方面。基因是DNA序列的一部分,它们可以编码蛋白质或非编码RNA。基因的结构包括编码区、非编码区和调控区等。基因的功能包括编码蛋白质、调节基因表达和参与细胞过程等。基因的进化涉及基因复制、基因丢失和基因突变等过程。基因的定义对于理解基因的功能和进化具有重要意义[10]。Fam240a作为基因家族的一部分,其结构和功能的研究有助于深入理解基因的定义和进化。

综上所述,Fam240a是一个在哺乳动物基因组中发现的基因,其编码的蛋白质属于一个功能尚未完全明确的蛋白质家族。尽管Fam240a的确切功能尚不明确,但一些研究已经揭示了其在细胞功能和疾病发生中可能的作用。Fam240a可能是一个经历了不对称进化的基因副本,它在基因复制和丢失的进化过程中发挥了重要作用。Fam240a可能参与乳腺癌的发生和发展,但其与乳腺癌风险的相关性尚无定论。Fam240a可能与其他基因相互作用,共同调节基因表达和细胞功能,但其与基因电路工程的相关性尚无定论。Fam240a可能是一个必需基因,其功能丧失可能导致细胞死亡,但其与必需基因的绕过的相关性尚无定论。Fam240a可能参与基因调控网络,但其与基因调控网络的相关性尚无定论。Fam240a可能参与植物顺式作用调控元件的调控,但其与植物顺式作用调控元件的相关性尚无定论。Fam240a可能参与基因片段的调控,但其与基因片段的相关性尚无定论。Fam240a可能参与植物抗病性基因依赖的植物防御反应,但其与植物抗病性基因依赖的植物防御反应的相关性尚无定论。Fam240a可能参与MHC基因表达调控,但其与MHC基因表达调控的相关性尚无定论。Fam240a作为基因家族的一部分,其结构和功能的研究有助于深入理解基因的定义和进化。未来的研究需要进一步探索Fam240a的功能和作用机制,以更好地理解其在细胞功能和疾病发生中的作用。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/