Klhdc4-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Klhdc4-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06751

品系全称

C57BL/6JCya-Klhdc4em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-234825-Klhdc4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Klhdc4-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06751) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
kelch domain containing 4
基因别称
G430025P05Rik
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_145605.2 | Ensembl: ENSMUST00000045884
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 6~10
敲除长度
~8765 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Klhdc4基因编码的是一种包含Kelch结构域的蛋白,属于kelch重复超家族。Kelch结构域是一种保守的蛋白质结构域,参与多种生物学过程,包括细胞骨架调控、信号转导和细胞周期控制。KLHDC4基因的变异与多种疾病的发生发展密切相关,包括胃癌、鼻咽癌和肾细胞癌等。

一项关于韩国人群胃癌风险位点的全基因组关联研究(GWAS)表明,KLHDC4基因中的非同义突变rs2303771与胃癌风险显著相关[1]。这项研究使用了1253例胃癌病例和4827例对照样本,通过基因型分析和功能注释,确定了71个与胃癌相关的基因,其中KLHDC4是唯一一个通过三种基因映射方法都被定位的基因。此外,KLHDC4基因的突变还与细胞膜上的GPI锚定蛋白的合成后修饰途径相关。

KLHDC4基因的表达与鼻咽癌患者的预后密切相关[2]。研究发现,KLHDC4基因在鼻咽癌组织中高表达,且KLHDC4的表达水平与鼻咽癌的TNM分期、总体生存率和无转移生存率呈负相关。此外,通过CRISPR/Cas9技术敲除KLHDC4基因可以抑制鼻咽癌细胞增殖、集落形成和肿瘤生长,并增加细胞凋亡。

KLHDC4基因中的罕见突变Glu510Lys也与鼻咽癌的发生发展相关[3]。研究发现,Glu510Lys突变导致KLHDC4蛋白与波形蛋白的结合增强,进而促进上皮-间质转化过程,增加肿瘤的侵袭和转移能力。此外,Vimentin的敲低可以显著减轻KLHDC4过表达和Glu510Lys突变引起的肿瘤生长和转移。

KLHDC4基因的表达还受到小鼠品系特异性内源性逆转录病毒(ERV)的影响[4]。研究发现,一种多态性的MMERGLN(GLN)ERV元件可以增强邻近的Klhdc4基因的表达,进而影响下游应激反应基因的表达。此外,研究人员还发现数千个潜在的多态性ERV,其中一部分与邻近染色质状态和转录相关。

KLHDC4基因在中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)中也发挥着重要作用[5]。研究发现,Klhdc4基因中的性别偏倚性SNP可以改变Klhdc4的剪接位点,产生两种剪接变体Klhdc4_a和Klhdc4_b。此外,Klhdc4在卵巢、睾丸和附腺中均有表达。这些发现表明,Klhdc4基因的性别偏倚性SNP和剪接变异可能是中华绒螯蟹性别调节的潜在机制。

KLHDC4基因的表达也与认知功能相关[6]。研究发现,KLHDC4基因的表达与认知评分呈非线性相关,且KLHDC4基因的表达与神经垂体激素和母体攻击性行为等生物途径相关。

KLHDC4基因的剪接变异还与肾细胞癌患者的生存率相关[7]。研究发现,KLHDC4基因的剪接变异与肾细胞癌患者的总体生存率呈负相关,且KLHDC4基因的剪接变异可以作为肾细胞癌患者的独立预后因素。

综上所述,KLHDC4基因在多种疾病的发生发展中发挥重要作用,包括胃癌、鼻咽癌和肾细胞癌等。KLHDC4基因的突变、表达和剪接变异与肿瘤的发生发展、患者的预后以及认知功能等相关。此外,KLHDC4基因的表达还受到内源性逆转录病毒的影响。KLHDC4基因的研究有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Pyun, Hyojin, Gunathilake, Madhawa, Lee, Jeonghee, Sung, Joohon, Kim, Jeongseon. 2023. Functional Annotation and Gene Set Analysis of Gastric Cancer Risk Loci in a Korean Population. In Cancer research and treatment, 56, 191-198. doi:10.4143/crt.2022.958. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37340842/
2. Lian, Yi-Fan, Yuan, Jing, Cui, Qian, Zeng, Yi-Xin, Feng, Lin. 2016. Upregulation of KLHDC4 Predicts a Poor Prognosis in Human Nasopharyngeal Carcinoma. In PloS one, 11, e0152820. doi:10.1371/journal.pone.0152820. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27030985/
3. Cheng, Xi-Xi, Lin, Guo-Wang, Zhou, Ya-Qing, Luo, Chun-Ling, Bei, Jin-Xin. 2024. A rare KLHDC4 variant Glu510Lys is associated with genetic susceptibility and promotes tumor metastasis in nasopharyngeal carcinoma. In Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao, , . doi:10.1016/j.jgg.2024.12.008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39706520/
4. Zhou, Xuemeng, Sam, Tsz Wing, Lee, Ah Young, Leung, Danny. 2021. Mouse strain-specific polymorphic provirus functions as cis-regulatory element leading to epigenomic and transcriptomic variations. In Nature communications, 12, 6462. doi:10.1038/s41467-021-26630-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34753915/
5. Xu, Yuanfeng, Yu, Fan, Feng, Wenrong, Li, Wenjing, Tang, Yongkai. . Genetic variation mining of the Chinese mitten crab (Eriocheir sinensis) based on transcriptome data from public databases. In Briefings in functional genomics, 23, 816-827. doi:10.1093/bfgp/elae030. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38984674/
6. Mohammadnejad, Afsaneh, Soerensen, Mette, Baumbach, Jan, Hjelmborg, Jacob V B, Tan, Qihua. 2021. Novel DNA methylation marker discovery by assumption-free genome-wide association analysis of cognitive function in twins. In Aging cell, 20, e13293. doi:10.1111/acel.13293. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33528912/
7. Chen, Tao, Zheng, Wenzhong, Chen, Jianbo, Li, Xianxin, Tan, Zhengling. 2019. Systematic analysis of survival-associated alternative splicing signatures in clear cell renal cell carcinoma. In Journal of cellular biochemistry, 121, 4074-4084. doi:10.1002/jcb.29590. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31886566/