Ddx19b-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ddx19b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06745

品系全称

C57BL/6JCya-Ddx19bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-234733-Ddx19b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ddx19b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06745) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DEAD box helicase 19b
基因别称
2810457M08Rik,4921519L13Rik
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001190786.1 | Ensembl: ENSMUST00000065784
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~3386 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2148251Homozygous knockout is embryonic lethal. Heterozygous KO leads to increased resistance to RNA virus infection.
基因Ddx19b,也称为Dbp5,是一种DEAD-box RNA解旋酶,属于DEAD-box RNA解旋酶家族。DEAD-box RNA解旋酶是一类重要的RNA结合蛋白,在RNA代谢中发挥重要作用,包括RNA的转录、剪接、运输和降解等过程。Ddx19b在基因表达调控中具有多种功能,包括RNA的出口、翻译、转录和DNA代谢等。

Ddx19b在RNA出口过程中发挥着重要作用。成熟的信使核糖核蛋白(mRNPs)从转录位点扩散到核孔复合物(NPCs),在通过NPCs的过程中,某些mRNP蛋白被移除,这可能是通过Ddx19b的酶促作用完成的。Ddx19b与NPCs的细胞质侧的成分Nup159和Gle1结合,在mRNA出口过程中发挥作用[5]。Gle1和肌醇六磷酸(IP6)激活Ddx19b的ATP酶活性,这可能是对Ddx19b活性在体内的空间调控[6]。此外,Ddx19b的SUMO化修饰可以调节其与Gle1的相互作用,从而调节其在mRNA出口过程中的功能[3]。

Ddx19b在翻译终止过程中也发挥作用。Dbp5/DDX19通过介导真核终止因子eRF1的递送,使核糖体达到终止密码子,从而实现翻译终止。Dbp5/DDX19与eRF1的相互作用在eRF3的解离后发生,导致多肽链释放和核糖体亚基的分裂。Dbp5/DDX19的突变会导致终止密码子读通,因为eRF1和eRF3的相互作用没有被控制,并且会过早发生[4]。这表明Dbp5/DDX19可能是无义抑制治疗的潜在药物靶点。

Ddx19b在DNA代谢中也具有功能。Ddx19b参与了DNA损伤的响应和修复过程,通过调节促进基因组稳定的因子的表达,防止DNA损伤,直接参与DNA损伤的响应和修复。Ddx19b还与癌症的发生和发展有关,可以作为癌症治疗的潜在靶点[1]。

Ddx19b在不同类型的癌症中具有不同的作用。在甲状腺癌中,Ddx19b是一个基因主调控因子,通过协调相关功能途径中众多基因的表达,调节细胞过程。通过稳定转染基因,可以诱导细胞中转录组的改变,从而实现对癌症细胞的靶向治疗[2]。在肝细胞癌中,Ddx19b是一个预后因子,通过调节剪接因子和剪接事件,影响肿瘤的发生和发展[7]。

综上所述,Ddx19b是一种重要的DEAD-box RNA解旋酶,在RNA代谢和基因表达调控中发挥着多种功能。Ddx19b在多种生物学过程中发挥作用,包括RNA的出口、翻译、转录和DNA代谢等。Ddx19b在多种疾病中发挥重要作用,包括癌症、神经退行性疾病等。Ddx19b的研究有助于深入理解RNA代谢和基因表达调控的机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Cargill, Michael, Venkataraman, Rasika, Lee, Stanley. 2021. DEAD-Box RNA Helicases and Genome Stability. In Genes, 12, . doi:10.3390/genes12101471. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34680866/
2. Iacobas, Dumitru A, Tuli, Neha Y, Iacobas, Sanda, Geliebter, Jan, Tiwari, Raj K. 2017. Gene master regulators of papillary and anaplastic thyroid cancers. In Oncotarget, 9, 2410-2424. doi:10.18632/oncotarget.23417. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29416781/
3. Banerjee, Poulomi, Markande, Shubha, Kalarikkal, Misha, Joseph, Jomon. 2022. SUMOylation modulates the function of DDX19 in mRNA export. In Journal of cell science, 135, . doi:10.1242/jcs.259449. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35080244/
4. Beißel, Christian, Grosse, Sebastian, Krebber, Heike. 2020. Dbp5/DDX19 between Translational Readthrough and Nonsense Mediated Decay. In International journal of molecular sciences, 21, . doi:10.3390/ijms21031085. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32041247/
5. Cole, Charles N, Scarcelli, John J. 2006. Transport of messenger RNA from the nucleus to the cytoplasm. In Current opinion in cell biology, 18, 299-306. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16682182/
6. Folkmann, Andrew W, Noble, Kristen N, Cole, Charles N, Wente, Susan R. 2011. Dbp5, Gle1-IP6 and Nup159: a working model for mRNP export. In Nucleus (Austin, Tex.), 2, 540-8. doi:10.4161/nucl.2.6.17881. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22064466/
7. Wang, Yue, Yang, Fan, Shang, Jiaqi, He, Haitao, Yang, Qing. 2021. Integrative analysis reveals the prognostic value and functions of splicing factors implicated in hepatocellular carcinoma. In Scientific reports, 11, 15175. doi:10.1038/s41598-021-94701-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34312475/