Ankle1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Ankle1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06712

品系全称

C57BL/6JCya-Ankle1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-234396-Ankle1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ankle1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06712) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ankyrin repeat and LEM domain containing 1
基因别称
8430438L13Rik,Ankrd41,C430003I23,Lem3
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172756.3 | Ensembl: ENSMUST00000119976
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~9
敲除长度
~3361 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1918775Homozygous inactivation of this gene causes no overt phenotype or detectable defects in hematopoiesis. Mouse embryonic fibroblasts do not show an impaired DNA damage response.
ANKLE1(Ankyrin repeat and LEM domain-containing protein 1),也称为LEM-3,是一种在哺乳动物中表达的蛋白质,它属于LEM家族成员。LEM家族是一类与染色质相关的蛋白质,它们含有LEM结构域,LEM结构域通过与DNA结合蛋白(如屏障到自整合因子,BAF)的相互作用,参与染色质结构的调节。ANKLE1在哺乳动物中主要在造血组织中表达,特别是红细胞生成过程中,它在红细胞母细胞中发挥重要作用[5]。ANKLE1具有内切酶活性,能够切割分支DNA,包括未解决和半解决的DNA连接和其他分支DNA结构[3,5]。这种内切酶活性对于细胞周期的正常进行和基因组完整性至关重要[3]。

在癌症研究中,ANKLE1引起了广泛关注。研究表明,ANKLE1在chr19p13.1位点上的等位基因与卵巢癌和乳腺癌的风险增加有关,并且该基因的表达上调与癌症风险相关[1]。ANKLE1的过表达导致基因组不稳定性和线粒体DNA(mtDNA)的切割,进而导致线粒体自噬和代谢重编程,从氧化磷酸化转变为糖酵解(Warburg效应)。此外,mtDNA的降解激活了STAT1和上皮-间质转化(EMT)基因的表达,减少了线粒体含量,从而导致对凋亡的抵抗,这可能导致癌前细胞避免凋亡检查点并增殖[1]。这些发现表明ANKLE1可能是chr19p13.1位点上的因果性癌症易感基因,并描述了ANKLE1高表达促进癌症风险的机制[1]。

除了在癌症中的作用,ANKLE1还与DNA损伤和修复有关。研究表明,ANKLE1在DNA损伤反应和DNA修复过程中发挥作用。ANKLE1敲低细胞在顺铂诱导的复制应激下表现出γ-H2AX焦点水平的升高,这表明ANKLE1在维持基因组稳定性中起作用[2]。ANKLE1的定位模式进一步强调了它在DNA修复过程中的作用[2]。

ANKLE1的基因多态性也与结直肠癌风险相关。研究发现,ANKLE1中的N6-甲基腺苷(m6A)相关变体与结直肠癌风险增加有关,通过维持基因组稳定性发挥作用。ANKLE1的m6A修饰由“writer”复合物(METTL3、METTL14或WTAP)催化,并被“reader”YTHDF1识别。ANKLE1的功能作为潜在的肿瘤抑制因子,抑制细胞增殖并促进基因组稳定性。ANKLE1敲低导致微核细胞频率升高,细胞增殖和集落形成能力增加[4]。

在前列腺癌中,ANKLE1的表达与肿瘤的进展和预后相关。研究发现,ANKLE1在前列腺腺癌(PRAD)患者中的表达显著升高,并且与晚期肿瘤分期和不良预后相关。ANKLE1的表达与免疫细胞浸润水平相关,高ANKLE1表达预示着更差的预后[6]。

综上所述,ANKLE1是一种在哺乳动物中表达的LEM家族蛋白质,具有内切酶活性,参与染色质结构和DNA损伤修复的调节。ANKLE1在癌症发生和进展中发挥重要作用,与卵巢癌、乳腺癌和结直肠癌的风险增加相关。ANKLE1的表达和功能在前列腺癌中与肿瘤的进展和预后相关。对ANKLE1的进一步研究有助于深入理解其在癌症发生和发展中的作用,为癌症的诊断、治疗和预防提供新的思路和策略[1,2,3,4,5,6]。

参考文献:
1. Przanowski, Piotr, Przanowska, Róża K, Guertin, Michael J. 2023. ANKLE1 cleaves mitochondrial DNA and contributes to cancer risk by promoting apoptosis resistance and metabolic dysregulation. In Communications biology, 6, 231. doi:10.1038/s42003-023-04611-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36859531/
2. Bakshi, Divya, Katoch, Archana, Chakraborty, Souneek, Goswami, Anindya, Kumar, Rakesh. 2021. ANKLE1 as New Hotspot Mutation for Breast Cancer in Indian Population and Has a Role in DNA Damage and Repair in Mammalian Cells. In Frontiers in genetics, 11, 609758. doi:10.3389/fgene.2020.609758. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33584808/
3. Song, Junfang, Freeman, Alasdair D J, Knebel, Axel, Gartner, Anton, Lilley, David M J. 2020. Human ANKLE1 Is a Nuclease Specific for Branched DNA. In Journal of molecular biology, 432, 5825-5834. doi:10.1016/j.jmb.2020.08.022. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32866453/
4. Tian, Jianbo, Ying, Pingting, Ke, Juntao, Chang, Jiang, Miao, Xiaoping. 2019. ANKLE1 N6 -Methyladenosine-related variant is associated with colorectal cancer risk by maintaining the genomic stability. In International journal of cancer, 146, 3281-3293. doi:10.1002/ijc.32677. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31509622/
5. Brachner, Andreas, Braun, Juliane, Ghodgaonkar, Medini, Knasmüller, Siegfried, Foisner, Roland. 2012. The endonuclease Ankle1 requires its LEM and GIY-YIG motifs for DNA cleavage in vivo. In Journal of cell science, 125, 1048-57. doi:10.1242/jcs.098392. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22399800/
6. He, Tianzhen, Zhang, Yulian, Li, Xueyu, Zhao, Peng, Wang, Ke. 2022. Collective analysis of the expression and prognosis for LEM-domain proteins in prostate cancer. In World journal of surgical oncology, 20, 174. doi:10.1186/s12957-022-02640-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35650630/