Ythdc1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ythdc1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06435

品系全称

C57BL/6JCya-Ythdc1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-231386-Ythdc1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ythdc1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06435) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
YTH domain containing 1
基因别称
A730098D12Rik,mKIAA1966
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_177680 | Ensembl: ENSMUST00000038384
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 5~7
敲除长度
~2.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2443713Mice homozygous for a null allele die between E8.5 and E11.5. Mice homozygous for a cconditional allele activated after embryonic development exhibit infertility with defects in spermatogenesis and oogenesis associated with RNA granules and altered transcription in oocytes.
YTHDC1,即YTH域包含蛋白1,是一种在真核生物中广泛存在的RNA结合蛋白,它在细胞内RNA的代谢和调控中发挥着重要作用。YTHDC1具有YTH域,这是识别N6-甲基腺苷(m6A)修饰的RNA所必需的结构域。m6A是一种普遍存在于真核细胞RNA上的表观遗传修饰,参与调控RNA的稳定性和功能,影响基因表达和生物学过程。

YTHDC1在多种生物学过程中发挥着重要作用。在热应激下,YTHDC1在基因组上的分布发生改变,包括向热诱导的热休克蛋白(HSP)基因的重新分布。YTHDC1与m6A修饰的HSP转录本结合,共转录促进HSP的表达。此外,YTHDC1还与ELAVL1/HuR相互作用,通过调节SQSTM1的稳定性来调节自噬[1]。YTHDC1在转录调控中发挥重要作用,通过募集和调节剪接因子来促进外显子包含,同时抑制其他剪接因子的RNA结合[2]。

在神经母细胞瘤(NB)中,YTHDC1基因多态性与NB的易感性降低相关。功能实验表明,YTHDC1 siRNA-554可以抑制NB细胞的增殖和迁移[3]。在急性髓系白血病(AML)中,YTHDC1过表达,且对于AML细胞的增殖和生存至关重要。遗传缺失Ythdc1可以显著阻止AML的发展、维持和白血病干细胞的自我更新[4]。在肝母细胞瘤中,YTHDC1基因多态性与肝母细胞瘤的易感性没有显著关联,但在临床分期III + IV的亚组中,rs2293596 TC/CC基因型携带者有更高的风险[5]。

YTHDC1的研究揭示了其在多种生物学过程中的重要作用,包括基因表达调控、细胞应激反应和肿瘤发生。YTHDC1的研究有助于深入理解RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Timcheva, Kalina, Dufour, Solenne, Touat-Todeschini, Leila, Seigneurin-Berny, Daphné, Verdel, André. . Chromatin-associated YTHDC1 coordinates heat-induced reprogramming of gene expression. In Cell reports, 41, 111784. doi:10.1016/j.celrep.2022.111784. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36516773/
2. Xiao, Wen, Adhikari, Samir, Dahal, Ujwal, Zhao, Yong-Liang, Yang, Yun-Gui. 2016. Nuclear m(6)A Reader YTHDC1 Regulates mRNA Splicing. In Molecular cell, 61, 507-519. doi:10.1016/j.molcel.2016.01.012. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26876937/
3. Liang, Diefei, Lin, Wei-Jye, Ren, Meng, Yan, Li, Wang, Wei. 2021. m6A reader YTHDC1 modulates autophagy by targeting SQSTM1 in diabetic skin. In Autophagy, 18, 1318-1337. doi:10.1080/15548627.2021.1974175. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34657574/
4. Jiang, Xiulin, Liu, Baiyang, Nie, Zhi, Yang, Cuiping, Chen, Yongbin. 2021. The role of m6A modification in the biological functions and diseases. In Signal transduction and targeted therapy, 6, 74. doi:10.1038/s41392-020-00450-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33611339/
5. Lee, Joo-Hyung, Wang, Ruoyu, Xiong, Feng, Mancini, Michael A, Li, Wenbo. 2021. Enhancer RNA m6A methylation facilitates transcriptional condensate formation and gene activation. In Molecular cell, 81, 3368-3385.e9. doi:10.1016/j.molcel.2021.07.024. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34375583/