Pdik1l-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Pdik1l-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06383

品系全称

C57BL/6JCya-Pdik1lem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-230809-Pdik1l-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pdik1l-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06383) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
PDLIM1 interacting kinase 1 like
基因别称
stk35l2
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_146156.3 | Ensembl: ENSMUST00000061234
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~6150 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Pdik1l,也称为STK35L2,是一种重要的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。它编码一个由341个氨基酸组成的蛋白质,与人类激酶CLIK1具有69%的序列同源性,后者被认为是CLP-36相互作用的激酶。生物信息学分析表明,Pdik1l可能通过与PDZ和LIM结构域蛋白的相互作用,在细胞信号传导中发挥作用。Ensembl基因组浏览器将Pdik1l定位到人类染色体1p35.3,该基因长约13.7 kb,包含四个外显子和三个内含子。多项组织cDNA面板PCR显示,该基因在人类组织中广泛表达,包括肝脏、肾脏、胰腺、脾脏、胸腺和前列腺。蛋白质似乎定位于细胞核[1]。

Pdik1l在急性髓系白血病(AML)的发病机制中发挥重要作用。AML细胞依赖于磷酸化信号通路来获得无限增殖的能力。研究表明,核磷酸酶SCP4在AML中是一个依赖因子,但在正常造血祖细胞中是不必要的。SCP4的催化功能对于AML是必需的。通过亲和纯化复合物的质谱分析,研究者发现STK35和Pdik1l是SCP4磷酸酶结构域的连接伴侣和底物。STK35和Pdik1l在相同的通路中催化和冗余地发挥作用,以维持AML的增殖,并支持氨基酸的生物合成和转运。SCP4通过两种不同的机制调节STK35/Pdik1l:通过催化去除抑制性磷酸化,并促进激酶的稳定性。这些发现揭示了一个支持AML发病机制的磷酸酶-激酶信号复合物[2]。

在肺癌腺癌(LUAD)中,Pdik1l也被确定为预后模型的一部分。研究者在LUAD中识别了与缺氧和线粒体评分相关的318个差异表达基因,并基于16个基因建立了预后模型,包括PKM、S100A16、RRAS、TUBA4A、PKP3、KCTD12、LPGAT1、ITPRID2、MZT2A、LIFR、PTPRM、LATS2、PDIK1l、GORAB、PCDH7和CPED1。该模型显示出良好的预测准确性。此外,肿瘤微环境分析和药物敏感性分析表明,风险评分与某些免疫细胞相关,并且较高的风险评分可能表明化疗效果更好[3]。

Pdik1l与STK35L1、STK35L3等激酶同源基因一起,构成了一个保守的激酶家族。STK35L1是STK35基因的完整序列,编码一个534个氨基酸的蛋白质,而STK35L3是在脊椎动物中发现的第三个STK35样基因。这些激酶在细胞功能和人疾病中发挥作用[4]。

在人类卵母细胞衰老中,Pdik1l也被识别为一个关键基因。通过机器学习方法,研究者发现Pdik1l、SIRT1和MCU是卵母细胞衰老的关键基因。基于这些关键基因,构建了一个包含8个miRNA、3个mRNA和227个转录因子的卵母细胞衰老调控网络。这些发现有助于深入理解卵母细胞衰老的机制,并为改善老年女性的生育结果提供治疗策略[5]。

综上所述,Pdik1l是一种重要的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,参与调控细胞信号传导和疾病发生。它在AML、LUAD和卵母细胞衰老中发挥重要作用,并与SCP4、STK35等激酶共同构成一个保守的激酶家族。Pdik1l的研究有助于深入理解激酶的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Guo, Lingchen, Ji, Chaoneng, Gu, Shaohua, Xie, Yi, Mao, Yumin. . Molecular cloning and characterization of a novel human kinase gene, PDIK1L. In Journal of genetics, 82, 27-32. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14631099/
2. Polyanskaya, Sofya A, Moreno, Rosamaria Y, Lu, Bin, Zhang, Yan Jessie, Vakoc, Christopher R. . SCP4-STK35/PDIK1L complex is a dual phospho-catalytic signaling dependency in acute myeloid leukemia. In Cell reports, 38, 110233. doi:10.1016/j.celrep.2021.110233. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35021089/
3. Zhao, Wenhao, Huang, Hua, Zhao, Zexia, Liu, Hongyu, Chen, Jun. 2024. Identification of Hypoxia and Mitochondrial-related Gene Signature and Prediction of Prognostic Model in Lung Adenocarcinoma. In Journal of Cancer, 15, 4513-4526. doi:10.7150/jca.97374. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39006078/
4. Goyal, Pankaj, Behring, Antje, Kumar, Abhishek, Siess, Wolfgang. 2009. Identifying and characterizing a novel protein kinase STK35L1 and deciphering its orthologs and close-homologs in vertebrates. In PloS one, 4, e6981. doi:10.1371/journal.pone.0006981. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19756140/
5. Luo, Xi, Liang, Mingming, Zhang, Dandan, Huang, Ben. 2024. Identification of diagnostic genes and the miRNA‒mRNA‒TF regulatory network in human oocyte aging via machine learning methods. In Journal of assisted reproduction and genetics, 42, 319-333. doi:10.1007/s10815-024-03311-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39540991/