Fhip1a-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Fhip1a-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06250

品系全称

C57BL/6JCya-Fhip1aem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-229488-Fhip1a-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Fhip1a-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06250) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
FHF complex subunit HOOK interacting protein 1A
基因别称
9930021J17Rik,Fam160a1
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172682.3 | Ensembl: ENSMUST00000118408
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 8~9
敲除长度
~4039 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2444746Mice homozygous for a knock-out allele exhibit defects in placentation with abnormal trophoblast layer formation, abnormal trophoblast giant cell size and morphology, and complete lethality throughout fetal growth and development.
FHIP1A-DT,全称为FHIP1A divergent transcription,是一种长链非编码RNA(lncRNA),它通过反向转录产生,在泛癌和结直肠癌(CRC)中的机制尚不清楚。FHIP1A-DT在多种癌症中表现出不同的表达模式,并显示出对癌症诊断和预后的潜在价值。通过对泛癌和CRC数据的分析,研究者们揭示了FHIP1A-DT的分子机制。研究发现,FHIP1A-DT在泛癌中的表达存在差异,并具有优异的诊断和预后能力。FHIP1A-DT与泛癌的肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)和免疫细胞含量相关。在CRC中,FHIP1A-DT的表达下调,低表达的CRC患者预后较差。构建了结合FHIP1A-DT表达的nomogram,显示出对预后的良好预测能力。基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析表明,FHIP1A-DT与表观遗传修饰相关,并调节了许多癌症相关通路。竞争性内源性RNA(ceRNA)网络分析显示FHIP1A-DT的潜在基因调控作用。FHIP1A-DT与多种化疗药物的敏感性以及免疫细胞浸润相关,如CD4记忆静息T细胞、单核细胞、浆细胞、中性粒细胞和M2巨噬细胞。使用外部数据集GSE17538和GSE39582进行外部验证,并通过qPCR获得相似的结果。这些研究表明,FHIP1A-DT是一种新型的CRC相关lncRNA,与CRC的诊断、预后和治疗敏感性相关,未来可能成为CRC的重要生物标志物[1]。

另一项研究则从遗传角度探讨了FHIP1A在脂质特征中的作用。研究发现,FHIP1A基因区域与低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平存在关联,并发现了一个新的三酰甘油关联信号。该研究强调了非洲人群在发现新型遗传关联中的重要性,并表明随着非洲复制队列规模的增加,检测到的信号的通用性得到了提高。多基因风险评分分析显示,随着发现数据集与该队列之间遗传距离的缩小,对LDL-C水平的预测精度有所提高。这一研究强调了包括非洲数据在内的多人群研究在遗传关联研究中的重要性[2]。

综合来看,FHIP1A-DT作为一种长链非编码RNA,在癌症的诊断、预后和治疗中具有潜在的重要价值。其表达模式与癌症的进展和患者的预后密切相关,并且可能参与调节多种癌症相关通路。此外,FHIP1A基因区域与脂质特征的遗传关联也得到了证实,这表明FHIP1A可能在脂质代谢中发挥重要作用。这些研究结果为深入理解FHIP1A-DT和FHIP1A的生物学功能和疾病发生机制提供了新的线索,并为癌症和脂质代谢相关疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略[1][2]。

参考文献:
1. Yang, Yongjun, Xiong, Zuming, Li, Wenxin, Huang, Wei, Zhang, Sen. 2023. FHIP1A-DT is a potential novel diagnostic, prognostic, and therapeutic biomarker of colorectal cancer: A pan-cancer analysis. In Biochemical and biophysical research communications, 679, 191-204. doi:10.1016/j.bbrc.2023.08.059. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37703762/
2. Choudhury, Ananyo, Brandenburg, Jean-Tristan, Chikowore, Tinashe, Hazelhurst, Scott, Ramsay, Michèle. 2022. Meta-analysis of sub-Saharan African studies provides insights into genetic architecture of lipid traits. In Nature communications, 13, 2578. doi:10.1038/s41467-022-30098-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35546142/