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Gatb-KO 基因敲除小鼠

Gatb-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Gatb-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06249

品系全称

C57BL/6JCya-Gatbem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-229487-Gatb-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Gatb-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06249) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B
基因别称
9430026F02Rik，Pet112，Pet112l
染色体号
Chr 3 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_144896.4 | Ensembl: ENSMUST00000127348
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~6
敲除长度
~9606 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
GatB基因是一种编码谷氨酰-tRNA合成酶（GatA）的伴侣蛋白的基因。谷氨酰-tRNA合成酶负责将谷氨酸（Glu）转移到tRNA分子上，形成谷氨酰-tRNA（Glu-tRNA）。然而，在大多数细菌和古菌中，Glu-tRNA需要通过一个间接的转酰胺化途径转化为谷氨酰-tRNA（Gln-tRNA）。在这个过程中，GatB蛋白与GatA蛋白形成一个异源二聚体，催化Glu-tRNA转化为Gln-tRNA。这个反应对于细胞生长和代谢至关重要，因为谷氨酰-tRNA是蛋白质合成的关键组成部分。

GatB基因的研究主要集中在以下几个方面：

1. 在Wolbachia中，GatB基因被用于系统发育分析。通过分析Wolbachia的16S rDNA、gatB、hcpA和gltA基因序列，研究者发现Wolbachia在无性繁殖的oribatid螨Ceratozetes thienemanni中存在。GatB基因序列与其他Wolbachia基因序列的相似度很高（≥90%），表明这些基因在进化上密切相关。此外，研究者还在Wolbachia的16S rDNA中发现了独特的序列5'-GGGGTAATGGCC-3'，这可能在系统发育分析中具有重要作用[1]。

2. 在Mycoplasma hyopneumoniae中，GatB基因被用作内部参考基因，用于标准化逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）分析。研究者通过筛选13个候选内部参考基因，发现GatB基因在不同的生长阶段和毒力菌株中具有最高的表达稳定性。这表明GatB基因可以作为M. hyopneumoniae中RT-qPCR分析的可靠内部参考基因[2]。

3. 在疟原虫Plasmodium中，GatB基因与GatA基因共同构成了一个独特的异源二聚体谷氨酰-tRNA合成酶（GatAB）。GatAB催化Glu-tRNA转化为Gln-tRNA的过程对于疟原虫的血红蛋白阶段至关重要。此外，GatB基因的进化历史表明，GatAB的出现早于细菌和古菌的分离。这表明GatAB可能在早期生物进化中就已经存在，并在后来的生物体中发挥了重要作用[3]。

4. 在Bacillus siamensis 1021中，GatB_Yqey基因被用作内部参考基因，用于标准化RT-qPCR分析。研究者通过分析GatB_Yqey基因在不同培养基中的表达稳定性，发现GatB_Yqey基因与其他几个基因（如ssb、gyrA和gyrB）结合使用，可以提供更准确的基因表达分析结果。这表明GatB基因在B. siamensis 1021中也可以作为内部参考基因使用[4]。

5. 在Bacillus cereus组菌株中，GatB_Yqey基因被用作内部参考基因，用于标准化RT-qPCR分析。研究者通过分析GatB_Yqey基因在整个细菌生命周期中的表达稳定性，发现GatB_Yqey基因可以单独或与其他基因（如rpsU和udp）结合使用，提供可靠的基因表达分析结果。这表明GatB基因在B. cereus组菌株中也可以作为内部参考基因使用[5]。

6. 在Thrips palmi Karny中，GatB基因被用于检测Wolbachia的存在。研究者通过PCR扩增GatB基因和其他几个基因（如ftsZ和groEL），构建系统发育树，发现Thrips palmi Karny中存在Wolbachia B组菌株。这表明GatB基因可以用于检测Wolbachia的存在和分类[6]。

7. 在Escherichia coli K-12中，GatB基因编码的蛋白被证实具有多种翻译后修饰。通过二维凝胶电泳和Edman微测序，研究者发现GatB蛋白存在多种M(r)和pI异构体，表明GatB蛋白可能具有多种翻译后修饰。这表明GatB基因编码的蛋白在细胞内可能具有多种功能和调节机制[7]。

8. 在研究RNA修饰和翻译过程中，GatB基因也被发现具有重要的生物学功能。GatB基因编码的蛋白参与谷氨酰-tRNA的合成，而谷氨酰-tRNA是蛋白质合成的关键组成部分。此外，GatB基因编码的蛋白还可能参与其他生物学过程，如细胞分化、发育和代谢[8]。

9. 在研究脂质性状的遗传结构中，GATB基因区域被发现与低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）相关。通过Meta分析，研究者发现GATB/FHIP1A区域与LDL-C水平显著相关。这表明GATB基因可能在脂质代谢和胆固醇调节中发挥重要作用[9]。

综上所述，GatB基因在多种生物学过程中发挥着重要作用。GatB基因编码的蛋白参与谷氨酰-tRNA的合成，对细胞生长和代谢至关重要。此外，GatB基因还可能参与其他生物学过程，如细胞分化、发育、代谢和疾病发生。GatB基因的研究有助于深入理解谷氨酰-tRNA合成和RNA修饰的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Konecka, Edyta, Olszanowski, Ziemowit. 2019. Phylogenetic analysis based on the 16S rDNA, gltA, gatB, and hcpA gene sequences of Wolbachia from the novel host Ceratozetes thienemanni (Acari: Oribatida). In Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases, 70, 175-181. doi:10.1016/j.meegid.2019.01.032. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30708135/
2. Li, Shiyang, Zhou, Yanqing, Yuan, Ting, Yu, Yanfei, Yuan, Xiaomin. 2022. Selection of internal reference gene for normalization of reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction analysis in Mycoplasma hyopneumoniae. In Frontiers in veterinary science, 9, 934907. doi:10.3389/fvets.2022.934907. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35937288/
3. Mailu, Boniface M, Li, Ling, Arthur, Jen, Becker, Katja, Gardner, Malcolm J. 2015. Plasmodium Apicoplast Gln-tRNAGln Biosynthesis Utilizes a Unique GatAB Amidotransferase Essential for Erythrocytic Stage Parasites. In The Journal of biological chemistry, 290, 29629-41. doi:10.1074/jbc.M115.655100. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26318454/
4. Nuwong, Warinya, Kittiwongwattana, Chokchai. . Validation of reference genes for the normalization of RT-qPCR gene expression in Bacillus siamensis 1021 grown in different culture media. In Iranian journal of microbiology, 14, 194-202. doi:10.18502/ijm.v14i2.9188. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35765559/
5. Kimbrel, Nathan A, Ashley-Koch, Allison E, Qin, Xue J, Hauser, Elizabeth R, Hauser, Michael A. . Identification of Novel, Replicable Genetic Risk Loci for Suicidal Thoughts and Behaviors Among US Military Veterans. In JAMA psychiatry, 80, 135-145. doi:10.1001/jamapsychiatry.2022.3896. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36515925/
6. Reiter, Lillian, Kolstø, Anne-Brit, Piehler, Armin P. 2011. Reference genes for quantitative, reverse-transcription PCR in Bacillus cereus group strains throughout the bacterial life cycle. In Journal of microbiological methods, 86, 210-7. doi:10.1016/j.mimet.2011.05.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21620905/
7. Saurav, Gunjan Kumar, Daimei, Guisuibou, Rana, Vipin Singh, Popli, Sonam, Rajagopal, Raman. 2016. Detection and Localization of Wolbachia in Thrips palmi Karny (Thysanoptera: Thripidae). In Indian journal of microbiology, 56, 167-71. doi:10.1007/s12088-016-0567-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27570308/
8. Wasinger, V C, Humphery-Smith, I. . Small genes/gene-products in Escherichia coli K-12. In FEMS microbiology letters, 169, 375-82. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9868784/
9. Frechin, Mathieu, Duchêne, Anne-Marie, Becker, Hubert Dominique. 2009. Translating organellar glutamine codons: a case by case scenario? In RNA biology, 6, 31-4. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19106621/

资料下载

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