Npepl1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Npepl1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-06221

品系全称

C57BL/6JCya-Npepl1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-228961-Npepl1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Npepl1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-06221) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
aminopeptidase-like 1
基因别称
mKIAA1974
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_213733.2 | Ensembl: ENSMUST00000044415
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~2865 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
NPEPL1,全称为Nucleobindin Peptide-Like 1,是一种编码核结合蛋白样1的基因。NPEPL1属于核结合蛋白家族,该家族成员在细胞内运输和定位过程中发挥重要作用。NPEPL1在多种生物学过程中发挥关键作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。此外,NPEPL1还参与调节RNA的稳定性和功能,影响基因表达和生物学过程。

在前列腺癌中,NPEPL1的表达与患者复发风险相关。一项研究使用Robust Rank Aggregation (RRA) 方法分析了前列腺癌转录组数据,并确定了287个在局部去势抵抗性前列腺癌 (CRPC) 和激素敏感性前列腺癌 (HSPC) 之间差异表达的基因。进一步分析这些基因,开发了一个包含6个基因的预后特征,包括NPEPL1、VWF、LMO7、ALDH2、NUAK1和TPT1,命名为CRPC-derived prognosis signature (CRPCPS)。CRPCPS能够预测前列腺癌患者的无复发生存期,并且在多变量分析中预测了5/9个队列的RFS,并在肿瘤分期、Gleason评分和淋巴结状态分层患者中仍然有效。此外,CRPCPS还预测了总生存期和无转移生存期[1]。

在胃肠道间质瘤 (GIST) 中,NPEPL1与基因融合事件相关。一项研究对9个GIST的基因组和转录组进行了测序,并检测到306个体细胞变异和29个基因中的重复蛋白改变突变。转录组测序揭示了328个基因融合,其中最频繁的融合事件涉及IGF2与多个伙伴基因融合,包括CCND1、FUS和LASP1。此外,还发现了三个重复的通读融合转录本:POLA2-CDC42EP2、C8orf42-FBXO25和STX16-NPEPL1[2]。

在新生儿中,NPEPL1的表达与母体特应性相关。一项研究在母亲-儿童队列中进行了全表观基因组关联研究,以检查母体特应性与新生儿脐带血甲基化模式之间的关系。研究发现,83个差异甲基化位点与母体特应性相关。在这些位点中,有一些CpG位点映射到基因SCD、ITM2C、NT5C3A和NPEPL1。区域分析揭示了25个平铺区域、4个基因、3个CpG岛和5个基因启动子与母体特应性相关。基因内容分析揭示了与母体特应性相关的途径,包括嘌呤化合物代谢、有丝分裂细胞周期G1/S转换、干细胞分裂和细胞葡萄糖稳态[3]。

在肾透明细胞癌 (ccRCC) 中,NPEPL1的表达与患者的预后相关。一项研究调查了NPEPL1在ccRCC中的表达,并评估了其与临床病理特征和患者预后的相关性。研究发现,NPEPL1在ccRCC组织中显著高表达。NPEPL1的表达与临床病理参数密切相关,如T和M期。Kaplan-Meier分析显示,高NPEPL1表达与总生存期显著缩短相关。Cox回归分析表明,NPEPL1表达是预测总生存期的独立风险因素。Nomogram分析表明,NPEPL1表达在预测ccRCC患者的1年、3年和5年生存概率方面具有显著的临床价值。GO和KEGG富集分析表明,NPEPL1可能通过Ras信号通路等途径促进ccRCC的发生和发展[4]。

在乳腺癌细胞中,NPEPL1是miR-19a的直接靶基因。一项研究使用定量蛋白质组学方法鉴定了miR-19a在乳腺癌细胞中的直接靶基因。研究发现,在敲低内源性miR-19a、miR-20a和miR-92-1后,共有123个蛋白质显著增加,并通过二维电泳和质谱分析被鉴定为潜在的靶基因。在升高的蛋白质中,4个(PPP2R2A、ARHGAP1、IMPDH1和NPEPL1)被发现具有miR-19a或miR-20a结合位点。Western blot分析显示,在用anti-miR-19a处理后,IMPDH1和NPEPL1的表达水平增加,而PPP2R2A和ARHGAP1的表达水平没有改变[5]。

在ccRCC中,NPEPL1的表达与患者的预后和治疗敏感性相关。一项研究综合分析了转录组数据,并建立了NPEPL1的预后预测模型。研究发现,NPEPL1在ccRCC组织中上调表达,并且随着ccRCC的进展而逐渐增加。高NPEPL1表达与患者的预后不良相关。Cox回归分析表明,NPEPL1表达是ccRCC的独立风险因素。Nomogram分析表明,NPEPL1表达可以改善预测ccRCC患者预后的准确性。GO和KEGG富集分析表明,NPEPL1可能通过电压门控钙通道复合物、通道活性、cAMP信号通路和催产素信号通路参与ccRCC的发生和发展。此外,CIBERSORT分析显示,高NPEPL1表达与免疫微环境中调节性T细胞和滤泡辅助T细胞的富集相关。药物敏感性分析发现,高NPEPL1表达的患者可能从axitinib、顺铂和GSK429286A中获益更多[6]。

在假性甲状旁腺功能减退症 (PHP) 中,NPEPL1与STX16基因融合。一项研究报道了一个患有假性甲状旁腺功能减退症1B型 (AD-PHP1B) 的38岁男性患者的临床信息。通过甲基化特异性多重连接依赖性探针扩增 (MS-MLPA) 和全外显子测序 (WES) 分析,发现了一个跨越STX16和NPEPL1的87.5kb缺失,并伴随一个28bp的未知起源插入。这个新发现的缺失为AD-PHP1B的分子缺陷提供了新的信息[7]。

在结直肠癌 (CRC) 中,NPEPL1与免疫细胞浸润和预后相关。一项研究开发了一个基于蛋白质表达的预测模型,用于区分免疫细胞浸润的CRC肿瘤。研究发现,NPEPL1是8个基因预后风险模型中的一个,该模型在II期CRC患者中具有独立的预后价值。高NPEPL1表达与CRC患者的免疫细胞浸润增加相关[8]。

在结肠癌中,NPEPL1与预后相关。一项研究通过加权基因共表达网络分析和竞争性内源性RNA网络分析,建立了与CRC相关的ceRNA网络。研究发现,NPEPL1是ceRNA网络中的一个蛋白质编码基因,其表达与CRC患者的预后相关[9]。

综上所述,NPEPL1在多种疾病中发挥重要作用,包括前列腺癌、胃肠道间质瘤、新生儿特应性、肾透明细胞癌、乳腺癌和结直肠癌。NPEPL1的表达与患者的预后相关,并且在免疫细胞浸润和药物敏感性方面发挥重要作用。NPEPL1的研究有助于深入理解其在疾病发生和发展中的作用机制,为疾病的诊断、治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. A, Jun, Zhang, Baotong, Zhang, Zhiqian, Hu, Hailiang, Dong, Jin-Tang. 2021. Novel Gene Signatures Predictive of Patient Recurrence-Free Survival and Castration Resistance in Prostate Cancer. In Cancers, 13, . doi:10.3390/cancers13040917. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33671634/
2. Kang, Guhyun, Yun, Hongseok, Sun, Choong-Hyun, Kim, Kyoung-Mee, Sohn, Tae Sung. . Integrated genomic analyses identify frequent gene fusion events and VHL inactivation in gastrointestinal stromal tumors. In Oncotarget, 7, 6538-51. doi:10.18632/oncotarget.3731. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25987131/
3. Danielewicz, Hanna, Gurgul, Artur, Dębińska, Anna, Hirnle, Lidia, Boznański, Andrzej. 2020. Maternal atopy and offspring epigenome-wide methylation signature. In Epigenetics, 16, 629-641. doi:10.1080/15592294.2020.1814504. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32902349/
4. Dong, Haonan, He, Zexi, Wang, Haifeng, Hu, Chongzhi, Wang, Jiansong. . Identification of potential biomarkers for progression and prognosis of renal clear cell carcinoma by comprehensive bioinformatics analysis. In Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine, 32, 897-914. doi:10.3233/THC-230282. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37483037/
5. Ouchida, Mamoru, Kanzaki, Hirotaka, Ito, Sachio, Tamaru, Seiji, Shimizu, Kenji. 2012. Novel direct targets of miR-19a identified in breast cancer cells by a quantitative proteomic approach. In PloS one, 7, e44095. doi:10.1371/journal.pone.0044095. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22952885/
6. Wei, Xiaoyu, Zhou, Zhongbao, Ma, Guikai, Sun, Fengze. 2023. Comprehensive Analysis of Transcriptomic Profiles Identified the Prediction of Prognosis and Drug Sensitivity of Aminopeptidase-Like 1 (NPEPL1) for Clear Cell Renal Cell Carcinoma. In Journal of oncology, 2023, 4732242. doi:10.1155/2023/4732242. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36816355/
7. Yang, Yi, Chu, Xueying, Nie, Min, Xing, Xiaoping, Wang, Ou. 2020. A novel long-range deletion spanning STX16 and NPEPL1 causing imprinting defects of the GNAS locus discovered in a patient with autosomal-dominant pseudohypoparathyroidism type 1B. In Endocrine, 69, 212-219. doi:10.1007/s12020-020-02304-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32337648/
8. Li, Lifang, Ruan, Jingxiong, Ma, Yanfen, Tian, Xudong, Hu, Jian. 2023. Identification of key modules and micro RNAs associated with colorectal cancer via a weighted gene co-expression network analysis and competing endogenous RNA network analysis. In Journal of gastrointestinal oncology, 14, 1320-1330. doi:10.21037/jgo-23-244. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37435199/
9. Zhou, Ming, Ge, Xiaoxu, Xu, Xiaoming, Xu, Kailun, Wang, Jian. 2024. A hot and cold tumor‑related prognostic signature for stage II colorectal cancer. In Oncology letters, 28, 419. doi:10.3892/ol.2024.14552. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39006949/