Rab29-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Rab29-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-05976

品系全称

C57BL/6JCya-Rab29em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-226422-Rab29-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rab29-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-05976) were purchased from Cyagen.
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RAB29, member RAS oncogene family
基因别称
Rab7l1
染色体号
Chr 1 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_144875 | Ensembl: ENSMUST00000027693
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~6
敲除长度
~5.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2385107Homozygous null mice show enlarged lysosomes in the kidneys and less efficient cycling of the cargo protein CI-M6PR at the trans-Golgi network resulting in trafficking defects and mis-sorting of lysosomal enzymes.
Rab29,也称为Ras相关的GTP结合蛋白29,是一种Rab GTPase家族成员,参与细胞内囊泡转运和膜运输过程。Rab29在多种细胞功能中发挥重要作用,包括内吞作用、分泌作用、溶酶体运输和自噬等。Rab29的表达和活性在多种细胞类型中有所差异,但在神经元和胶质细胞中表达较高。

研究表明,Rab29与帕金森病(PD)的发生和发展密切相关。PD是一种常见的神经退行性疾病,其病理特征包括多巴胺能神经元丧失、路易小体形成和细胞内蛋白质聚集等。遗传研究表明,Rab29基因位于PD相关基因座PARK16区域,提示其在PD发病机制中可能具有重要作用。

一项整合全基因组关联研究(GWAS)、表达数据和表观遗传数据的研究发现,Rab29的表达水平与PD风险相关。此外,Rab29的表达在胶质细胞中更为普遍,提示其在PD的胶质细胞功能障碍中可能发挥关键作用[1]。另一项研究发现,Rab29可以募集LRRK2至高尔基体,并显著刺激其激酶活性。这些发现表明,Rab29是LRRK2激活的重要调节因子,控制其激活、定位和潜在的生物标志物磷酸化[3]。

然而,也有研究表明,内源性的Rab29对LRRK2的活性没有影响。例如,一项研究发现,敲除Rab29并不会影响内源性LRRK2的活性,包括Rab10和Rab12的磷酸化。此外,在LRRK2基因敲除小鼠中过表达Rab29也不能刺激基础LRRK2的活性[2]。这些发现表明,Rab29可能不是LRRK2活性调节的主要因素。

进一步的研究发现,Rab29在LRRK2介导的内溶酶体转运改变中发挥重要作用。LRRK2突变会导致G2019S突变,进而影响内溶酶体转运。研究发现,G2019S LRRK2介导的EGFR转运缺陷可以通过过表达活性RAB10来挽救,而RAB29敲低则没有效果。这表明,RAB10和RAB29在内溶酶体转运中具有不同的作用[4]。

此外,Rab29还与LRRK2的膜募集和底物Rab磷酸化有关。一项研究发现,Rab38是LRRK2在黑色素细胞中的新型生理调节因子。在黑色素细胞中,Rab38的敲低或CRISPR敲除会降低LRRK2底物Rab10和Rab12的磷酸化水平。此外,Rab38的敲低或突变会抑制LRRK2的膜结合和过表达激活性LRRK2的细胞质心周募集。这些发现表明,Rab38是LRRK2功能的生理调节因子,并且支持LRRK2在Rab GTPase协调囊泡转运中发挥核心作用的模型[5]。

总之,Rab29在帕金森病的发生和发展中发挥着重要作用。Rab29的表达和活性与PD风险相关,并且在LRRK2介导的内溶酶体转运、膜募集和底物Rab磷酸化中发挥关键作用。然而,Rab29可能不是LRRK2活性调节的主要因素。进一步的研究有助于深入理解Rab29在PD发病机制中的作用,为PD的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Kia, Demis A, Zhang, David, Guelfi, Sebastian, Hardy, John, Wood, Nicholas W. . Identification of Candidate Parkinson Disease Genes by Integrating Genome-Wide Association Study, Expression, and Epigenetic Data Sets. In JAMA neurology, 78, 464-472. doi:10.1001/jamaneurol.2020.5257. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33523105/
2. Kalogeropulou, Alexia F, Freemantle, Jordana B, Lis, Pawel, Polinski, Nicole K, Alessi, Dario R. . Endogenous Rab29 does not impact basal or stimulated LRRK2 pathway activity. In The Biochemical journal, 477, 4397-4423. doi:10.1042/BCJ20200458. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33135724/
3. Purlyte, Elena, Dhekne, Herschel S, Sarhan, Adil R, Pfeffer, Suzanne R, Alessi, Dario R. 2017. Rab29 activation of the Parkinson's disease-associated LRRK2 kinase. In The EMBO journal, 37, 1-18. doi:10.15252/embj.201798099. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29212815/
4. Rivero-Ríos, Pilar, Romo-Lozano, Maria, Fernández, Belén, Fdez, Elena, Hilfiker, Sabine. 2020. Distinct Roles for RAB10 and RAB29 in Pathogenic LRRK2-Mediated Endolysosomal Trafficking Alterations. In Cells, 9, . doi:10.3390/cells9071719. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32709066/
5. Unapanta, Alexandra, Shavarebi, Farbod, Porath, Jacob, Di Pietro, Santiago M, Hiniker, Annie. 2023. Endogenous Rab38 regulates LRRK2's membrane recruitment and substrate Rab phosphorylation in melanocytes. In The Journal of biological chemistry, 299, 105192. doi:10.1016/j.jbc.2023.105192. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37625589/