Smc5-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Smc5-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-05927

品系全称

C57BL/6JCya-Smc5em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-226026-Smc5-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Smc5-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-05927) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
structural maintenance of chromosomes 5
基因别称
MLZ-453,SMC-5,Smc5l1,mKIAA0594,mSMC5
染色体号
Chr 19 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001252684.1 | Ensembl: ENSMUST00000087556
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~6
敲除长度
~9222 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2385088Homozygous knockout in embryonic stem cells causes abnormal mitosis, increased apoptosis and a shift from pluripotency to differentiation.
SMC5,即结构维持染色体蛋白5,是结构维持染色体(SMC)蛋白家族的一员。SMC蛋白家族在细胞内负责维持染色体的结构稳定,确保染色体在细胞分裂过程中正确分配。SMC5与SMC6结合形成SMC5/6复合物,这个复合物在真核生物中具有多种生物学功能。

首先,SMC5/6复合物在DNA复制过程中发挥着重要作用。它能够稳定复制叉(RF)在遇到障碍物时的停滞状态,阻止复制叉的回缩,并参与重新启动已崩溃的复制叉,以及缓冲复制叉在前进过程中遇到的空间结构约束[1]。SMC5/6复合物在DNA复制过程中的这些功能对于维持基因组稳定性至关重要。

其次,SMC5/6复合物在DNA修复过程中也发挥着重要作用。它在基因组稳定性方面具有长期确立的功能,包括在DNA修复中的多重角色,以及在转录抑制乙型肝炎病毒(HBV)基因组中的新近发现的作用[2]。例如,SMC5/6复合物可以通过SUMO化修饰来刺激DNA-蛋白交联(DPCs)的修复,DPCs是一种高度有毒的DNA损伤,会物理性地阻塞DNA复制和转录[8]。

此外,SMC5/6复合物与SAGA组蛋白乙酰转移酶模块之间存在遗传和物理上的相互作用。SAGA模块负责将SMC5/6复合物靶向到特定的基因区域,并促进其与这些区域的结合[3]。SMC5/6复合物在特定基因区域的积累对于维持基因组的稳定性和动态平衡至关重要。

SMC5/6复合物还与病毒感染密切相关。例如,HBV的X蛋白(HBx)可以靶向SMC5/6复合物,通过泛素蛋白酶体途径使其降解,从而解除HBV基因组转录的抑制[4,5]。此外,HIV-1的Vpr蛋白可以拮抗SMC5/6复合物,导致未整合的HIV-1 DNA表达增强[6]。

SMC5/6复合物还参与R-loop结构的清除。R-loop是一种由RNA-DNA双链和一条位移的基因组DNA组成的转录副产物。研究表明,SMC5/6复合物在去除高度转录基因和端粒处形成的R-loop结构中发挥着重要作用[7]。

综上所述,SMC5/6复合物在维持基因组稳定性、DNA修复、病毒感染和R-loop清除等方面发挥着重要作用。SMC5/6复合物的研究不仅有助于深入理解染色体的结构和功能,还为疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Palecek, Jan J. 2018. SMC5/6: Multifunctional Player in Replication. In Genes, 10, . doi:10.3390/genes10010007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30583551/
2. Aragón, Luis. . The Smc5/6 Complex: New and Old Functions of the Enigmatic Long-Distance Relative. In Annual review of genetics, 52, 89-107. doi:10.1146/annurev-genet-120417-031353. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30476445/
3. Mahrik, L, Stefanovie, B, Maresova, A, Prevorovsky, M, Palecek, J J. 2023. The SAGA histone acetyltransferase module targets SMC5/6 to specific genes. In Epigenetics & chromatin, 16, 6. doi:10.1186/s13072-023-00480-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36793083/
4. Bächer, Johannes, Allweiss, Lena, Dandri, Maura. 2024. SMC5/6-Mediated Transcriptional Regulation of Hepatitis B Virus and Its Therapeutic Potential. In Viruses, 16, . doi:10.3390/v16111667. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39599784/
5. Livingston, Christine M, Ramakrishnan, Dhivya, Strubin, Michel, Fletcher, Simon P, Beran, Rudolf K. 2017. Identifying and Characterizing Interplay between Hepatitis B Virus X Protein and Smc5/6. In Viruses, 9, . doi:10.3390/v9040069. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28368357/
6. Dupont, Liane, Bloor, Stuart, Williamson, James C, Matheson, Nicholas J, Lehner, Paul J. 2021. The SMC5/6 complex compacts and silences unintegrated HIV-1 DNA and is antagonized by Vpr. In Cell host & microbe, 29, 792-805.e6. doi:10.1016/j.chom.2021.03.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33811831/
7. Roy, Shamayita, Adhikary, Hemanta, Isler, Sarah, D'Amours, Damien. 2024. The Smc5/6 complex counteracts R-loop formation at highly transcribed genes in cooperation with RNase H2. In eLife, 13, . doi:10.7554/eLife.96626. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39404251/
8. Dvořák Tomaštíková, Eva, Prochazkova, Klara, Yang, Fen, Puchta, Holger, Pecinka, Ales. . SMC5/6 complex-mediated SUMOylation stimulates DNA-protein cross-link repair in Arabidopsis. In The Plant cell, 35, 1532-1547. doi:10.1093/plcell/koad020. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36705512/