SPATA13,也称为Spermatogenesis Associated Protein 13或Adenomatous polyposis coli-stimulated guanine nucleotide exchange factor 2 (ASEF2),是一个在多种生物学过程中发挥重要作用的基因。SPATA13编码的蛋白质是一种1277个氨基酸残基的蛋白,定位于细胞核,与核斑点和中心粒相关蛋白共定位。研究表明,SPATA13在调节有丝分裂和维持组织稳态中发挥重要作用。
SPATA13基因的突变与多种疾病相关。例如,研究发现SPATA13基因的突变是导致原发性闭角型青光眼(PACG)的原因之一[4]。PACG是一种常见的致盲性眼病,SPATA13的突变导致其编码的蛋白质活性异常,进而影响细胞有丝分裂和组织的稳态,最终导致PACG的发生。
此外,SPATA13基因的表达与多种疾病的发生发展密切相关。研究表明,SPATA13基因的表达在乳腺癌、肾细胞癌和胃癌等多种癌症中均有异常[5][6][7]。例如,SPATA13基因的表达与乳腺癌患者的预后相关,其高表达与不良预后相关[3]。在肾细胞癌中,SPATA13基因的表达与患者的生存期相关,其低表达与不良预后相关[6]。在胃癌中,SPATA13基因的表达与患者的预后相关,其高表达与不良预后相关[7]。
除了与癌症相关,SPATA13基因的表达还与一些其他疾病相关。例如,SPATA13基因的表达与哮喘患者对吸入性短效β2受体激动剂(SABA)的反应相关[2]。研究发现,SPATA13基因的某些变异与哮喘患者对SABA的反应相关,提示SPATA13基因可能参与了哮喘的治疗过程。
除了与疾病相关,SPATA13基因的表达还与一些生物学过程相关。例如,SPATA13基因的表达与细胞-基质功能相关[5]。研究发现,SPATA13基因的表达与细胞-基质功能相关,提示SPATA13基因可能参与了细胞-基质相互作用的过程。
此外,SPATA13基因的表达还与胎盘基因组的调节相关[1]。研究发现,SPATA13基因的表达与胎盘基因组的调节相关,提示SPATA13基因可能参与了发育编程和生命过程中的健康影响。
综上所述,SPATA13基因是一个在多种生物学过程中发挥重要作用的基因,其突变和表达异常与多种疾病相关,包括PACG、乳腺癌、肾细胞癌、胃癌和哮喘等。此外,SPATA13基因的表达还与一些生物学过程相关,包括细胞-基质功能和胎盘基因组的调节。深入研究SPATA13基因的功能和机制,有助于我们更好地理解疾病的发生发展,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
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2. Padhukasahasram, B, Yang, J J, Levin, A M, Lanfear, D E, Williams, L K. 2014. Gene-based association identifies SPATA13-AS1 as a pharmacogenomic predictor of inhaled short-acting beta-agonist response in multiple population groups. In The pharmacogenomics journal, 14, 365-71. doi:10.1038/tpj.2013.49. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24418963/
3. Middha, Pooja, Wang, Xiaoliang, Behrens, Sabine, Easton, Douglas F, Chang-Claude, Jenny. 2023. A genome-wide gene-environment interaction study of breast cancer risk for women of European ancestry. In Breast cancer research : BCR, 25, 93. doi:10.1186/s13058-023-01691-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37559094/
4. Waseem, Naushin H, Low, Sancy, Shah, Amna Z, Waseem, Ahmad, Foster, Paul J. 2020. Mutations in SPATA13/ASEF2 cause primary angle closure glaucoma. In PLoS genetics, 16, e1008721. doi:10.1371/journal.pgen.1008721. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32339198/
5. Hu, Yongli, Du, Yan, Qiu, Zhisheng, Liang, Tong, Da, Mingxu. 2023. Construction of a Cuproptosis-Related Gene Signature for Predicting Prognosis in Gastric Cancer. In Biochemical genetics, 62, 40-58. doi:10.1007/s10528-023-10406-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37243753/
6. Hwang, Jia, Bang, Seokhwan, Choi, Moon Hyung, Park, Un Sang, Choi, Yeong Jin. 2024. Discovery and Validation of Survival-Specific Genes in Papillary Renal Cell Carcinoma Using a Customized Next-Generation Sequencing Gene Panel. In Cancers, 16, . doi:10.3390/cancers16112006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38893126/
7. Bhattacharya, Arjun, Freedman, Anastasia N, Avula, Vennela, Fry, Rebecca C, Santos, Hudson P. 2022. Placental genomics mediates genetic associations with complex health traits and disease. In Nature communications, 13, 706. doi:10.1038/s41467-022-28365-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35121757/