Srek1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Srek1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-05433

品系全称

C57BL/6JCya-Srek1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-218543-Srek1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Srek1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-05433) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1
基因别称
8430401B01,SRrp508,SRrp86,Sfrs12,Srsf12
染色体号
Chr 13 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001361085.1 | Ensembl: ENSMUST00000074616
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~4
敲除长度
~8421 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
SREK1,全称为Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1,是一种属于SR蛋白超家族的RNA结合蛋白,参与调控RNA的剪接和修饰。SREK1在多种生物过程中发挥重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。本文将根据参考文献内容,对SREK1的功能和作用进行综述。

SREK1基因的SNP位点rs74794265与慢性阻塞性肺病(COPD)的易感性相关。研究发现,在新疆喀什地区,COPD患者中C/T基因型的频率显著低于对照组,且非吸烟COPD患者的C/T基因型频率显著低于其他COPD患者。这表明rs74794265位点的C/T基因型可能是COPD的保护因素,且该地区COPD的发生可能更与沙漠气候条件和遗传因素相关,而非吸烟状态[1]。

SREK1基因在人类肝细胞癌(HCC)中异常上调,可能作为一种致癌驱动因子。研究发现,HCC患者中SREK1基因的剪接变体SREK1L表达水平较高,且SREK1L能够维持BLOC1S5-TXNDC5(B-T)的表达。B-T通过抑制miR-30c-5p和miR-30e-5p的表达,进一步促进下游致癌基因SRSF10和TXNDC5的表达。SRSF10又能作为SREK1L的剪接调节因子,促进HCC的发生[2]。

在亨廷顿病(HD)中,SREK1表达水平降低,可能导致TAF1表达降低,进而影响HD的病理发生。研究发现,在HD患者和转基因小鼠的纹状体中,SREK1和TAF1的表达水平均降低。而SREK1过表达的转基因小鼠能够纠正TAF1的缺乏,减轻HD小鼠的纹状体萎缩和运动症状。这表明SREK1在HD的病理发生中发挥重要作用,且TAF1可能是HD发病机制的关键因素[3]。

SREK1基因在COPD和肺癌中均表现出差异表达。研究发现,COPD患者和肺癌患者中SREK1基因的表达水平均显著高于对照组。这表明SREK1基因可能作为COPD和肺癌的潜在遗传标志物[4]。

CXIP4是植物中与SREK1相关的蛋白质,参与调控RNA的剪接和修饰。研究发现,CXIP4的缺失会导致植物早期死亡和pre-mRNA剪接异常。CXIP4突变体表现出防御基因的失调和转录因子编码基因的上调,且表现出内含子保留事件的增加。CXIP4蛋白定位于细胞核,与剪接因子丰富的核斑点相似。这表明CXIP4在植物发育和生存,以及mRNA成熟中发挥重要作用[5][6]。

SRrp86是SR蛋白超家族中的一种独特成员,含有两个SR富集区域和一个独特的谷氨酸-赖氨酸(EK)富集区域。研究发现,SRrp86能够通过激活和抑制其他SR蛋白的活性来调控选择性剪接。SRrp86的EK区域可以抑制剪接和剪接位点的选择。这表明SRrp86在选择性剪接中发挥重要作用,并通过其独特的EK区域来调节其活性[7][8]。

综上所述,SREK1是一种重要的RNA结合蛋白,参与调控RNA的剪接和修饰。SREK1在多种疾病中发挥重要作用,包括COPD、HCC和HD。此外,SREK1还与植物的发育和生存有关。SRrp86是SREK1相关的蛋白质,在选择性剪接中发挥重要作用。SREK1的研究有助于深入理解RNA剪接和修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Abudureheman, Zulipikaer, Li, Li, Zhong, XueMei, Xu, AiMin, Zou, XiaoGuang. 2021. The rs74794265 SNP of the SREK1 Gene is Associated with COPD in Kashi, China. In International journal of chronic obstructive pulmonary disease, 16, 2631-2636. doi:10.2147/COPD.S321150. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34556983/
2. Chang, Cunjie, Rajasekaran, Muthukumar, Qiao, Yiting, Hui, Kam Man, Chen, Jianxiang. 2022. The aberrant upregulation of exon 10-inclusive SREK1 through SRSF10 acts as an oncogenic driver in human hepatocellular carcinoma. In Nature communications, 13, 1363. doi:10.1038/s41467-022-29016-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35296659/
3. Hernández, Ivó H, Cabrera, Jorge R, Santos-Galindo, María, Pintado, Belén, Lucas, José J. . Pathogenic SREK1 decrease in Huntington's disease lowers TAF1 mimicking X-linked dystonia parkinsonism. In Brain : a journal of neurology, 143, 2207-2219. doi:10.1093/brain/awaa150. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32533168/
4. Banaganapalli, Babajan, Mallah, Bayan, Alghamdi, Kawthar Saad, Elango, Ramu, Shaik, Noor A. 2022. Integrative weighted molecular network construction from transcriptomics and genome wide association data to identify shared genetic biomarkers for COPD and lung cancer. In PloS one, 17, e0274629. doi:10.1371/journal.pone.0274629. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36194576/
5. Aceituno-Valenzuela, Uri, Fontcuberta-Cervera, Sara, Micol-Ponce, Rosa, Ruiz-Bayón, Alejandro, Ponce, María Rosa. . CAX-INTERACTING PROTEIN4 depletion causes early lethality and pre-mRNA missplicing in Arabidopsis. In Plant physiology, 197, . doi:10.1093/plphys/kiae641. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39657023/
6. Aceituno-Valenzuela, Uri Israel, Fontcuberta-Cervera, Sara, Micol-Ponce, Rosa, Ruiz-Bayón, Alejandro, Ponce, María Rosa. 2024. CXIP4 depletion causes early lethality and pre-mRNA missplicing in Arabidopsis. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.06.06.597795. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38915646/
7. Li, Jun, Barnard, Daron C, Patton, James G. 2002. A unique glutamic acid-lysine (EK) domain acts as a splicing inhibitor. In The Journal of biological chemistry, 277, 39485-92. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12183448/
8. Barnard, Daron C, Li, Jun, Peng, Rui, Patton, James G. . Regulation of alternative splicing by SRrp86 through coactivation and repression of specific SR proteins. In RNA (New York, N.Y.), 8, 526-33. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11991645/