Heatr6-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Heatr6-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-05242

品系全称

C57BL/6JCya-Heatr6em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-217026-Heatr6-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Heatr6-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-05242) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
HEAT repeat containing 6
基因别称
2700008B19Rik
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_145432.3 | Ensembl: ENSMUST00000001002
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~8
敲除长度
~8851 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
HEATR6,全称HEAT repeat containing 6,是一种包含HEAT重复序列的蛋白质,HEAT重复是一种蛋白质结构域,常见于多种蛋白质中,包括一些与DNA复制、修复和转录有关的蛋白质。HEATR6在细胞内的确切功能和机制尚未完全明确,但已有的研究揭示了它在一些生物学过程中的潜在作用。

在非模式物种的研究中,RNA测序已经成为一种常用的方法,它不仅可以用于基因表达分析,还可以用于分析可变剪接、种群结构和选择信号。例如,一项研究比较了两种数据集:一个来自微卫星的数据集,显示了种群结构;另一个来自全转录组测序的数据集,记录了两种鲦鱼种群在盐度挑战后的mRNA表达情况。研究结果表明,mRNA测序揭示的种群结构模式与微卫星数据一致,但基因变异和种群分化的程度较低,这与使用mRNA时预期的广泛净化选择一致[1]。此外,在个体基因水平上,研究发现HEATR6等基因在表型可塑性和选择信号之间存在相互排斥的关系,这表明HEATR6可能在表型可塑性和进化中扮演重要角色[1]。

在人类乳腺癌的研究中,长链非编码RNA(lncRNA)因其组织特异性表达和细胞癌化功能而备受关注。一项研究通过分析lncRNA与乳腺癌相关基因(BCAGs)的表达模式,发现HEATR6与一个名为LOC105371849的lncRNA存在关联。实验表明,通过siRNA敲低LOC105371849可以降低MCF7人乳腺癌细胞系中HEATR6 mRNA的表达,这表明HEATR6可能在乳腺癌的发生和发展中发挥作用[2]。

在癌症细胞系的研究中,通过对1018个癌症细胞系的基因组芯片数据进行混合分析,研究者计算了这些细胞系的遗传起源估计。研究发现,HEATR6的表达水平与细胞系的遗传起源相关,这表明HEATR6可能在不同的遗传背景下具有不同的表达模式[3]。

在子宫内膜癌的研究中,研究者分析了黑人患者和白色患者子宫内膜癌样本的蛋白质组和转录组。研究发现,HEATR6的表达水平在黑人患者中显著升高,并与黑人患者的无病生存期相关。这表明HEATR6可能在黑人子宫内膜癌患者的疾病进展中发挥作用[4]。

综上所述,HEATR6在多种生物学过程中具有潜在的作用,包括种群结构、表型可塑性、癌症发生和发展等。HEATR6的表达可能受到遗传背景的影响,并在不同的遗传背景下具有不同的表达模式。此外,HEATR6的表达水平与某些癌症患者的预后相关,这表明HEATR6可能是一个有潜力的癌症治疗靶点。然而,关于HEATR6的确切功能和机制仍需要进一步的研究。

参考文献:
1. Thorstensen, Matt J, Baerwald, Melinda R, Jeffries, Ken M. 2021. RNA sequencing describes both population structure and plasticity-selection dynamics in a non-model fish. In BMC genomics, 22, 273. doi:10.1186/s12864-021-07592-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33858341/
2. Shin, Tae-Jin, Lee, Kang-Hoon, Cho, Hyun-Min, Cho, Je-Yoel. 2019. Concise approach for screening long non-coding RNAs functionally linked to human breast cancer associated genes. In Experimental and molecular pathology, 108, 89-96. doi:10.1016/j.yexmp.2019.04.003. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30953646/
3. Kessler, Michael D, Bateman, Nicholas W, Conrads, Thomas P, Dunning Hotopp, Julie C, O'Connor, Timothy D. 2019. Ancestral characterization of 1018 cancer cell lines highlights disparities and reveals gene expression and mutational differences. In Cancer, 125, 2076-2088. doi:10.1002/cncr.32020. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30865299/
4. Bateman, Nicholas W, Dubil, Elizabeth A, Wang, Guisong, Conrads, Thomas P, Maxwell, G Larry. 2017. Race-specific molecular alterations correlate with differential outcomes for black and white endometrioid endometrial cancer patients. In Cancer, 123, 4004-4012. doi:10.1002/cncr.30813. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28654152/