Trappc10-KO 基因敲除小鼠

下单100%中奖,最高可得千元京东卡
复苏/繁育服务
产品名称

Trappc10-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-05135

品系全称

C57BL/6JCya-Trappc10em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-216131-Trappc10-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Trappc10-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-05135) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
trafficking protein particle complex 10
基因别称
B230307C21Rik,Gm870,Tmem1,b2b2416Clo,b2b2613Clo
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001081055.2 | Ensembl: ENSMUST00000000384
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~4
敲除长度
~8872 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1336209Mice homozygous for ENU-induced mutations exhibit cardiovascular phenotypes, including atrioventricular or ventricular septal defects, thymus hypoplasia, and eye defects such as microphthalmia or anophthalmia. Holoprosencephaly, anencephaly and severe craniofacial defects may be also present.
TRAPPC10,也称为TRAPPC10,是一种重要的运输蛋白颗粒(TRAPP)复合物II的组成部分。TRAPP复合物在亚细胞转运途径中发挥基础性作用,参与囊泡运输和细胞器之间的物质交换。TRAPPC10基因突变会导致严重的微头症神经发育障碍,这种障碍在人类和老鼠中都已被观察到。患者淋巴细胞中的研究表明,TRAPPC10的缺失会导致TRAPPC9的缺失,而TRAPPC9是另一个关键的TRAPP II复合物成分,与临床上有重叠的神经发育障碍相关。在TRAPPC10-/-敲除细胞中,TRAPPC9/10的减少表型得到了重现,这些细胞还表现出膜转运缺陷。研究还表明,在老鼠中,Trappc10-/-敲除会导致神经解剖缺陷和微头症,与人类疾病中观察到的发现以及在Trappc9-/-老鼠模型中观察到的发现相一致。这些研究证实了常染色体隐性TRAPPC10变异是人类疾病的原因,并定义了TRAPP介导的病理分子结果,这对人类和老鼠中TRAPPC9和TRAPPC10介导的神经发育障碍具有重要意义[1]。

TRAPP复合物在细胞内的运输和细胞组织中扮演着关键角色。它们在囊泡运输中的作用,尤其是在分泌途径中的参与,使它们在神经发育机制中更为重要。在一项针对一个来自伊朗的近亲家庭的病例研究中,研究人员发现了一种新的双等位基因变异,与发育迟缓和智力障碍相关。患者表现出严重的发育迟缓、微头症和行为异常。通过全外显子测序分析,研究人员发现了一种新的双等位基因变异:TRAPPC10(NM_003274.5):c.3222C>A;p.(Cys1074Ter),这种变异可能导致蛋白质翻译的过早终止,并由于双等位基因丢失功能性TRAPPC10蛋白而引起无义介导的降解,从而导致严重的发育迟缓、微头症和行为异常,如攻击性和自闭症特征。这项研究的目的是发现TRAPPC10基因中的一种新变异,这种变异是导致特定神经发育障碍的原因,这种障碍主要由发育迟缓、智力障碍和微头症主导。这些发现加深了对TRAPP相关疾病理解,并强调了进一步探索TRAPPC10对神经系统发育影响的重要性[2]。

在乳腺癌中,TRAPPC10基因的表达水平与肿瘤的侵袭性和预后相关。一项研究利用多组学方法,包括基因表达、DNA甲基化和拷贝数改变,来探索乳腺癌中的自噬调节因子。研究发现,TRAPPC10是潜在的乳腺癌自噬调节因子,并可能成为新的药物靶点。此外,TRAPPC10的表达水平与乳腺癌患者的生存率相关,表明TRAPPC10在乳腺癌的发生和发展中发挥着重要作用[3]。

在另一项研究中,研究人员通过外显子测序分析了22个来自巴基斯坦的近亲家庭,这些家庭患有常染色体隐性智力障碍(ARID),其中21个家庭还有其他表型,包括微头症。研究人员在七个ARID家庭中发现了新的基因变异,包括TRAPPC10,这些基因变异与智力障碍有关。这项研究为理解人类大脑功能和发育提供了新的知识基础[4]。

另一项研究利用下一代测序和基因芯片数据,对6697名乳腺癌患者进行了全基因组分析。研究发现,TRAPPC10是乳腺癌中驱动致癌基因之一,其突变频率超过5%。此外,TRAPPC10的突变与乳腺癌患者的临床结果相关,表明TRAPPC10在乳腺癌的发生和发展中起着重要作用[5]。

在一项关于喉鳞状细胞癌(LSCC)的研究中,研究人员构建了一个长链非编码RNA(lncRNA)-miRNA-mRNA竞争性内源RNA(ceRNA)网络,以揭示LSCC的发生和预后。研究发现,TRAPPC10与lncRNA TMEM51-AS1和miR-106b相互作用,并可能作为LSCC的预后生物标志物[6]。

在一项关于TRAPPII的研究中,研究人员发现TRAPPII是Rab18和Rab1的鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)。TRAPPII的失活会导致脂解减少,并导致异常大的脂滴。研究人员还发现,TRAPPII与COPI的相互作用对于Rab18在脂滴上的募集也是必需的。这项研究揭示了TRAPPII在脂滴稳态中的作用,并为TRAPP复合物在细胞器运输和功能中的重要性提供了新的见解[7]。

在一项关于TRAPPC2L的研究中,研究人员发现TRAPPC2L的双等位基因突变会导致神经发育障碍,并对成纤维细胞中的RAB11产生影响。TRAPPC2L是一种TRAPP复合物的成分,参与膜运输和自噬。研究人员发现,患者成纤维细胞中的TRAPPC2L突变导致其与TRAPPC10/Trs130的相互作用丧失,并导致特定的膜转运延迟。这项研究表明,TRAPPC2L突变与RAB11途径相关,并对其他TRAPP相关疾病有重要意义[8]。

综上所述,TRAPPC10是一种重要的TRAPP复合物II的组成部分,参与亚细胞转运途径。TRAPPC10基因突变会导致严重的微头症神经发育障碍,并与其他疾病,如乳腺癌和喉鳞状细胞癌相关。TRAPPC10的研究有助于深入理解TRAPP复合物在细胞内运输和细胞器功能中的作用,并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Rawlins, Lettie E, Almousa, Hashem, Khan, Shazia, Sacher, Michael, Baple, Emma L. 2022. Biallelic variants in TRAPPC10 cause a microcephalic TRAPPopathy disorder in humans and mice. In PLoS genetics, 18, e1010114. doi:10.1371/journal.pgen.1010114. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35298461/
2. Nozari, Ahoura, Babaahmadi, Paria, Jalilian, Narges, Sadeghi, Taha, Hasani, Mahdieh. 2024. Introducing a novel TRAPPC10 gene variant as a potential cause of developmental delay and intellectual disability in an Iranian family. In Neurogenetics, 26, 1. doi:10.1007/s10048-024-00785-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39560797/
3. Zhang, Shouyue, Zhang, Jin, An, Yang, Xu, Heng, Liu, Bo. 2020. Multi-omics approaches identify SF3B3 and SIRT3 as candidate autophagic regulators and druggable targets in invasive breast carcinoma. In Acta pharmaceutica Sinica. B, 11, 1227-1245. doi:10.1016/j.apsb.2020.12.013. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34094830/
4. Santos-Cortez, Regie Lyn P, Khan, Valeed, Khan, Falak Sher, Ansar, Muhammad, Leal, Suzanne M. 2018. Novel candidate genes and variants underlying autosomal recessive neurodevelopmental disorders with intellectual disability. In Human genetics, 137, 735-752. doi:10.1007/s00439-018-1928-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30167849/
5. Pongor, Lőrinc, Kormos, Máté, Hatzis, Christos, Szabó, András, Győrffy, Balázs. 2015. A genome-wide approach to link genotype to clinical outcome by utilizing next generation sequencing and gene chip data of 6,697 breast cancer patients. In Genome medicine, 7, 104. doi:10.1186/s13073-015-0228-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26474971/
6. Hui, Lian, Wang, Jing, Zhang, Jialiang, Long, Jin. 2019. lncRNA TMEM51-AS1 and RUSC1-AS1 function as ceRNAs for induction of laryngeal squamous cell carcinoma and prediction of prognosis. In PeerJ, 7, e7456. doi:10.7717/peerj.7456. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31565549/
7. Nagamine, K, Kudoh, J, Kawasaki, K, Ito, F, Shimizu, N. . Genomic organization and complete nucleotide sequence of the TMEM1 gene on human chromosome 21q22.3. In Biochemical and biophysical research communications, 235, 185-90. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9196060/
8. Li, Chunman, Luo, Xiaomin, Zhao, Shan, Satoh, Ayano, Yu, Sidney Sb. 2016. COPI-TRAPPII activates Rab18 and regulates its lipid droplet association. In The EMBO journal, 36, 441-457. doi:10.15252/embj.201694866. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28003315/