Ccdc9b-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ccdc9b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-05009

品系全称

C57BL/6JCya-Ccdc9bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-214239-Ccdc9b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ccdc9b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-05009) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
coiled-coil domain containing 9B
基因别称
A430105I19Rik,Gm353
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001001982.2 | Ensembl: ENSMUST00000059997
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~11
敲除长度
~5434 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
CCDC9B,也称为Coiled-coil domain containing 9B,是一种编码含有卷曲螺旋结构域的蛋白质的基因。卷曲螺旋结构域是一类蛋白质结构域,常参与蛋白质与蛋白质的相互作用。CCDC9B基因位于人类染色体上,其具体功能目前尚不完全清楚。然而,一些研究表明,CCDC9B基因可能与智力障碍等神经系统疾病的发生有关。

在一项针对中东地区118个家庭中的215名智力障碍患者的研究中,研究人员对188个个体进行了全外显子测序(WES)。他们发现,在32/118个家庭(27%)中检测到了病理性或可能病理性变异,在33/118个家庭(28%)中检测到了意义不明的变异。在32/118个家庭(27%)中检测到了可能与智力障碍相关的候选基因,共涉及64名受影响的个体。这些基因包括AATK、AP1G2、CAMSAP1、CCDC9B、CNTROB、DNAH14、DNAJB4、DRG1、DTNBP1、EDRF1、EEF1D、EXOC8、EXOSC4、FARSB、FBXO22、FILIP1、INPP4A、P2RX7、PRDM13、PTRHD1、SCN10A、SCYL2、SMG8、SUPV3L1、TACC2、THUMPD1、XPR1和ZFYVE28[1]。这些研究结果为理解智力障碍的遗传基础提供了重要信息,并为受影响家庭提供了精确的遗传咨询。

另一项研究探讨了5-甲基胞嘧啶RNA甲基转移酶NSUN7在肝细胞癌中的作用。研究发现,NSUN7在肝细胞癌中经历了启动子CpG岛高甲基化,与转录沉默相关。通过RNA亚硫酸氢盐测序和蛋白质组学分析,研究人员发现CCDC9B基因的mRNA需要NSUN7介导的甲基化来维持转录稳定性。此外,蛋白质组学分析显示,CCDC9B的缺失导致其伴侣蛋白MYC调节剂流感病毒NS1A结合蛋白(IVNS1ABP)的蛋白质水平降低,从而增加了对溴结构域抑制剂的敏感性。NSUN7的DNA甲基化相关沉默也在原发性肝肿瘤中被观察到,并与较差的总生存期相关。有趣的是,NSUN7未甲基化的状态在免疫活性的肝肿瘤亚类中富集[2]。这些发现表明,NSUN7的表观遗传沉默与肝细胞癌的临床结果和独特的治疗敏感性有关。

综上所述,CCDC9B基因在智力障碍和肝细胞癌中可能发挥着重要作用。在智力障碍中,CCDC9B基因的变异可能与疾病的发生有关。在肝细胞癌中,CCDC9B基因的转录稳定性受到NSUN7的调控,并且与NSUN7的表观遗传沉默相关。这些研究结果为理解CCDC9B基因在疾病发生中的作用提供了重要线索,并为相关疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Al-Kasbi, Ghalia, Al-Murshedi, Fathiya, Al-Kindi, Adila, Al-Yahyaee, Said, Al-Maawali, Almundher. 2022. The diagnostic yield, candidate genes, and pitfalls for a genetic study of intellectual disability in 118 middle eastern families. In Scientific reports, 12, 18862. doi:10.1038/s41598-022-22036-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36344539/
2. Ortiz-Barahona, Vanessa, Soler, Marta, Davalos, Veronica, Llovet, Josep M, Esteller, Manel. 2023. Epigenetic inactivation of the 5-methylcytosine RNA methyltransferase NSUN7 is associated with clinical outcome and therapeutic vulnerability in liver cancer. In Molecular cancer, 22, 83. doi:10.1186/s12943-023-01785-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37173708/