Rtl3-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Rtl3-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04921

品系全称

C57BL/6JCya-Rtl3em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-213436-Rtl3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rtl3-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04921) were purchased from Cyagen.
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
retrotransposon Gag like 3
基因别称
D430021I08Rik,Gm375,Mar3,Mart3,ZHC5,Zcchc5
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_199468.2 | Ensembl: ENSMUST00000062010
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1657 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Rtl3,也称为Retrotransposon Gag-like 3,是一种来源于哺乳动物反转录转座子的转录本(MART)。Rtl3在骨骼组织中具有重要作用,特别是在软骨生成过程中。研究表明,Rtl3与SOX-9协同调节软骨细胞中II型胶原蛋白(COL2A1)的表达。在软骨细胞中,Rtl3的表达水平较高,而在肌肉、大脑或其他组织中表达较弱。Rtl3的表达受到其C端CCHC锌指结合域的调控。Rtl3在软骨生成过程中对SOX-9和COL2A1的表达以及基质合成具有关键作用。此外,Rtl3与SOX-9在软骨细胞中共同表达,表明它们之间存在协同调节关系。这些发现揭示了Rtl3在骨骼发育和COL2A1表达调控中的重要作用,为理解相关疾病的发生机制提供了新的线索[1]。

Rtl3的进化历史和功能潜力也得到了研究。通过分析哺乳动物基因组中的Metaviridae家族成员,研究人员发现至少发生了五次独立的家系事件,导致了三种广泛保留的单拷贝基因和两种胎盘哺乳动物特有的基因家族。在SIRH/RTL家族中,Rtl3的进化历史表现出多样性,包括氨基末端域的多样性、RTL10基因在多个哺乳动物谱系中失去了蛋白质编码能力,以及在RTL3中,古老的程序性核糖体移框被用于家系的CA和蛋白酶结构域。此外,Rtl3的进化历史还揭示了其在逆转录转座子中独特的蛋白质结构域配置。这些发现揭示了Rtl3在哺乳动物进化中的多样性和功能潜力,为理解其生物学作用提供了新的视角[2]。

此外,Rtl3的表达模式与肺鳞状细胞癌(LUSC)的诊断和预后相关。研究通过对LUSC基因表达谱和DNA甲基化数据的分析,筛选出Rtl3作为LUSC预后预测的潜在基因表达标记。Rtl3的表达水平与LUSC患者的预后密切相关,表达水平较高的患者预后较差。这些发现表明Rtl3可能参与了LUSC的发生和发展过程,并且可以作为LUSC诊断和预后的潜在标记物[3]。

综上所述,Rtl3在软骨生成、骨骼发育和LUSC的发生发展中具有重要作用。Rtl3与SOX-9协同调节COL2A1的表达,影响软骨细胞中的基质合成。此外,Rtl3的进化历史和功能潜力也得到了研究,揭示了其在哺乳动物进化中的多样性和独特性。Rtl3的表达模式与LUSC的诊断和预后相关,表明其在LUSC的发生和发展中具有重要作用。未来,对Rtl3的深入研究将有助于更好地理解其在骨骼发育和LUSC发生发展中的作用机制,并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Ball, Hope C, Ansari, Mohammad Y, Ahmad, Nashrah, Novak, Kimberly, Haqqi, Tariq M. 2020. A retrotransposon gag-like-3 gene RTL3 and SOX-9 co-regulate the expression of COL2A1 in chondrocytes. In Connective tissue research, 62, 615-628. doi:10.1080/03008207.2020.1828380. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33043724/
2. Henriques, William S, Young, Janet M, Nemudryi, Artem, Wiedenheft, Blake, Malik, Harmit S. . The Diverse Evolutionary Histories of Domesticated Metaviral Capsid Genes in Mammals. In Molecular biology and evolution, 41, . doi:10.1093/molbev/msae061. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38507667/
3. Wang, Weiqing, Wang, Shaohua, Chu, Xiao, Liu, Hui, Xiang, Ming. 2019. Predicting the Lung Squamous Cell Carcinoma Diagnosis and Prognosis Markers by Unique DNA Methylation and Gene Expression Profiles. In Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology, 27, 1041-1054. doi:10.1089/cmb.2019.0138. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31710242/