Taf1b-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Taf1b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04916

品系全称

C57BL/6JCya-Taf1bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-21340-Taf1b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Taf1b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04916) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I, B
基因别称
4930408G01Rik,A230108M10Rik,TAFI68,Tafi86,p63
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_020614.2 | Ensembl: ENSMUST00000075954
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 6~7
敲除长度
~2225 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:109577Homozygous null mice die prior to E6.5.
Taf1b,也称为TAF(I)63,是一种重要的TBP(TATA box-binding protein)相关因子,是RNA聚合酶I(Pol I)转录因子SL1的组成部分。SL1在真核细胞中负责启动核糖体RNA(rRNA)的合成。Taf1b在Pol I转录过程中发挥着关键作用,它通过参与预起始复合物的组装和后聚合酶招募事件,帮助RNA聚合酶I结合到rRNA基因的启动子上,从而启动rRNA的转录。此外,Taf1b还与Taf1A和Taf1C等其他TBP相关因子共同作用,共同构成SL1复合物,共同调控Pol I的转录活性[5]。

研究表明,Taf1b在多种生物学过程中发挥着重要作用。例如,在胃腺癌中,Taf1b的表达水平与患者的预后相关。过度表达的Taf1b与较差的预后相关,而敲低Taf1b的表达则可以抑制胃腺癌细胞的增殖和生存。此外,敲低Taf1b的表达还可以诱导核仁应激,并促进c-MYC mRNA的降解,从而抑制胃腺癌的进展[1]。此外,Taf1b的缺失还会影响rRNA基因的转录和加工,导致核糖体生物合成的减少。

除了胃腺癌,Taf1b在其他癌症中也发挥着重要作用。例如,在结直肠癌中,Taf1b的基因发生体细胞移码突变,这可能与肿瘤的发生有关。此外,Taf1b在结直肠癌中的区域异质性也被发现,这表明Taf1b的突变可能在结直肠癌的发生中发挥着重要作用[2]。

此外,Taf1b还与核糖体的组装和功能有关。例如,在核糖体蛋白(Rp)基因中,Taf1b的缺失可以导致核糖体亚基水平的变化,从而影响翻译速率和细胞竞争。研究表明,Taf1b的表达可以降低全局翻译,并通过PERK依赖的eIF2α磷酸化来调节翻译。此外,Taf1b的缺失还可以导致eIF2α磷酸化水平的升高,从而促进细胞竞争[3]。

此外,Taf1b在干细胞中也发挥着重要作用。例如,在果蝇的卵巢生殖干细胞(GSCs)中,Taf1b的缺失会导致GSCs的增殖减少。GSCs表现出高水平的rRNA转录,而Udd(Under-developed)和Taf1C等因子在GSCs中的表达水平也相对较高。研究表明,调节rRNA的合成可以影响GSCs的命运、生长和增殖,从而影响整个干细胞谱系的发育和功能[4]。

最后,Taf1b在遗传性疾病中也发挥着重要作用。例如,在先天性囊性结肠(CPC)中,Taf1b的基因突变被发现,这可能与CPC的发生有关。此外,Taf1b还与其他基因一起参与了Wnt和HOX信号通路的调控,这些通路与CPC的发病机制密切相关[6]。

综上所述,Taf1b是一种重要的TBP相关因子,在Pol I转录、核糖体组装和功能、干细胞发育和遗传性疾病中发挥着重要作用。研究Taf1b的生物学功能和作用机制有助于深入理解Pol I转录、核糖体生物合成和干细胞发育的调控机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Chen, Hang-Fei, Li, Zhang-Ping, Wu, Qi, Peng, Zheng, Zhang, Feng. 2023. Inhibition of TAF1B impairs ribosome biosynthesis and suppresses cell proliferation in stomach adenocarcinoma through promoting c-MYC mRNA degradation. In Heliyon, 10, e23167. doi:10.1016/j.heliyon.2023.e23167. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38169774/
2. Oh, Hye Rim, An, Chang Hyeok, Yoo, Nam Jin, Lee, Sug Hyung. . Frameshift mutations of TAF1C gene, a core component for transcription by RNA polymerase I, and its regional heterogeneity in gastric and colorectal cancers. In Pathology, 47, 101-4. doi:10.1097/PAT.0000000000000212. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25551296/
3. Kiparaki, Marianthi, Khan, Chaitali, Folgado-Marco, Virginia, Moulos, Panagiotis, Baker, Nicholas E. 2022. The transcription factor Xrp1 orchestrates both reduced translation and cell competition upon defective ribosome assembly or function. In eLife, 11, . doi:10.7554/eLife.71705. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35179490/
4. Zhang, Qiao, Shalaby, Nevine A, Buszczak, Michael. . Changes in rRNA transcription influence proliferation and cell fate within a stem cell lineage. In Science (New York, N.Y.), 343, 298-301. doi:10.1126/science.1246384. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24436420/
5. Di Pietro, C, Rapisarda, A, Amico, V, Grzeschik, K, Purrello, M. . Genomic localization of the human genes TAF1A, TAF1B and TAF1C, encoding TAF(I)48, TAF(I)63 and TAF(I)110 subunits of class I general transcription initiation factor SL1. In Cytogenetics and cell genetics, 89, 133-6. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10894955/
6. Phugat, Shivani, Sharma, Jyoti, Kumar, Sourabh, Agarwala, Sandeep, Goel, Prabudh. 2024. Genetic landscape of congenital pouch colon: systematic review and functional enrichment study. In Pediatric surgery international, 40, 314. doi:10.1007/s00383-024-05878-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39557707/