Scfd2-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Scfd2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04877

品系全称

C57BL/6JCya-Scfd2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-212986-Scfd2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Scfd2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04877) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
Sec1 family domain containing 2
基因别称
E430013M20Rik,STXBP1L1
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001114660.2 | Ensembl: ENSMUST00000072857
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~838 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Scfd2,也称为Sec1家族结构域2,是一种编码Sec1结构域家族成员的基因。Sec1结构域家族成员是广泛存在于真核生物中的蛋白质,它们在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞内囊泡运输、信号转导和蛋白质定位等。Scfd2在细胞内囊泡运输中发挥着关键作用,参与调节囊泡的运输、融合和分拣等过程。此外,Scfd2还与细胞信号转导有关,参与调控多种细胞信号通路的活性和功能。Scfd2在多种疾病中发挥重要作用,包括乳腺癌、前列腺癌、白血病和自闭症等。Scfd2的异常表达和突变可能导致细胞内囊泡运输和信号转导的紊乱,进而影响细胞功能和生物学过程,从而促进疾病的发生和发展。

乳腺癌是女性中最常见的癌症类型,其中大部分乳腺癌表达雌激素受体(ER),内分泌治疗是ER阳性乳腺癌的标准治疗方法。然而,治疗耐药性的发展仍然是乳腺癌治疗的主要挑战,因此需要新的治疗方法。研究发现,RNA结合蛋白PSPC1在ER阳性乳腺癌生长中起着关键作用,通过转录后基因调节。PSPC1与PSF相互作用,参与转录后调节PSF靶基因ESR1和SCFD2的RNA处理。SCFD2的免疫反应性与ER阳性乳腺癌患者的预后不良相关,并且PSPC1、PSF和SCFD2免疫反应性的组合是ER阳性乳腺癌患者预后的有力预测因子。此外,研究还发现DDIAS和MYBL1是SCFD2下游靶基因,并且SCFD2沉默抑制了他莫昔芬耐药性乳腺癌肿瘤的生长。这些结果表明,PSPC1和SCFD2轴可能是乳腺癌临床管理中一个有希望的靶点[1]。

前列腺癌是男性癌症相关死亡的第二大原因,而转移的出现是前列腺癌治疗的关键挑战。研究表明,长链非编码RNA(lncRNA)在癌症的发展和进展中起着重要作用。研究利用一组独特的去势抵抗性前列腺癌转移(mCRPC)和相应的局部肿瘤和RNA测序(RNA-seq)数据,发现患者之间的变异性是样本之间lncRNA表达差异的主要来源,表明基因组改变是PCa转移中lncRNA表达的主要驱动因素。研究还确定了27个在转移和相应原发性肿瘤之间差异表达的lncRNA(DE-lncRNA),表明它们是mCRPC特异性lncRNA。此外,研究发现,大约一半的DE-lncRNA在其调控区域具有至少一个雄激素受体结合位点,并且TF富集分析显示,DE-lncRNA的调控区域富集了PCa相关TFs,如FOXA1和HOXB13的结合位点。在一组接受前列腺切除术治疗的前列腺肿瘤中,四个DE-lncRNA与无进展生存期相关,其中两个(lnc-SCFD2-2和lnc-R3HCC1L-8)是侵袭性PCa的独立预后标志物。这项研究强调了几个mCRPC特异性lncRNA,它们可能在PCa进展到转移阶段的过程中发挥重要作用,也可能作为侵袭性PCa的潜在生物标志物[4]。

急性髓细胞性白血病(AML)是一种常见的白血病类型,其中t(4;12)(q12;p13)易位是一种罕见且通常与侵袭性临床过程和不良预后相关的类型。以往的研究表明,t(4;12)(q12;p13)易位与ETV6-PDGFRA融合有关,尽管缺乏嗜酸性粒细胞增多,这是PDGFRA相关融合的其他血液恶性肿瘤的典型特征。研究发现,在t(4;12)(q12;p13)易位的AML患者中,通过靶向RNA测序检测到ETV6-SCFD2融合,这表明ETV6-SCFD2融合可能与AML的发生和进展有关。此外,研究发现,在AML中,ETV6与SCFD2的融合可能是ETV6-PDGFRA融合的替代形式,而ETV6-SCFD2融合与PDGFRA无关,可能对伊马替尼不敏感[2]。

自闭症谱系障碍(ASD)是一种常见的神经发育障碍,其遗传基础尚不完全清楚。研究发现,在卡塔尔单系家庭中,通过外显子测序鉴定了两个新的自闭症基因,TRPC4和SCFD2。这些基因的变异主要是由de novo和纯合子错义和剪接变异组成,并且多个个体表现出多个候选变异,这表明可能涉及二基因或多基因模型。这些变异在基因组聚合数据库(gnomAD)中不存在,并且在当地对照组人群中具有极低的频率。此外,蛋白质建模被用来评估三个错义变异在DEAF1、CLCN3和SCFD2中的潜在影响,结果强烈支持了这些变异的致病性质。这项研究表明,SCFD2可能是自闭症的候选基因之一[3]。

总之,Scfd2是一种编码Sec1结构域家族成员的基因,在细胞内囊泡运输和信号转导中发挥重要作用。Scfd2在多种疾病中发挥重要作用,包括乳腺癌、前列腺癌、白血病和自闭症等。Scfd2的异常表达和突变可能导致细胞内囊泡运输和信号转导的紊乱,进而影响细胞功能和生物学过程,从而促进疾病的发生和发展。Scfd2的研究有助于深入理解其在各种生物学过程中的作用,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1][2][3][4]。

参考文献:
1. Takeiwa, Toshihiko, Ikeda, Kazuhiro, Suzuki, Takashi, Horie, Kuniko, Inoue, Satoshi. 2022. PSPC1 is a potential prognostic marker for hormone-dependent breast cancer patients and modulates RNA processing of ESR1 and SCFD2. In Scientific reports, 12, 9495. doi:10.1038/s41598-022-13601-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35681031/
2. Mueller, Sarah B, Dal Cin, Paola, Le, Long P, Stone, Richard M, Nardi, Valentina. . t(4;12)(q12;p13) ETV6-rearranged AML without eosinophilia does not involve PDGFRA: relevance for imatinib insensitivity. In Blood advances, 6, 818-827. doi:10.1182/bloodadvances.2021005280. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34587239/
3. Gupta, Vijay, Ben-Mahmoud, Afif, Ku, Bonsu, Layman, Lawrence C, Kim, Hyung-Goo. 2023. Identification of two novel autism genes, TRPC4 and SCFD2, in Qatar simplex families through exome sequencing. In Frontiers in psychiatry, 14, 1251884. doi:10.3389/fpsyt.2023.1251884. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38025430/
4. Sattari, Mina, Kohvakka, Annika, Moradi, Elaheh, Kesseli, Juha, Visakorpi, Tapio. 2023. Identification of long noncoding RNAs with aberrant expression in prostate cancer metastases. In Endocrine-related cancer, 30, . doi:10.1530/ERC-22-0247. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37140987/