Ints9-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Ints9-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04762

品系全称

C57BL/6JCya-Ints9em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-210925-Ints9-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ints9-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04762) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
integrator complex subunit 9
基因别称
D14Ertd231e
染色体号
Chr 14 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_153414.5 | Ensembl: ENSMUST00000043914
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~128 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
INTS9,也称为Integrator complex subunit 9,是Integrator复合体中的一个亚基。Integrator复合体是一个多亚基蛋白复合体,参与调控基因表达,对细胞生长、发育和分化起着重要作用。INTS9是Integrator复合体的一个重要组成部分,参与RNA的3'-端加工,包括非编码RNA和前体mRNA的3'-端加工。INTS9与另一个Integrator复合体的亚基INTS11相互作用,形成异源二聚体,共同发挥功能。INTS9和INTS11在Integrator复合体中具有催化活性,负责RNA的3'-端加工,包括snRNA和eRNA的3'-端加工。INTS9和INTS11的相互作用对于Integrator复合体的功能至关重要,INTS9的突变或缺失会导致RNA加工异常,进而影响基因表达和细胞功能。

INTS9和INTS11的相互作用对于RNA的3'-端加工至关重要。INTS9和INTS11形成异源二聚体,共同发挥催化活性,负责RNA的3'-端加工。INTS9和INTS11的相互作用对于Integrator复合体的功能至关重要,INTS9的突变或缺失会导致RNA加工异常,进而影响基因表达和细胞功能。INTS9和INTS11的相互作用对于RNA的3'-端加工至关重要。INTS9和INTS11形成异源二聚体,共同发挥催化活性,负责RNA的3'-端加工。INTS9和INTS11的相互作用对于Integrator复合体的功能至关重要,INTS9的突变或缺失会导致RNA加工异常,进而影响基因表达和细胞功能。

BRAT1(BRCA1 Associated ATM Activator 1)是一种基因,与神经退行性疾病有关。BRAT1与INTS11和INTS9亚基的Integrator复合体相互作用,形成三聚体复合物,在神经元分化过程中激活关键神经基因。BRAT1的缺失导致REST(Repressor element-1 silencing transcription factor)在关键神经基因上的持续存在,阻碍NT2细胞分化为星形胶质细胞和神经元细胞。BRAT1和INTS11共同占据这些基因的启动子区域,BRAT1在将这些基因的启动子区域招募INTS11方面发挥重要作用。BRAT1的疾病相关突变降低了其与INTS11/INTS9的关联,与关键神经基因的转录激活缺陷有关。在鼠胚胎干细胞中,Brat1的缺失导致神经元分化缺陷,而野生型BRAT1的再构成可以恢复神经元分化,而BRAT1突变体无法与INTS11/INTS9关联,无法恢复神经元表型。这些研究表明,BRAT1与INTS11和INTS9的关联在神经系统发育中起着重要作用[1]。

Integrator复合体的组装机制对于其功能至关重要。BRAT1和WDR73是人类切割模块的关键生物发生因子。它们通过物理阻塞内切酶活性位点,在成熟过程中维持INTS9-11的无活性状态,并防止INTS4的过早关联。此外,BRAT1促进INTS9-11进入细胞核,在那里它与INTS4结合。最终,BRAT1的释放需要肌醇六磷酸(IP6)锁定成熟切割模块的构象。这些数据解释了BRAT1、WDR73和INTS11突变引起的神经发育障碍,并揭示了IP6是切割模块成熟的关键辅助因子[2]。

BRAT1与INTS11/INTS9异源二聚体相互作用,调节关键神经发育基因。INTS11和INTS9亚基的Integrator复合体与BRAT1相互作用,形成三聚体复合物,在人类HEK293T细胞和多能人类胚胎癌细胞系(NT2)中发挥作用。BRAT1的缺失阻碍了NT2细胞分化为星形胶质细胞和神经细胞。BRAT1的缺失导致无法激活许多受REST(神经沉默因子)调控的神经基因。BRAT1和INTS11共同占据这些基因的启动子区域,BRAT1在将这些基因的启动子区域招募INTS11方面发挥重要作用。BRAT1的疾病相关突变降低了其与INTS11/INTS9的关联,与关键神经基因的转录激活缺陷有关。Integrator复合体亚基INTS9和INTS11与BRAT1紧密相互作用。BRAT1的缺失导致人类神经分化的显著延迟。BRAT1和INTS11模块靶向神经标记基因的启动子区域,并共同调节其表达。INTS11被招募到这些位点是由BRAT1依赖的。BRAT1的E522K突变破坏了其与INTS11/INTS9异源二聚体的相互作用[3]。

BRAT1与Integrator复合体相互作用,与神经退行性病变有关。BRAT1与Integrator复合体的INTS9/INTS11亚基相互作用,这些亚基负责处理各种非编码RNA和前体mRNA的3'-端。BRAT1的缺失导致Integrator功能的紊乱。特别是,BRAT1的缺陷阻碍了UsnRNA和snoRNA的适当3'-端加工,复制依赖性组蛋白前体mRNA加工,并改变了蛋白编码基因的表达。重要的是,BRAT1相关神经病变患者来源的细胞中也观察到Integrator功能的缺陷。这些数据表明,BRAT1的缺陷干扰了Integrator功能的正常进行,导致RNA和蛋白质表达异常,从而导致神经退行性病变[4]。

IntS9和IntS11是Integrator复合体的两个亚基,它们通过其C端结构域形成稳定的异源二聚体。Wu等人使用晶体结构分析和功能研究揭示了IntS9和IntS11 C端结构域复合物的结构基础和功能重要性。他们发现IntS9-IntS11 C端结构域复合物由一个连续的九股β-折叠片组成,其中IntS9贡献了四股,IntS11贡献了五股。高度保守的残基位于两个C端结构域之间的广泛界面。酵母双杂交实验和共免疫沉淀实验证实了结构观察。功能研究表明,IntS9-IntS11相互作用对于Integrator复合体在snRNA 3'-端加工中的作用至关重要[5]。

SUMO化修饰是细胞内重要的调控机制,参与调节蛋白质的活性、定位和稳定性。Bragado等人发现,Integrator复合体亚基INTS11的SUMO化修饰受到USPL1和SENP6的调节。他们确定了Lys381、Lys462和Lys475作为INTS11上的SUMO化修饰位点,并观察到SUMO化修饰调节INTS11的亚细胞定位和Integrator活性。此外,INTS11 SUMO化缺陷突变体仍然能够与INTS4和INTS9相互作用,但其与其他Integrator复合体亚基的相互作用受到影响。这些发现表明,SUMO化修饰在Integrator活性中发挥调节作用,并且INTS11的SUMO化修饰可能参与复合体的组装[6]。

Integrator复合体亚基4(INTS4)与INTS9/11相互作用,形成Integrator切割模块。Albrecht等人发现,INTS4是INTS9/11的特异性且保守的相互作用伴侣,但并不与INTS9或INTS11单独相互作用。尽管INTS4与Symplekin没有显著的序列同源性,但它具有类似于Symplekin的N端HEAT重复序列,以及富含β-折叠片的C端区域,这些对于结合INTS9/11至关重要。他们评估了Integrator复合体的三个功能,包括UsnRNA 3'-端加工、Cajal体结构的维持和组蛋白位点体的形成,得出结论INTS4/9/11是UsnRNA生物发生中最关键的Integrator复合体亚基。这些结果表明,INTS4/9/11构成了一个异源三聚体复合物,可能是Integrator切割模块,负责其内切酶活性[7]。

综上所述,INTS9是Integrator复合体中的一个重要亚基,参与RNA的3'-端加工,对细胞生长、发育和分化起着重要作用。INTS9与INTS11相互作用,形成异源二聚体,共同发挥催化活性。BRAT1与INTS11和INTS9相互作用,形成三聚体复合物,在神经元分化过程中激活关键神经基因。INTS9和INTS11的相互作用对于RNA的3'-端加工至关重要。BRAT1的缺失导致RNA加工异常,进而影响基因表达和细胞功能。INTS9的突变或缺失会导致RNA加工异常,进而影响基因表达和细胞功能。INTS9的研究有助于深入理解Integrator复合体的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Dokaneheifard, Sadat, Gomes Dos Santos, Helena, Guiselle Valencia, Monica, Edupuganti, Raghu Ram, Shiekhattar, Ramin. 2024. Neuronal differentiation requires BRAT1 complex to remove REST from chromatin. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 121, e2318740121. doi:10.1073/pnas.2318740121. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38805275/
2. Sabath, Kevin, Qiu, Chunhong, Jonas, Stefanie. 2024. Assembly mechanism of Integrator's RNA cleavage module. In Molecular cell, 84, 2882-2899.e10. doi:10.1016/j.molcel.2024.06.032. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39032489/
3. Dokaneheifard, Sadat, Gomes Dos Santos, Helena, Valencia, Monica Guiselle, Arigela, Harikumar, Shiekhattar, Ramin. 2023. BRAT1 associates with INTS11/INTS9 heterodimer to regulate key neurodevelopmental genes. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2023.08.10.552743. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37609215/
4. Cihlarova, Zuzana, Kubovciak, Jan, Sobol, Margarita, Caldecott, Keith W, Hanzlikova, Hana. 2022. BRAT1 links Integrator and defective RNA processing with neurodegeneration. In Nature communications, 13, 5026. doi:10.1038/s41467-022-32763-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36028512/
5. Wu, Yixuan, Albrecht, Todd R, Baillat, David, Wagner, Eric J, Tong, Liang. 2017. Molecular basis for the interaction between Integrator subunits IntS9 and IntS11 and its functional importance. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 114, 4394-4399. doi:10.1073/pnas.1616605114. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28396433/
6. Bragado, Laureano, Magalnik, Melina, Mammi, Pablo, Pozzi, Berta, Srebrow, Anabella. . SUMO conjugation regulates the activity of the Integrator complex. In Nucleic acids research, 50, 12444-12461. doi:10.1093/nar/gkac1055. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36454007/
7. Albrecht, Todd R, Shevtsov, Sergey P, Wu, Yixuan, Dundr, Miroslav, Wagner, Eric J. . Integrator subunit 4 is a 'Symplekin-like' scaffold that associates with INTS9/11 to form the Integrator cleavage module. In Nucleic acids research, 46, 4241-4255. doi:10.1093/nar/gky100. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29471365/