Setd1b-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Setd1b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04515

品系全称

C57BL/6JCya-Setd1bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-208043-Setd1b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Setd1b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04515) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SET domain containing 1B
基因别称
KMT2G,mKIAA1076
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001040398 | Ensembl: ENSMUST00000163030
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 5
敲除长度
~0.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2652820Homozygous mutant animals died during organogenesis by E11.5.
SETD1B,也称为SET domain containing 1B,是一种重要的组蛋白甲基转移酶,它特异性地催化组蛋白H3第4位赖氨酸的甲基化,形成H3K4me3修饰。H3K4me3是一种关键的表观遗传标记,广泛存在于基因启动子和CpG岛区域,对基因表达和染色质结构的调控起着重要作用。

SETD1B在多个生物学过程中发挥关键作用。在神经发育方面,SETD1B的缺失或功能障碍会导致多种神经发育障碍,包括智力障碍、语言发育迟缓、自闭症和癫痫等。研究表明,SETD1B基因的变异与SETD1B相关综合征有关,该综合征的临床特征包括智力障碍、语言发育迟缓、发育迟缓、自闭症和癫痫等[1][4]。SETD1B的缺失会导致组蛋白H3K4me3水平的降低,进而影响神经发育相关基因的表达,从而引发上述神经发育障碍。

在肿瘤发生和进展方面,SETD1B也发挥着重要作用。研究发现,SETD1B基因的表达水平与肝细胞癌(HCC)的不良预后相关。SETD1B在HCC肿瘤组织中的表达水平显著高于正常组织,且SETD1B的表达水平与肿瘤大小、临床分期和肝硬化的程度相关。SETD1B表达水平降低的HCC患者生存时间较长,而SETD1B表达水平升高的患者生存时间较短[2]。此外,SETD1B基因的变异也与多种癌症的发生和发展相关,如乳腺癌、卵巢癌和结直肠癌等[3]。

SETD1B在生殖系统发育中也发挥着重要作用。SETD1B的缺失会导致雌性不育,因为SETD1B在卵母细胞基因表达程序中发挥母性效应基因的作用。SETD1B通过调节卵母细胞转录因子的表达,如Obox1、2、5、7、Meis2和Sall4等,促进卵母细胞的发育和成熟。SETD1B的缺失会导致卵母细胞基因表达程序的紊乱,进而影响卵母细胞的发育和成熟,最终导致雌性不育[5]。

SETD1B的缺失还会导致组蛋白H3K4me3的基因组范围内的重新分布。SETD1B的缺失会导致活性基因启动子区域的H3K4me3水平降低,进而导致相关基因的表达下调。此外,SETD1B的缺失还会导致许多区域的H3K4me3水平升高,尤其是DNA低甲基化、转录不活跃和CpG丰富的区域,这些区域通常是MLL2的靶标。因此,SETD1B的缺失会破坏MLL2和去甲基化酶之间在卵母细胞发育过程中对H3K4me3的基因组靶向的平衡[6]。

综上所述,SETD1B是一种重要的组蛋白甲基转移酶,它在神经发育、肿瘤发生和进展以及生殖系统发育等方面发挥着重要作用。SETD1B的缺失或功能障碍会导致多种神经发育障碍、肿瘤的发生和发展以及生殖系统发育的异常。因此,SETD1B的研究对于深入理解表观遗传调控的生物学功能和疾病发生机制具有重要意义,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Weerts, Marjolein J A, Lanko, Kristina, Guzmán-Vega, Francisco J, Arold, Stefan T, Barakat, Tahsin Stefan. 2021. Delineating the molecular and phenotypic spectrum of the SETD1B-related syndrome. In Genetics in medicine : official journal of the American College of Medical Genetics, 23, 2122-2137. doi:10.1038/s41436-021-01246-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34345025/
2. Chen, Dong, Li, Tieling, Wang, Cheng, Zhang, Shaogeng, Yang, Penghui. 2019. High‑level SETD1B gene expression is associated with unfavorable prognosis in hepatocellular carcinoma. In Molecular medicine reports, 19, 1587-1594. doi:10.3892/mmr.2019.9832. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30628696/
3. Kranz, Andrea, Anastassiadis, Konstantinos. 2020. The role of SETD1A and SETD1B in development and disease. In Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms, 1863, 194578. doi:10.1016/j.bbagrm.2020.194578. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32389824/
4. Roston, Alexandra, Evans, Dan, Gill, Harinder, Connolly, Mary, Gibson, William T. 2020. SETD1B-associated neurodevelopmental disorder. In Journal of medical genetics, 58, 196-204. doi:10.1136/jmedgenet-2019-106756. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32546566/
5. Brici, David, Zhang, Qinyu, Reinhardt, Susanne, Stewart, A Francis, Kranz, Andrea. 2017. Setd1b, encoding a histone 3 lysine 4 methyltransferase, is a maternal effect gene required for the oogenic gene expression program. In Development (Cambridge, England), 144, 2606-2617. doi:10.1242/dev.143347. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28619824/
6. Hanna, Courtney W, Huang, Jiahao, Belton, Christian, Kranz, Andrea, Kelsey, Gavin. . Loss of histone methyltransferase SETD1B in oogenesis results in the redistribution of genomic histone 3 lysine 4 trimethylation. In Nucleic acids research, 50, 1993-2004. doi:10.1093/nar/gkac051. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35137160/