Shmt1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Shmt1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04303

品系全称

C57BL/6JCya-Shmt1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-20425-Shmt1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Shmt1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04303) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
serine hydroxymethyltransferase 1 (soluble)
基因别称
Shmt,mshmt,mshmt1,mshmt2
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_009171 | Ensembl: ENSMUST00000018744
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~7
敲除长度
~8.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:98299Mice with deficiencies in this gene display abnormalities in hepatic partioning of methylenetetrahydrofolate but are otherwise healthy and fertile.
SHMT1,也称为丝氨酸羟甲基转移酶1,是丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢途径中的一个关键酶。这个代谢途径提供了一碳单位,对于生物合成和DNA合成与甲基化具有重要作用。SHMT1主要负责将丝氨酸转化为甘氨酸,并在这个过程中释放出一个碳单位,该碳单位对于DNA的合成和甲基化至关重要,从而影响基因表达和细胞代谢。

SHMT1基因的突变或表达异常与多种疾病相关。例如,SHMT1基因多态性与多发性硬化症的易感性相关[1]。研究显示,携带特定基因型的个体,如GG型(SHMT1 rs4925166)和TC型(ERG rs2836425),有更高的多发性硬化症风险。而其他基因型,如TT型(SHMT1 rs4925166)、CC型(ERG rs2836425)、GG型(MAZ rs34286592)和GG型(SHMT1 rs1979277),则与多发性硬化症的风险降低相关。

此外,SHMT1基因的表达与肾细胞癌(RCC)的发生和进展也有关联[2]。研究发现,低水平的SHMT1表达与RCC患者的预后不良相关。在体外研究中,SHMT1的过表达能够抑制RCC细胞的增殖和迁移。在小鼠肿瘤模型中,SHMT1的过表达能够显著减缓RCC肿瘤的生长。此外,通过基因网络分析,发现HOXD8是SHMT1的调节因子,能够促进SHMT1的表达,从而抑制RCC细胞的增殖和迁移。

SHMT1基因的C1420T多态性与癌症风险也存在关联[3]。一项荟萃分析显示,SHMT1 C1420T多态性与总体癌症风险没有显著关联。但在亚组分析中,发现该多态性与结直肠癌和亚洲人群的癌症风险存在显著关联。这表明SHMT1 C1420T多态性可能在特定人群和癌症类型中发挥保护作用。

SHMT1基因的表达和功能在肺癌中也具有重要意义[4]。研究发现,磷酸化的SHMT2在肺癌中发挥肿瘤抑制作用,通过m6A修饰调节肿瘤基因的RNA降解。SHMT2的磷酸化状态影响S-腺苷甲硫氨酸的水平,进而影响m6A修饰和肿瘤基因的RNA降解,最终抑制肿瘤的发生。

此外,SHMT1和SHMT2的表达水平在肾细胞癌患者中存在差异[5]。SHMT1和SHMT2的表达水平与患者的生存期和预后相关。高水平的SHMT1表达与肾细胞癌患者的较好预后相关,而SHMT2的表达水平与患者的预后较差相关。这表明SHMT1和SHMT2可能是肾细胞癌的潜在治疗和预后生物标志物。

SHMT1基因的表达与急性髓系白血病(AML)的发生也有关联[6]。研究发现,AML患者的SHMT1基因表达水平显著高于正常对照组。这表明SHMT1基因可能在AML的发生和发展中发挥作用,并可能成为AML治疗的潜在靶点。

SHMT1基因多态性与儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)的风险也有关联[7]。研究发现,SHMT1基因的某些多态性与儿童ALL的风险增加相关,而其他多态性则与ALL的风险降低相关。这表明SHMT1基因的多态性可能在儿童ALL的发生中发挥重要作用。

此外,SHMT1基因的甲基化水平与缺血性中风的发生也有关联[8]。研究发现,缺血性中风患者的SHMT1基因甲基化水平显著高于正常对照组。这表明SHMT1基因的甲基化可能参与了缺血性中风的发生和发展。

SHMT1基因的表达和功能在神经管缺陷(NTD)中也具有重要意义[9]。研究发现,SHMT1基因的敲除导致小鼠胚胎发生NTD。这表明SHMT1基因在NTD的发生中发挥重要作用,可能通过影响胸苷酸从头合成途径来调控NTD的发生。

综上所述,SHMT1基因在多种疾病的发生和发展中发挥着重要作用。SHMT1基因的突变、表达异常和多态性都与多种疾病的风险和预后相关。此外,SHMT1基因的表达和功能还与细胞代谢、RNA修饰和DNA甲基化等生物学过程密切相关。深入研究SHMT1基因的功能和调控机制,有助于我们更好地理解这些疾病的发病机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Nazari Mehrabani, Seyede Zahra, Shushizadeh, Mohammad Hossein, Abazari, Mohammad Foad, Abdollahzadeh, Rasoul, Azarnezhad, Asaad. 2018. Association of SHMT1, MAZ, ERG, and L3MBTL3 Gene Polymorphisms with Susceptibility to Multiple Sclerosis. In Biochemical genetics, 57, 355-370. doi:10.1007/s10528-018-9894-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30456721/
2. Yang, Yang, Zhang, Minghui, Zhao, Yaxuan, Tian, Geng, Zhang, Yin. 2023. HOXD8 suppresses renal cell carcinoma growth by upregulating SHMT1 expression. In Cancer science, 114, 4583-4595. doi:10.1111/cas.15982. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37752684/
3. Wang, Qianqian, Lu, Kai, Du, Haina, Hua, Yibing, Zhu, Lingjun. 2014. Association between cytosolic serine hydroxymethyltransferase (SHMT1) gene polymorphism and cancer risk: a meta-analysis. In Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie, 68, 757-62. doi:10.1016/j.biopha.2014.08.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25194438/
4. Han, Tianyu, Wang, Yanan, Cheng, Minzhang, Wang, Keru, Wang, Jianbin. 2024. Phosphorylated SHMT2 Regulates Oncogenesis Through m6A Modification in Lung Adenocarcinoma. In Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany), 11, e2307834. doi:10.1002/advs.202307834. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38460155/
5. Situ, Yongli, Zhang, Juying, Liao, Wenyu, Shao, Zheng, Deng, Li. . SHMT as a Potential Therapeutic Target for Renal Cell Carcinoma. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 28, 196. doi:10.31083/j.fbl2809196. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37796681/
6. Mezginejad, Fateme, Mohammadi, Mohammad Hossein, Khadem, Parinaz, Farsani, Mehdi Allahbakhshian. 2020. Evaluation of LKB1 and Serine-Glycine Metabolism Pathway Genes (SHMT1 and GLDC) Expression in AML. In Indian journal of hematology & blood transfusion : an official journal of Indian Society of Hematology and Blood Transfusion, 37, 249-255. doi:10.1007/s12288-020-01329-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33867731/
7. Bahari, G, Hashemi, M, Naderi, M, Sadeghi-Bojd, S, Taheri, M. 2016. Association of SHMT1 gene polymorphisms with the risk of childhood acute lymphoblastic leukemia in a sample of Iranian population. In Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France), 62, 45-51. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26950450/
8. Wang, Junnan, Gu, Junqing, Huang, Yi, Fang, Yuanjian, Lin, Jinhui. 2021. The association between serine hydroxymethyl transferase 1 gene hypermethylation and ischemic stroke. In Bosnian journal of basic medical sciences, 21, 454-460. doi:10.17305/bjbms.2020.5188. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33259775/
9. Beaudin, Anna E, Abarinov, Elena V, Noden, Drew M, Allen, Robert H, Stover, Patrick J. 2011. Shmt1 and de novo thymidylate biosynthesis underlie folate-responsive neural tube defects in mice. In The American journal of clinical nutrition, 93, 789-98. doi:10.3945/ajcn.110.002766. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21346092/