Clec11a-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Clec11a-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04203

品系全称

C57BL/6JCya-Clec11aem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-20256-Clec11a-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Clec11a-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04203) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
C-type lectin domain family 11, member a
基因别称
Clecsf3,Scgf
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_009131 | Ensembl: ENSMUST00000004587
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~4
敲除长度
~2.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1298219Mice homozygous for a knock-out allele exhibit decreased bone volume in limb bones and vertebrae, reduced bone strength, and delayed fracture healing. Bone marrow stromal cells display impaired osteogenic differentiation.
Clec11a,即C型凝集素结构域家族11成员A,是一种编码分泌型糖蛋白的基因。该基因产物含有两个整合素结合基序,RGD(精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸)和LDT(亮氨酸-天冬氨酸-苏氨酸),以及一个假定的亮氨酸拉链域和一个功能性的C型凝集素结构域。Clec11a在调节造血分化和稳态方面发挥着重要作用,并对严重疟疾贫血和脂毒性具有保护作用。此外,Clec11a还促进间充质前体细胞向成熟成骨细胞的分化,在维持成年骨骼、年龄相关骨丢失和骨折修复中起着关键作用[2]。

在癌症领域,Clec11a的研究主要集中在急性髓系白血病(AML)中。一项研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了儿童AML骨髓样本,并揭示了与AML细胞相关的7基因特征(CLEC11A、PRAME、AZU1、NREP、ARMH1、C1QBP、TRH)。该研究表明,与复发相关的样本在诊断时具有更多耗竭的T细胞,而与持续完全缓解(CCR)相关的样本具有更多炎症M1巨噬细胞。治疗后,残留的AML细胞过度表达脂肪酸氧化、肿瘤生长和干细胞基因。此外,与复发相关的治疗后T细胞簇下调MHC I类和T细胞调节基因[1]。

另一项研究发现,Clec11a表达与AML患者的预后相关。在多个公共数据库中,CLEC11A表达在白血病中更高。TCGA数据表明,高CLEC11A表达与良好预后相关(总生存期p值=2e-04;事件无进展生存期p值=6e-04),在GSE6891中得到了验证(总生存期p值=0;事件无进展生存期p值=0;无复发生存期p值=2e-03)。CLEC11A的DNA甲基化水平与其表达呈负相关,高CLEC11A甲基化水平组与较差的预后相关(总生存期p值=1e-02;事件无进展生存期p值=2e-02)。同时,CLEC11A高甲基化与较差的诱导缓解率和生存率相关。生物信息学分析也表明,CLEC11A在白血病发生中是一个上调基因。CLEC11A可能用作预后生物标志物,通过提供精确的治疗指示来有益于AML患者,其独特的基因模式有助于进一步理解AML的异质性机制[3]。

除了AML,Clec11a在其他癌症中的表达和功能也得到了研究。一项研究发现,CLEC11A表达在胃癌中显著升高,与较差的生存结果和晚期临床病理阶段相关。此外,CLEC11A表达与免疫调节剂、趋化因子和免疫细胞浸润呈正相关,尤其是M2巨噬细胞。CLEC11A沉默抑制了胃癌细胞在体外增殖、迁移和侵袭。这些结果表明CLEC11A在胃癌中的作用,并提示其作为胃癌免疫治疗的有价值预后生物标志物和治疗靶点的潜力[4]。

综上所述,Clec11a是一种重要的基因,参与调节造血分化和稳态,在维持成年骨骼和年龄相关骨丢失中发挥关键作用。在癌症领域,Clec11a与AML的预后相关,并在胃癌中表现出预后价值。进一步研究CLEC11A的功能和机制,有助于深入理解其在疾病发生中的作用,并为癌症的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Mumme, Hope, Thomas, Beena E, Bhasin, Swati S, Graham, Douglas K, Bhasin, Manoj. 2023. Single-cell analysis reveals altered tumor microenvironments of relapse- and remission-associated pediatric acute myeloid leukemia. In Nature communications, 14, 6209. doi:10.1038/s41467-023-41994-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37798266/
2. Wang, Miao, Guo, Jianmin, Zhang, Lingli, Xu, Jiake, Zou, Jun. 2020. Molecular structure, expression, and functional role of Clec11a in skeletal biology and cancers. In Journal of cellular physiology, 235, 6357-6365. doi:10.1002/jcp.29600. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32003015/
3. Yin, Chengliang, Zhang, Junyan, Guan, Wei, Wu, Rilige, Li, Yan. 2021. High Expression of CLEC11A Predicts Favorable Prognosis in Acute Myeloid Leukemia. In Frontiers in oncology, 11, 608932. doi:10.3389/fonc.2021.608932. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33747924/
4. Fang, Weidan, Wan, Dewen, Yu, Yi, Zhang, Ling. 2024. CLEC11A expression as a prognostic biomarker in correlation to immune cells of gastric cancer. In Biomolecules & biomedicine, 24, 101-124. doi:10.17305/bb.2023.9384. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37597212/