Sap18-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Sap18-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04190

品系全称

C57BL/6JCya-Sap18em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-20220-Sap18-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Sap18-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04190) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
Sin3-associated polypeptide 18
基因别称
C530046K05Rik,D11Ertd539e,EMegR4,Sap18a,Sinbp1
染色体号
Chr 14 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_009119.3 | Ensembl: ENSMUST00000128764
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~4
敲除长度
~3850 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Sap18,即Sin3相关蛋白18,是一种高度保守的蛋白质,最初在转录调控蛋白Sin3的复合物中发现。研究表明,Sap18与Sin3结合,参与转录抑制,作用于胚胎发育、应激反应、人类免疫缺陷病毒1型复制和肿瘤发生等基因的转录抑制。此外,Sap18还是外显子连接复合物(EJC)相关凋亡和剪接相关蛋白(ASAP)/PNN-RNPS1-SAP18(PSAP)复合物的组成部分,介导选择性剪接事件,并抑制外显子-外显子连接区域附近的隐秘剪接位点。Sap18的双重功能使其在转录调控和mRNA剪接中发挥着重要作用。

在果蝇中,Sap18是母系基因bicoid的一部分,负责头部模式形成。bicoid蛋白在果蝇头部形成前后浓度梯度,并与DNA结合,刺激头部特异性基因的转录。Sap18作为Sin3/Rpd3组蛋白脱乙酰酶复合物的一部分,对于bicoid介导的头部特异性基因表达的抑制至关重要。Sap18的缺失导致胚胎头部发育缺陷,表明Sap18在头部模式形成中的重要作用[1]。

在人类中,Sap18与肿瘤浸润性CD8+ T细胞有关,并可能作为ccRCC预后的潜在生物标志物。研究表明,Sap18的表达与ccRCC患者的预后相关,Sap18的降低与患者预后改善相关。此外,Sap18还与ccRCC中的Atg7+中性粒细胞呈负相关,表明Sap18可能在自噬和脂肪酸代谢中发挥重要作用[2]。

Sap18还是凋亡和剪接相关蛋白(ASAP)复合物的一部分,参与RNA代谢,包括转录、剪接、翻译和无义介导的mRNA降解(NMD)。ASAP复合物由RNPS1、Acinus和Sap18组成,其中RNPS1参与防止R环的形成,而Acinus和Sap18通过组蛋白脱乙酰酶抑制转录。在剪接过程中,ASAP复合物的单个组分RNPS1和Acinus作为剪接激活剂,而ASAP复合物本身在体外实验中表现为剪接抑制剂。此外,ASAP复合物的单个成员与EJC相关,在剪接和翻译中发挥作用。RNPS1通过参与mRNA的3'端加工和聚核糖体结合,提高翻译效率。在NMD过程中,RNPS1通过与EJC相互作用,帮助招募降解因子[3]。

在拟南芥中,Sap18参与发育和热应激耐受的调控。Sap18是拟南芥核凋亡和剪接相关蛋白(ASAP)复合物的核心成分,参与与叶片发育相关的基因的精确剪接。遗传分析进一步证实了Sap18在包括叶片形态发生和开花时间在内的不同发育过程中的关键作用。有趣的是,在热休克过程中,Sap18从细胞核转移到细胞质应激颗粒和加工体。Sap18功能缺失突变体的热敏感表型揭示了Sap18在植物热保护中的新作用[4]。

Sap18还参与组蛋白脱乙酰化介导的转录抑制。在酵母和哺乳动物系统中,Sap18与组蛋白脱乙酰酶(如HDA1)和其他蛋白质(如SIN3、SAP18、SAP30和RbAp46)相互作用,形成组蛋白脱乙酰化复合物,介导组蛋白的脱乙酰化,从而抑制基因转录。研究表明,Sap18的缺失导致植物对盐胁迫的敏感性增加,并影响叶绿素的合成。此外,Sap18和HDA1正调控因子与乙烯响应元件结合因子(ERFs)相互作用,形成激素敏感的多聚体抑制复合物,在环境胁迫条件下特异性地介导信号传导和转录抑制[5]。

Sap18还与TRIB1相互作用,调节微囊泡三酰甘油转移蛋白(MTTP)的表达。TRIB1是一种哺乳动物tribbles同源物,与血浆脂质水平和非酒精性脂肪肝疾病的发生有关。研究发现,Sap18是TRIB1的新的结合伙伴。在肝脏中敲低Sap18的表达降低了血浆脂质水平,并增加了肝脂质水平;Sap18的过表达则产生了相反的效果。转录组分析表明,Sap18的敲低降低了MTTP的表达水平,而Sap18的过表达则增加了MTTP的表达水平。染色质免疫沉淀分析显示,Sap18与TRIB1和mSin3A相互作用,增强了MTTP调控元件的富集,从而提高了MTTP的表达水平[6]。

Sap18还促进Kruppel依赖性转录抑制,通过增强子特异性组蛋白脱乙酰化。Kruppel是果蝇早期胚胎发育中的关键转录因子,通过与pair rule基因的增强子元件相互作用,抑制其转录。研究发现,Sap18可以与Kruppel相互作用,并支持Kruppel依赖性抑制。遗传相互作用研究、药理学和生化方法表明,Kruppel通过将Sap18结合的组蛋白脱乙酰化复合物1 tether到不同的增强子元件上,导致组蛋白H3脱乙酰化,从而抑制基因的转录[7]。

最后,Sap18与SIN3和SIRT3相互作用,参与T细胞淋巴瘤的抑制。SIN3抑制复合物和NAD依赖性脱乙酰酶SIRT3控制细胞生长、发育和恶性转化。研究发现,C21类固醇衍生物A671可以抑制小鼠和人T细胞淋巴瘤和红白血病在体外和临床前模型中的生长。A671通过直接与SIN3抑制复合物亚基Sap18相互作用,稳定和激活Sap18,导致SIRT3转录抑制,从而抑制细胞增殖和细胞死亡。肿瘤细胞对A671的耐药性与Sap18活性的降低和SIRT3表达的持续相关。这些结果表明,Sap18-SIN3-SIRT3轴可以作为一种药物靶点,通过C21类固醇化合物抑制T细胞淋巴瘤和其他恶性肿瘤的生长[8]。

综上所述,Sap18是一种多功能蛋白质,参与转录抑制、mRNA剪接、热应激响应、组蛋白脱乙酰化和T细胞淋巴瘤抑制等多种生物学过程。Sap18的研究对于深入理解基因表达调控和疾病发生机制具有重要意义,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Singh, Navjot, Zhu, Wencheng, Hanes, Steven D. . Sap18 is required for the maternal gene bicoid to direct anterior patterning in Drosophila melanogaster. In Developmental biology, 278, 242-54. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15649476/
2. Wang, Jie, Huang, Feifan, Zhao, Jingjie, Lu, Heming, Meng, Lingzhang. 2022. Tumor-Infiltrated CD8+ T Cell 10-Gene Signature Related to Clear Cell Renal Cell Carcinoma Prognosis. In Frontiers in immunology, 13, 930921. doi:10.3389/fimmu.2022.930921. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35812454/
3. Deka, Bhagyashree, Singh, Kusum Kumari. 2017. Multifaceted Regulation of Gene Expression by the Apoptosis- and Splicing-Associated Protein Complex and Its Components. In International journal of biological sciences, 13, 545-560. doi:10.7150/ijbs.18649. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28539829/
4. Larran, Alvaro Santiago, Ge, Jingyu, Martín, Guiomar, Dagdas, Yasin, Qüesta, Julia Irene. 2024. Nucleo-cytoplasmic distribution of SAP18 reveals its dual function in splicing regulation and heat-stress response in Arabidopsis. In Plant communications, 6, 101180. doi:10.1016/j.xplc.2024.101180. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39482883/
5. Zhang, Y, Iratni, R, Erdjument-Bromage, H, Tempst, P, Reinberg, D. . Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex. In Cell, 89, 357-64. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9150135/
6. Makishima, Saho, Boonvisut, Supichaya, Ishizuka, Yuumi, Nakayama, Kazuhiro, Iwamoto, Sadahiko. 2015. Sin3A-associated protein, 18 kDa, a novel binding partner of TRIB1, regulates MTTP expression. In Journal of lipid research, 56, 1145-52. doi:10.1194/jlr.M057802. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25921304/
7. Matyash, Alexey, Singh, Navjot, Hanes, Steven D, Urlaub, Henning, Jäckle, Herbert. 2008. SAP18 promotes Krüppel-dependent transcriptional repression by enhancer-specific histone deacetylation. In The Journal of biological chemistry, 284, 3012-3020. doi:10.1074/jbc.M806163200. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19049982/
8. Gajendran, Babu, Varier, Krishnapriya M, Liu, Wuling, Hao, XiaoJiang, Ben-David, Yaacov. 2020. A C21-steroidal derivative suppresses T-cell lymphoma in mice by inhibiting SIRT3 via SAP18-SIN3. In Communications biology, 3, 732. doi:10.1038/s42003-020-01458-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33273692/