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Rps16-KO 基因敲除小鼠

Rps16-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Rps16-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04147

品系全称

C57BL/6JCya-Rps16em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-20055-Rps16-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Rps16-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04147) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ribosomal protein S16
基因别称
-
染色体号
Chr 7 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_013647 | Ensembl: ENSMUST00000082134
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~2.0 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
Rps16，也称为ribosomal protein S16，是核糖体蛋白家族中的一员，负责参与蛋白质的合成。核糖体蛋白是核糖体的重要组成部分，核糖体是细胞中负责蛋白质合成的分子机器。Rps16在真核细胞和原核细胞中都有发现，但在真核细胞中，Rps16通常具有更长的N末端结构域（NTD），这是细菌同源蛋白所没有的，可能有助于真核细胞在蛋白质合成启动阶段的特定反应[5]。

Rps16基因在高等植物的叶绿体基因组中广泛存在，但在某些植物中，如Medicago truncatula和Populus alba，叶绿体基因组中已经失去了rps16基因。这些植物通过从线粒体基因组中获取rps16基因，并赋予其双重靶向信号，使其能够同时定位到叶绿体和线粒体，来补偿叶绿体基因组中rps16基因的缺失[1]。这表明，RPS16的双重靶向能力在单子叶植物和双子叶植物分化之前就已经出现，大约在1.4亿到1.5亿年前[1]。

在动物中，例如小鼠，Rps16基因的启动子区域已被研究。通过转染实验和凝胶迁移实验，研究人员发现Rps16基因的启动子区域包含多个功能重要的元件，这些元件与特定的核因子结合位点相关，对于Rps16基因的表达至关重要[2]。

此外，Rps16基因的表达也受到microRNA的调控。例如，在流感病毒感染中，microRNA let-7的表达会显著减少，而过表达let-7可以增加干扰素的表达并抑制流感病毒感染。let-7通过靶向RPS16基因的3'非翻译区（UTR），降低其表达，从而增强I型干扰素反应，抑制病毒复制[3]。

在Euphorbia schimperi的叶绿体基因组中，rps16基因已经丢失，并被假基因化。然而，核基因组的转录组数据表明，rps16基因已经被转移到核基因组中，并且产生了双重靶向线粒体和叶绿体的RPS16蛋白副本[4]。这表明，叶绿体基因向核基因组的转移和替换是细胞器基因组进化中的一个重要过程。

在Hypericum ascyron的叶绿体基因组中，rps16基因也丢失了，并被核编码的同源基因所替代[6]。同时，叶绿体基因组中还发生了多个基因丢失、基因重组和加速的替换率，这些变化可能与叶绿体基因组的结构和功能进化有关。

在Lupinus属的植物中，rps16基因的功能性丢失也被发现，并被核编码的rps16基因所替代，该基因编码的RPS16蛋白具有双重靶向线粒体和叶绿体的能力[7]。这表明，叶绿体基因向核基因组的转移和替换是植物基因组进化的一个普遍现象。

在人类中，pogo转座元件衍生的具有KRAB结构域的POGK蛋白被发现具有肿瘤抑制活性。POGK通过与共抑制因子TRIM28结合，直接阻断核糖体基因RPS16和RPS29的转录，从而广泛抑制核糖体的生物合成。这表明，RPS16基因的表达与肿瘤的发生和发展密切相关[8]。

综上所述，Rps16基因在真核细胞和原核细胞中都有发现，但在真核细胞中通常具有更长的N末端结构域，可能有助于真核细胞在蛋白质合成启动阶段的特定反应。Rps16基因的表达受到多种因素的调控，包括基因启动子区域的功能元件、microRNA的调控以及细胞器基因组的进化过程。此外，RPS16蛋白的表达与肿瘤的发生和发展密切相关。Rps16基因的研究有助于深入理解蛋白质合成和基因表达的调控机制，以及细胞器基因组的进化过程，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Ueda, Minoru, Nishikawa, Tomotaro, Fujimoto, Masaru, Tsutsumi, Nobuhiro, Kadowaki, Koh-Ichi. 2008. Substitution of the gene for chloroplast RPS16 was assisted by generation of a dual targeting signal. In Molecular biology and evolution, 25, 1566-75. doi:10.1093/molbev/msn102. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18453549/
2. Hariharan, N, Perry, R P. . A characterization of the elements comprising the promoter of the mouse ribosomal protein gene RPS16. In Nucleic acids research, 17, 5323-37. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/2762128/
3. Wu, Wenjiao, Wang, Chao, Xia, Changliang, Liu, Shuwen, Mei, Qinghua. 2022. MicroRNA let-7 Suppresses Influenza A Virus Infection by Targeting RPS16 and Enhancing Type I Interferon Response. In Frontiers in cellular and infection microbiology, 12, 904775. doi:10.3389/fcimb.2022.904775. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35873150/
4. Alqahtani, Aldanah A, Jansen, Robert K. 2021. The evolutionary fate of rpl32 and rps16 losses in the Euphorbia schimperi (Euphorbiaceae) plastome. In Scientific reports, 11, 7466. doi:10.1038/s41598-021-86820-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33811236/
5. Ghosh, Arnab, Jindal, Supriya, Bentley, Amber A, Hinnebusch, Alan G, Komar, Anton A. 2014. Rps5-Rps16 communication is essential for efficient translation initiation in yeast S. cerevisiae. In Nucleic acids research, 42, 8537-55. doi:10.1093/nar/gku550. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24948608/
6. Claude, Sivagami-Jean, Park, Seongjun, Park, SeonJoo. 2022. Gene loss, genome rearrangement, and accelerated substitution rates in plastid genome of Hypericum ascyron (Hypericaceae). In BMC plant biology, 22, 135. doi:10.1186/s12870-022-03515-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35321651/
7. Keller, J, Rousseau-Gueutin, M, Martin, G E, Cabello-Hurtado, F, Aïnouche, A. . The evolutionary fate of the chloroplast and nuclear rps16 genes as revealed through the sequencing and comparative analyses of four novel legume chloroplast genomes from Lupinus. In DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes, 24, 343-358. doi:10.1093/dnares/dsx006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28338826/
8. Tu, Zhenbo, Bassal, Mahmoud A, Bell, George W, Tenen, Daniel G, Karnoub, Antoine E. 2024. Tumor-suppressive activities for pogo transposable element derived with KRAB domain via ribosome biogenesis restriction. In Molecular cell, 84, 4209-4223.e6. doi:10.1016/j.molcel.2024.09.025. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39481384/

资料下载

S-KO-04147_6J_20055_Rps16_Exon 3~5_strategy.pdf
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