Dpf2-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Dpf2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04079

品系全称

C57BL/6JCya-Dpf2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-19708-Dpf2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Dpf2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04079) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
double PHD fingers 2
基因别称
2210010M07Rik,BAF45D,Req,ubi-d4
染色体号
Chr 19 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001291078 | Ensembl: ENSMUST00000118623
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~11
敲除长度
~5.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:109529Mice homozygous for a floxed allele are viable and fertile.
Dpf2,也称为Double plant homeodomain finger 2,是SWI/SNF染色质重塑复合体BAF(Brahma-associated factor)的一个重要亚基。该基因编码的蛋白含有两个PHD结构域,能够识别并结合特定的组蛋白尾部修饰,参与调控基因的表达和染色质结构。Dpf2在多种生物学过程中发挥重要作用,包括造血、炎症反应、神经元分化、肿瘤发生和发育等。

研究表明,Dpf2在造血过程中发挥重要作用。在应急造血过程中,Dpf2-KO小鼠出现白细胞减少、严重贫血和系统性炎症,表现出与临床高炎症状态相似的特征。Dpf2缺失导致NRF2控制的增强子中BAF催化亚基BRG1丢失,从而影响抗氧化和抗炎基因的表达,导致慢性炎症的发生[1]。

Dpf2在肿瘤发生中也发挥重要作用。Dpf2可以读取组蛋白乳酸化修饰,促进基因转录和细胞生存。在宫颈癌细胞中,乳酸积累导致组蛋白乳酸化修饰增强,Dpf2与H3K14la结合,共同促进肿瘤相关基因的表达和细胞生存[2]。此外,Dpf2高表达与肝细胞癌的不良预后相关,可能与肿瘤免疫平衡的破坏和免疫逃逸有关[5]。

Dpf2在神经元分化中也发挥重要作用。Dpf2的剪接变异体在胚胎干细胞(ESCs)和神经元前体细胞中具有不同的表达模式和结合位点。在ESCs中,Dpf2-S亚型主要与多能性因子结合,而在神经元前体细胞中,Dpf2-L亚型主要与CTCF结合。这些不同的结合模式影响BAF复合体的靶向,进而影响染色质组织和神经元分化[3]。

Dpf2的突变与多种神经发育综合征相关,如Coffin-Siris综合征(CSS)。CSS是一种多系统智力障碍综合征,表现为经典的畸形特征、发育迟缓和器官系统异常。Dpf2基因突变导致CSS的发生,表现为发育迟缓、智力障碍、语言障碍和指甲、脚趾甲发育不良等特征[4,6,8]。

Dpf2在维持胚胎干细胞的自我更新和分化潜能中也发挥重要作用。Dpf2与Oct4、Sox2、p300和Brg1等因子共同占据增强子区域,维持Tbx3的表达和内胚层分化。PRC2复合体的亚基Eed与Tbx3基因的内基因增强子结合,抑制Dpf2依赖的Tbx3表达和内胚层分化。PRC2复合体的亚基Ezh2也通过抑制Nanog的表达,影响Dpf2依赖的分化[7]。

综上所述,Dpf2在多种生物学过程中发挥重要作用,包括造血、炎症反应、神经元分化、肿瘤发生和发育等。Dpf2的突变与多种神经发育综合征相关,如Coffin-Siris综合征。Dpf2的研究有助于深入理解染色质重塑和基因表达调控的机制,为相关疾病的诊断、治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Mas, Gloria, Man, Na, Nakata, Yuichiro, Bilbao, Daniel, Nimer, Stephen D. 2023. The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 facilitates NRF2-dependent antiinflammatory and antioxidant gene expression. In The Journal of clinical investigation, 133, . doi:10.1172/JCI158419. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37200093/
2. Zhai, Guijin, Niu, Ziping, Jiang, Zixin, Han, Yanpu, Zhang, Kai. 2024. DPF2 reads histone lactylation to drive transcription and tumorigenesis. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 121, e2421496121. doi:10.1073/pnas.2421496121. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39636855/
3. Nazim, Mohammad, Lin, Chia-Ho, Feng, An-Chieh, Smale, Stephen T, Black, Douglas L. . Alternative splicing of a chromatin modifier alters the transcriptional regulatory programs of stem cell maintenance and neuronal differentiation. In Cell stem cell, 31, 754-771.e6. doi:10.1016/j.stem.2024.04.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38701759/
4. Vasko, Ashley, Drivas, Theodore G, Schrier Vergano, Samantha A. 2021. Genotype-Phenotype Correlations in 208 Individuals with Coffin-Siris Syndrome. In Genes, 12, . doi:10.3390/genes12060937. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34205270/
5. Yang, Kejian, Nong, Jusen, Xie, Haixiang, Zhu, Guangzhi, Peng, Tao. 2024. DPF2 overexpression correlates with immune infiltration and dismal prognosis in hepatocellular carcinoma. In Journal of Cancer, 15, 4668-4685. doi:10.7150/jca.97437. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39006087/
6. Milone, Roberta, Gnazzo, Maria, Stefanutti, Elena, Serafin, Dorella, Novelli, Antonio. 2019. A new missense mutation in DPF2 gene related to Coffin Siris syndrome 7: Description of a mild phenotype expanding DPF2-related clinical spectrum and differential diagnosis among similar syndromes epigenetically determined. In Brain & development, 42, 192-198. doi:10.1016/j.braindev.2019.10.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31706665/
7. Zhang, Wensheng, Chronis, Constantinos, Chen, Xi, Sahlén, Pelin, Plath, Kathrin. . The BAF and PRC2 Complex Subunits Dpf2 and Eed Antagonistically Converge on Tbx3 to Control ESC Differentiation. In Cell stem cell, 24, 138-152.e8. doi:10.1016/j.stem.2018.12.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30609396/
8. Knapp, Karen M, Poke, Gemma, Jenkins, Danielle, Truter, Werner, Bicknell, Louise S. 2019. Expanding the phenotypic spectrum associated with DPF2: A new case report. In American journal of medical genetics. Part A, 179, 1637-1641. doi:10.1002/ajmg.a.61262. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31207137/