Rbmx-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Rbmx-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-04056

品系全称

C57BL/6JCya-Rbmxem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-19655-Rbmx-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rbmx-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-04056) were purchased from Cyagen.
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基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RNA binding motif protein, X chromosome
基因别称
hnRNP G
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001166623.1 | Ensembl: ENSMUST00000114726
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~9
敲除长度
~4588 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
RBMX,即RNA结合基序蛋白X连锁,是一种位于X染色体上的核RNA结合蛋白。它属于一个小的蛋白质家族,该家族的其他成员由哺乳动物Y染色体和其他染色体上的同源基因编码。RBMX家族蛋白在正常发育中起着重要作用,并与癌症和病毒感染有关。在分子水平上,RBMX家族蛋白有助于剪接控制、转录和基因组完整性。了解RBMX及其同源基因控制的内源基因和途径将对理解染色体生物学、DNA修复和哺乳动物发育具有重要意义。

RBMX及其同源基因在多种疾病中发挥着重要作用。在急性髓系白血病(AML)中,RBMX和其逆基因RBMXL1被发现是小鼠和人髓系白血病发生所必需的。与正常个体相比,AML原发性患者中RBMX/L1的表达升高,而RBMX/L1的缺失则延迟了白血病的发展。RBMX/L1的缺失导致染色质可及性的显著变化,以及染色体的断裂和间隙。研究发现,RBMX/L1直接结合到mRNA上,影响多个位点的转录,包括CBX5(HP1α),并控制CBX5位点的起始转录。强制CBX5表达挽救了RBMX/L1耗尽对细胞生长和凋亡的影响。总的来说,RBMX/L1通过其下游靶点CBX5调节染色质状态来控制白血病细胞的存活,这些发现揭示了RNA结合蛋白(RBPs)直接促进转录的机制,并表明RBMX/L1和CBX5可能是髓系恶性肿瘤的潜在治疗靶点[1]。

RBMX基因在斑马鱼脑发育中也起着至关重要的作用。斑马鱼rbmx在胚胎发育过程中广泛表达,在胚胎发育的后期阶段,rbmx转录本主要定位于大脑、鳃弓和肝原基。RBMX的功能在胚胎发育过程中通过使用针对rbmx的antisense morpholino进行了研究。RBMX-morphants表现出头部和眼睛发育不全、体型缩小、体节模式缺陷和颌骨缺失。此外,在功能缺失rbmx的情况下,前脑和后脑的特异性标记表达(otx2,krox20)显著降低。这些研究表明,RBMX对正常胚胎发育至关重要,尤其是在大脑发育方面,这与X连锁智力障碍的作用一致[2]。

RBMX还参与了端粒稳定性的维持。端粒重复RNA(TERRA)是一类从染色体的端粒区域转录的长非编码RNA(lncRNA)。TERRA倾向于在端粒处形成R环结构,通过侵入端粒DNA。过度的端粒R环导致端粒不稳定,因此TERRA水平需要得到精细的调节。然而,控制TERRA水平的分子机制和因素仍 largely 未知。研究表明,RNA结合蛋白RBMX是TERRA水平和端粒完整性的新型调节因子。RBMX耗尽细胞的TERRA表达水平显著升高,导致端粒R环形成增强、复制应激和端粒不稳定。RBMX还与TERRA和核外体靶向蛋白ZCCHC8同时结合,并且在RBMX耗尽的情况下,TERRA的降解减慢,这表明RBMX通过调节其转运到核外体来促进TERRA的降解,核外体降解核RNA。总的来说,这些发现揭示了RBMX在TERRA表达调节和端粒完整性维持中的新作用,并将RBMX作为癌症治疗的潜在靶点[3]。

RBMX基因也被认为与X连锁智力障碍综合征(XLID)有关。在一项研究中,研究人员发现了一个23bp的移码缺失,位于RBMX基因中,该基因位于Xq26,在受影响的男性中存在,而在未受影响的男性和对照组数据库中不存在。RBMX基因的功能丧失导致异常的大脑发育,这些发现表明RBMX是XLID的候选基因[5]。

此外,RBMX与肿瘤的发生和发展也有关。在一项研究中,研究人员报告了一种新的RBMX-TFE3基因融合,该融合发生在Xp11易位血管周围上皮样细胞肿瘤(PEComa)中。这种肿瘤发生在一名健康的12岁男孩身上,他出现了一个大的左肾肿块,并扩展到下腔静脉。该患者被诊断为多发肺部转移,并在诊断后的3个月死亡。该肿瘤的形态(上皮样透明细胞,具有肺泡和巢状结构)和免疫表型(TFE3和HMB45强阳性;肌动蛋白、结蛋白和PAX8阴性)与Xp11易位PEComa一致。然而,TFE3重排最初没有通过常规TFE3断裂荧光原位杂交(FISH)检测到。进一步的RNA测序揭示了新的RBMX-TFE3基因融合,随后通过融合检测FISH得到证实,使用定制的RBMX和TFE3融合探针。该报告描述了一种新的TFE3基因融合伙伴,RBMX,在儿科肾PEComa患者中与爆发性临床过程相关。正如其他内染色体Xp11.2易位中所记录的,如与NONO、RBM10或GRIPAP1基因的融合,TFE3断裂可能低于FISH分辨率,导致假阴性结果[4]。

RBMX的表达也与结直肠癌的预后有关。在一项研究中,研究人员发现RBMX在结直肠癌组织中的表达显著高于正常结肠组织。高RBMX表达患者的总生存期(OS)显著低于低表达患者(P=0.04)。RBMX基因的蛋白表达显示出拷贝数扩增、突变和深度缺失。RBMX表达水平与滤泡辅助性T细胞、嗜酸性粒细胞和初始B细胞水平呈正相关(P<0.05)。与RBMX表达显著正相关基因包括HNRNPA1L2、SFRS13A、HNRNPA1等,这些基因主要富集于细胞分裂、mRNA剪接、RNA结合和mRNA 3'-UTR结合等生物学过程。RBMX可能作为ESCA预后不良的生物标志物。RBMX与ESCA患者的生存和预后、基因突变和免疫细胞浸润密切相关[6]。

综上所述,RBMX是一种重要的RNA结合蛋白,在多种生物学过程中发挥着重要作用。RBMX及其同源基因在正常发育、染色质状态维持、端粒稳定性维持、疾病发生和发展中发挥着重要作用。RBMX的研究有助于深入理解RNA结合蛋白的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Prieto, Camila, Nguyen, Diu T T, Liu, Zhaoqi, Rabadan, Raul, Kharas, Michael G. 2021. Transcriptional control of CBX5 by the RNA binding proteins RBMX and RBMXL1 maintains chromatin state in myeloid leukemia. In Nature cancer, 2, 741-757. doi:10.1038/s43018-021-00220-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34458856/
2. Tsend-Ayush, Enkhjargal, O'Sullivan, Lynda A, Grützner, Frank S, Marshall Graves, Jennifer A, Ward, Alister C. . RBMX gene is essential for brain development in zebrafish. In Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists, 234, 682-8. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15895365/
3. Liu, Jingfan, Zheng, Tian, Chen, Dandan, Ma, Wenbin, Liu, Haiying. 2023. RBMX involves in telomere stability maintenance by regulating TERRA expression. In PLoS genetics, 19, e1010937. doi:10.1371/journal.pgen.1010937. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37756323/
4. Argani, Pedram, Zhang, Lei, Sung, Yun-Shao, Dickson, Brendan, Antonescu, Cristina R. 2019. A novel RBMX-TFE3 gene fusion in a highly aggressive pediatric renal perivascular epithelioid cell tumor. In Genes, chromosomes & cancer, 59, 58-63. doi:10.1002/gcc.22801. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31408245/
5. Shashi, V, Xie, P, Schoch, K, Allen, A, Need, A C. 2014. The RBMX gene as a candidate for the Shashi X-linked intellectual disability syndrome. In Clinical genetics, 88, 386-90. doi:10.1111/cge.12511. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25256757/
6. Tuersun, Hainisayimu, Liu, Ling, Zhang, Jing, Tang, Xiaohui, Li, Hui. 2023. m6A reading protein RBMX as a biomarker for prognosis and tumor progression in esophageal cancer. In Translational cancer research, 12, 2319-2335. doi:10.21037/tcr-23-84. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37859733/