OGDH,即2-氧戊二酸脱氢酶,是一种在细胞代谢中发挥关键作用的酶,编码该酶的基因也被称为OGDH基因。OGDH是三羧酸循环(TCA循环)中的一个关键酶,该循环是细胞能量代谢的核心过程之一,负责将有机分子转化为细胞能量。OGDH催化α-酮戊二酸转化为琥珀酰辅酶A,这一过程对于维持细胞能量代谢至关重要。OGDH的活性受到多种因素的调控,包括酶的转录水平、翻译后修饰以及细胞内代谢物的浓度等。
OGDH基因的功能异常与多种疾病的发生发展密切相关。例如,OGDH基因的突变可以导致2-氧戊二酸脱氢酶缺乏症,这是一种罕见的遗传代谢性疾病,患者通常表现为发育迟缓、肌张力低下、运动障碍和代谢紊乱等症状[2]。此外,OGDH基因的表达水平也与癌症的发生发展有关。研究发现,在胶质母细胞瘤(GBM)中,OGDH基因的表达对于肿瘤生长至关重要[1]。通过使用CRISPR和RNAi技术筛选,研究者发现OGDH基因是GBM生长所必需的。此外,OGDH功能的缺失与Bcl-xL抑制剂的联合使用在GBM患者来源的异种移植瘤和神经球GBM细胞中表现出协同致死效应。CPI-613介导的能量剥夺驱动了一个整合应激反应,并以ATF4依赖性方式上调了BH3-only结构域蛋白Noxa的表达,遗传功能缺失实验证实了这一点。一致地,Noxa的沉默降低了CPI-613在GBM模型系统中诱导的细胞死亡。在小鼠GBM患者来源的异种移植瘤模型中,ABT263和CPI-613的联合治疗比单独使用任何一种化合物都更有效地抑制了肿瘤生长并延长了动物的存活时间。
此外,OGDH基因的表达也与黑色素瘤的免疫治疗疗效有关。研究发现,OGDH的抑制可以显著提高抗PD-1免疫治疗的疗效[3]。PDHA1和OGDH是TCA循环中的关键酶,它们在黑色素瘤中的表达显著升高,并且与抗PD-1疗效呈负相关。抑制PDHA1和OGDH可以通过AMPK-CREB-ATF3信号通路显著提高PD-L1的表达和糖酵解通量,从而提高免疫治疗的疗效。
OGDH基因的表达还与多能性干细胞的维持有关。研究发现,TCA循环酶包括PDHA1、PCB、ACO2、CS、IDH3A、OGDH、SDHA和MDH2在体细胞重编程、幼稚细胞转换和全能性获得过程中被转运到细胞核。核定位的TCA循环酶PDHA1、PCB、ACO2、CS和IDH3A促进了体细胞重编程和幼稚细胞转换。此外,核定位的TCA循环酶,特别是核靶向的PDHA1,通过增加核中的乙酰辅酶A和代谢物池,导致组蛋白H3乙酰化水平的升高,从而促进多能性基因的染色质重塑[4]。
OGDH基因的表达还与一些细菌的检测有关。例如,OGDH基因的特异性引物可以用于检测沙门氏菌。研究发现,基于OGDH基因的PCR检测方法可以快速、灵敏地检测到沙门氏菌,即使在混合肉类微生物种群中也能检测到低数量的沙门氏菌[5]。
OGDH基因的表达还与血液系统的代谢调控有关。研究发现,m6A去甲基化酶ALKBH5通过m6A修饰介导的RNA稳定性控制来调控造血干细胞和祖细胞的能量代谢。ALKBH5的缺失导致OGDH mRNA的不稳定性和OGDH蛋白水平的降低,进而减缓TCA循环,导致α-酮戊二酸的积累和转化为L-2-羟基戊二酸(L-2-HG)。L-2-HG抑制了小鼠和人造血细胞中的能量产生。受损的线粒体能量产生对造血干细胞和祖细胞造成了竞争劣势,并限制了Mll-AF9诱导的白血病的克隆形成能力[6]。
OGDH基因的表达还与肝细胞癌(HCC)的发生发展有关。研究发现,OGDHL(OGDH类似物)的表达水平与HCC患者的预后相关。OGDHL的沉默通过重编程谷氨酰胺代谢来促进HCC的发展。OGDHL的下调上调了α-酮戊二酸(αKG):柠檬酸的比例,随后通过逆行TCA循环在肝细胞中驱动谷氨酰胺衍生的αKG的还原羧化。值得注意的是,OGDHL的沉默以αKG依赖性的方式激活了mTORC1信号通路,诱导了参与从头脂肪生成的关键酶的转录。同时,OGDHL阴性肝细胞中的代谢重编程为细胞抗氧化系统提供了充足的NADPH和谷胱甘肽。通过OGDHL过表达或谷氨酰胺酶抑制剂减少还原性谷氨酰胺代谢,使肿瘤细胞对索拉非尼(HCC的分子靶向治疗药物)敏感。这些发现表明,OGDHL的沉默通过调节谷氨酰胺代谢途径促进了HCC的发展和存活。OGDHL是HCC的预后生物标志物和治疗靶点[7]。
OGDH基因的表达还与脓毒症诱导的急性肺损伤(ALI)有关。研究发现,OGDH在脓毒症动物模型和细胞模型中的表达上调。OGDH的下调可以减轻脓毒症诱导的ALI。OGDH可能通过MAPK通路发挥作用,在脓毒症的病理条件下,OGDH通过MAPK通路放大炎症反应,释放促炎因子,并诱导ALI[8]。
综上所述,OGDH基因在细胞代谢、癌症发生发展、干细胞多能性维持、细菌检测、血液系统代谢调控和肝细胞癌发生发展中发挥重要作用。OGDH基因的表达受到多种因素的调控,并且与多种疾病的发生发展密切相关。因此,OGDH基因的研究对于深入理解细胞代谢、癌症发生发展和干细胞多能性维持的机制具有重要意义。此外,OGDH基因还可能成为一些疾病的治疗靶点,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Nguyen, Trang Tt, Torrini, Consuelo, Shang, Enyuan, Canoll, Peter, Siegelin, Markus D. 2024. OGDH and Bcl-xL loss causes synthetic lethality in glioblastoma. In JCI insight, 9, . doi:10.1172/jci.insight.172565. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38483541/
2. Yap, Zheng Yie, Strucinska, Klaudia, Matsuzaki, Satoshi, Tarnopolsky, Mark A, Yoon, Wan Hee. 2020. A biallelic pathogenic variant in the OGDH gene results in a neurological disorder with features of a mitochondrial disease. In Journal of inherited metabolic disease, 44, 388-400. doi:10.1002/jimd.12248. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32383294/
3. Liu, Nian, Yan, Mingjie, Tao, Qian, Chen, Xiang, Peng, Cong. . Inhibition of TCA cycle improves the anti-PD-1 immunotherapy efficacy in melanoma cells via ATF3-mediated PD-L1 expression and glycolysis. In Journal for immunotherapy of cancer, 11, . doi:10.1136/jitc-2023-007146. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37678921/
4. Li, Wei, Long, Qi, Wu, Hao, Chan, Wai-Yee, Liu, Xingguo. 2022. Nuclear localization of mitochondrial TCA cycle enzymes modulates pluripotency via histone acetylation. In Nature communications, 13, 7414. doi:10.1038/s41467-022-35199-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36460681/
5. Jin, Un-Ho, Cho, Sung-Hak, Kim, Min-Gon, Lee, Young-Choon, Kim, Cheorl-Ho. . PCR method based on the ogdH gene for the detection of Salmonella spp. from chicken meat samples. In Journal of microbiology (Seoul, Korea), 42, 216-22. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15459651/
6. Gao, Yimeng, Zimmer, Joshua T, Vasic, Radovan, Li, Hua-Bing, Halene, Stephanie. 2023. ALKBH5 modulates hematopoietic stem and progenitor cell energy metabolism through m6A modification-mediated RNA stability control. In Cell reports, 42, 113163. doi:10.1016/j.celrep.2023.113163. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37742191/
7. Dai, Weiqi, Xu, Ling, Yu, Xiangnan, Guo, Chuanyong, Shen, Xizhong. 2019. OGDHL silencing promotes hepatocellular carcinoma by reprogramming glutamine metabolism. In Journal of hepatology, 72, 909-923. doi:10.1016/j.jhep.2019.12.015. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31899205/
8. Hao, Yuewei, Wang, Zheng, Wang, Xinfang, Zhan, Wenming, Wu, Dianshui. . OGDH is involved in sepsis induced acute lung injury through the MAPK pathway. In Journal of thoracic disease, 13, 5042-5054. doi:10.21037/jtd-21-948. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34527342/