Krtap6-2-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Krtap6-2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-02835

品系全称

C57BL/6JCya-Krtap6-2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-16701-Krtap6-2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Krtap6-2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-02835) were purchased from Cyagen.
交付类型
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性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
keratin associated protein 6-2
基因别称
HGTpII.4
染色体号
Chr 16 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_010673.2 | Ensembl: ENSMUST00000082065
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~463 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Krtap6-2,也称为Keratin-associated protein (KAP) 6-2,是一种高甘氨酸/酪氨酸KAP家族成员。KAP家族是毛发和羊毛纤维的基本结构成分,被认为部分负责这些纤维的一些特性。Krtap6-2基因编码的蛋白质富含甘氨酸和酪氨酸,但含有较低的胱氨酸含量。与其他HGT-KAPs相比,羊的Krtap8-2含有更多的酸性氨基酸残基,这可能会导致较低的等电点(pI)为6.3[2]。

在羊中,Krtap6基因家族被认为包含多个基因。通过使用KRTAP6编码序列搜索羊基因组(v3.1),发现了五个同源区域(R1-R5)。这些区域都包含一个开放阅读框,它们与羊皮肤表达序列标签(ESTs)相同或高度相似。系统发育分析表明,R1-R5与来自不同物种的KAP6序列聚集在一起,形成一个与其他HGT-KAPs不同的组。R1与特征化的KRTAP6-1序列非常相似,但其他基因似乎是新发现的。为扩增和确认这些新基因的存在设计了PCR引物。在所有96只羊中均获得了扩增产物。KRTAP6-2至KRTAP6-5分别观察到六个、五个、三个和六个PCR-SSCP模式,代表六个、五个、三个和六个DNA序列。KRTAP6-2和KRTAP6-4分别有五个和三个SNPs。KRTAP6-3有三个SNPs和一个45-bp插入/缺失,而KRTAP6-5有五个SNPs和一个18-bp插入/缺失。这些KAP6基因的等位基因频率在美利奴羊和罗姆尼羊之间有所不同[3]。

Krtap6家族基因在羊毛纤维的形成和特性中起着重要作用。Krtap6家族基因在生长期与其他阶段相比显著表达(p < 0.05)。此外,这五个基因主要在真皮乳头、内根鞘和外根鞘中表达,并表现出明显的时空表达模式。还发现KRTAP6-1和KRTAP6-5 mRNA表达与羊毛平均纤维直径(MFD)和平均纤维强度(MSS)呈负相关(p < 0.05)。总之,Krtap6家族基因具有相似的时空表达模式。KRTAP6-1和KRTAP6-5可能通过改变表达来调节甘肃高山细羊毛羊羊毛的MFD和MSS[4]。

在山羊中,KRTAP6-2的序列变异被发现影响山羊绒纤维直径。在230只长东山羊中,对这一区域进行聚合酶链反应扩增和单链构象多态性分析,揭示了五种不同的条带模式,代表五种不同的序列(A至E)。在这些五个序列中发现了十一个二等位基因单核苷酸多态性(SNPs)、一个三核苷酸序列变异和一个12-bp插入/缺失。在这些SNPs中,大多数位于编码区之外或为同义SNPs。发现存在变异D与平均纤维直径(MFD;存在:13.26 ± 0.07 µm;不存在:13.55 ± 0.04 µm;p < 0.001)的降低相关,这表明KRTAP6-2的变异可能影响纤维直径,并且可以作为改善山羊绒纤维直径性状的分子标记[1]。

综上所述,Krtap6-2基因编码的蛋白质在羊毛纤维的形成和特性中起着重要作用。Krtap6-2的序列变异被发现影响山羊绒纤维直径,并且可以作为改善山羊绒纤维直径性状的分子标记。此外,Krtap6家族基因具有相似的时空表达模式,并且KRTAP6-1和KRTAP6-5可能通过改变表达来调节甘肃高山细羊毛羊羊毛的MFD和MSS。这些研究结果有助于深入理解Krtap6-2基因在羊毛纤维特性中的作用和机制,为羊毛生产提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Cao, Jian, Wang, Jiqing, Zhou, Huitong, Luo, Yuzhu, Hickford, Jon G H. 2022. Sequence Variation in Caprine KRTAP6-2 Affects Cashmere Fiber Diameter. In Animals : an open access journal from MDPI, 12, . doi:10.3390/ani12162040. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36009630/
2. Gong, Hua, Zhou, Huitong, Dyer, Jolon M, Hickford, Jon Gh. 2014. The sheep KAP8-2 gene, a new KAP8 family member that is absent in humans. In SpringerPlus, 3, 528. doi:10.1186/2193-1801-3-528. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25279319/
3. Zhou, Huitong, Gong, Hua, Wang, Jiqing, Luo, Yuzhu, Hickford, Jon G H. 2016. Identification of four new gene members of the KAP6 gene family in sheep. In Scientific reports, 6, 24074. doi:10.1038/srep24074. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27045687/
4. Sun, Hongxian, He, Zhaohua, Zhao, Fangfang, Luo, Yuzhu, Li, Shaobin. 2024. Spatiotemporal Expression Characterization of KRTAP6 Family Genes and Its Effect on Wool Traits. In Genes, 15, . doi:10.3390/genes15010095. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38254984/