Krtap6-1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Krtap6-1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-02834

品系全称

C57BL/6JCya-Krtap6-1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-16700-Krtap6-1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Krtap6-1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-02834) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
keratin associated protein 6-1
基因别称
HGTpII.1,HGTpII.2
染色体号
Chr 16 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_010672.3 | Ensembl: ENSMUST00000076906
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~234 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Krtap6-1是一种高甘氨酸-酪氨酸角蛋白相关蛋白(HGT-KAP)家族的成员。HGT-KAPs主要存在于羊毛纤维的正皮质中,它们的丰度在不同的羊毛中有所不同,并且被认为在调节羊毛纤维特性中起着作用。Krtap6-1基因编码的蛋白质在羊毛纤维的结构和特性中发挥着重要作用,其基因变异对羊毛纤维直径等特性有着显著影响[1,2,3]。

在一项研究中,研究者在新西兰罗姆尼母羊中研究了Krtap6-1基因的变异对羊毛纤维特性的影响。研究发现,Krtap6-1基因存在四种变异(A、B、E和F),并且在这些母羊中检测到九种基因型(AA、AB、AE、AF、BB、BE、BF、EE和FF)。在243只基因型频率超过5%的母羊(即AA、AB和BB)中,发现A的存在与平均纤维直径(MFD)的减少和纤维直径系数变异(CVFD)的增加相关,而B的存在则与粗边缘测量(CEM)的减少趋势相关。此外,还发现基因型对MFD和CVFD有影响[1]。

另一项研究在羊中发现了四个新的KAP6基因家族成员。研究者使用KRTAP6的编码序列搜索羊基因组,发现了五个同源区域(R1-R5),这些区域都包含一个开放阅读框,并且与羊皮肤表达序列标签(ESTs)高度相似。系统发育分析表明,R1-R5与来自不同物种的KAP6序列聚集在一起,形成一个与其他HGT-KAPs不同的群体。R1与已知的KRTAP6-1序列非常相似,但其余的基因似乎是新的。通过PCR-SSCP分析,发现KRTAP6-2至KRTAP6-5分别存在六种、五种、三种和六种DNA序列的PCR-SSCP模式。KRTAP6-2和KRTAP6-4分别存在五个和三个SNP。KRTAP6-3检测到三个SNP和一个45-bp插入/缺失,KRTAP6-5检测到五个SNP和一个18-bp插入/缺失。这些KAP6基因的等位基因频率在美利奴羊和罗姆尼羊之间存在差异[2]。

在一项关于Krtap6-1基因57-bp缺失对羊毛纤维直径影响的研究中,研究者发现Krtap6-1基因存在三种基因变异(A、B和C)。A和B之间只有三个核苷酸差异,而C则有一个57-bp缺失,这将导致蛋白质中失去19个氨基酸。研究发现,C的存在与MFD、纤维直径标准差(FDSD)、CVFD和刺因子(PF)的增加相关。BC基因型的羊产生的羊毛具有更大的MFD、FDSD和PF,而CVFD在BC羊中比AB羊更高。这些结果表明,Krtap6-1基因的变异会影响羊毛纤维直径相关的特性,而基因中的57-bp缺失会导致羊毛更粗糙,具有更大的FDSD、CVFD和PF[3]。

另一项研究调查了KRTAP6家族基因的时空表达特征及其对羊毛性状的影响。研究者使用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和原位杂交技术研究了KRTAP6基因的时空表达。结果显示,KRTAP6家族基因在生长期的表达水平显著高于其他阶段。此外,KRTAP6-1和KRTAP6-5的mRNA表达与羊毛MFD和平均纤维强度(MSS)呈负相关。这表明KRTAP6家族基因在羊毛纤维的物理和机械特性中发挥着重要作用[4]。

综上所述,Krtap6-1基因在羊毛纤维的结构和特性中发挥着重要作用。其基因变异对羊毛纤维直径等特性有着显著影响。研究Krtap6-1基因有助于深入理解羊毛纤维的生物学特性,为羊毛品质的改良和羊毛产业的发展提供理论基础。

参考文献:
1. Li, Wenhao, Gong, Hua, Zhou, Huitong, Luo, Yuzhu, Hickford, Jon G H. 2019. Variation in KRTAP6-1 affects wool fibre diameter in New Zealand Romney ewes. In Archives animal breeding, 62, 509-515. doi:10.5194/aab-62-509-2019. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31807662/
2. Zhou, Huitong, Gong, Hua, Wang, Jiqing, Luo, Yuzhu, Hickford, Jon G H. 2016. Identification of four new gene members of the KAP6 gene family in sheep. In Scientific reports, 6, 24074. doi:10.1038/srep24074. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27045687/
3. Zhou, H, Gong, H, Li, S, Luo, Y, Hickford, J G H. 2015. A 57-bp deletion in the ovine KAP6-1 gene affects wool fibre diameter. In Journal of animal breeding and genetics = Zeitschrift fur Tierzuchtung und Zuchtungsbiologie, 132, 301-7. doi:10.1111/jbg.12138. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25782086/
4. Sun, Hongxian, He, Zhaohua, Zhao, Fangfang, Luo, Yuzhu, Li, Shaobin. 2024. Spatiotemporal Expression Characterization of KRTAP6 Family Genes and Its Effect on Wool Traits. In Genes, 15, . doi:10.3390/genes15010095. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38254984/