Khk-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Khk-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-02775

品系全称

C57BL/6JCya-Khkem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-16548-Khk-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Khk-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-02775) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ketohexokinase
基因别称
-
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001310524 | Ensembl: ENSMUST00000031053
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~2.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1096353Mice homozygous for alleles that do not produce isoform A or isoforms A and C exhibit normal fertility, development, blood chemistry, and tissue metabolite levels.
KHK,即ketohexokinase(酮己糖激酶),是参与葡萄糖代谢的关键酶之一。KHK有两种主要亚型:KHK-A和KHK-C。KHK-A主要在肝脏中表达,而KHK-C则广泛表达于多种组织中。KHK的主要功能是将果糖转化为果糖-1-磷酸,这一过程是果糖代谢的第一步。KHK的活性对于维持血糖水平和能量代谢至关重要。

KHK的活性与多种疾病的发生发展密切相关。例如,KHK-A的表达与食管鳞状细胞癌(ESCC)的增殖相关[2]。KHK-A通过上调PRPS1的表达,促进细胞周期的G1/S期转换,进而促进肿瘤细胞增殖。此外,KHK在肿瘤血管生成中也发挥重要作用。研究表明,肿瘤内皮细胞中的KHK活性增加,可以促进肿瘤血管生成和肿瘤生长[3]。此外,KHK还具有非代谢功能,可以作为蛋白激酶磷酸化多种蛋白底物,参与调控细胞增殖、凋亡、自噬等多种细胞过程[4]。

在基因模型注释方面,准确注释对于正确估计基因表达和亚型表达至关重要[1]。例如,对于KHK基因,使用不准确的基因模型会导致亚型表达估计的不准确。通过手动校正KHK基因模型,可以获得更准确的亚型表达估计,与定量PCR(qPCR)测量结果更为一致。这表明,准确的基因模型和注释对于正确估计亚型表达至关重要。

此外,基因表达和亚型表达的估计方法也需要不断改进。例如,全基因组关联研究(GWAS)可以识别与疾病相关的基因区域,但解释这些数据仍然具有挑战性。为了解决这一问题,研究人员开发了一种基于组合的调控变异的基因水平测试,用于检测种群特异性选择。通过对人类数据进行分析,研究人员发现了45个具有显著选择证据的基因,包括KHK基因[6]。

KHK基因编码两种酶亚型,KHK-A和KHK-C。这两种亚型对于正常的生长和发育并非必需[7]。这表明,KHK在代谢综合征中的作用可能并非直接通过影响正常的生长和发育来实现。此外,KHK的活性也可能受到表观遗传调控的影响。例如,血流介导的血管内皮基因表达可能受到表观遗传调控的影响[5]。

综上所述,KHK是一种重要的酶,参与葡萄糖代谢和多种细胞过程。KHK的活性与多种疾病的发生发展密切相关,包括癌症和代谢综合征。准确的基因模型和注释对于正确估计基因表达和亚型表达至关重要。此外,基因表达和亚型表达的估计方法也需要不断改进。

参考文献:
1. Chabbert, Christophe D, Eberhart, Tanja, Guccini, Ilaria, Krek, Wilhelm, Kovacs, Werner J. 2018. Correction of gene model annotations improves isoform abundance estimates: the example of ketohexokinase ( Khk). In F1000Research, 7, 1956. doi:10.12688/f1000research.17082.2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31001414/
2. Yang, Jie, Yang, Senlin, Wang, Qi, Wang, Huimin, Fu, Xiaohong. 2020. KHK-A promotes the proliferation of oesophageal squamous cell carcinoma through the up-regulation of PRPS1. In Arab journal of gastroenterology : the official publication of the Pan-Arab Association of Gastroenterology, 22, 40-46. doi:10.1016/j.ajg.2020.08.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32928708/
3. Fang, Jian-Hong, Chen, Jie-Ying, Zheng, Jia-Lin, Wang, Zhi-Yong, Zhuang, Shi-Mei. . Fructose Metabolism in Tumor Endothelial Cells Promotes Angiogenesis by Activating AMPK Signaling and Mitochondrial Respiration. In Cancer research, 83, 1249-1263. doi:10.1158/0008-5472.CAN-22-1844. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36715635/
4. Lu, Zhimin, Hunter, Tony. 2018. Metabolic Kinases Moonlighting as Protein Kinases. In Trends in biochemical sciences, 43, 301-310. doi:10.1016/j.tibs.2018.01.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29463470/
5. Ku, Kyung Ha, Subramaniam, Noeline, Marsden, Philip A. 2019. Epigenetic Determinants of Flow-Mediated Vascular Endothelial Gene Expression. In Hypertension (Dallas, Tex. : 1979), 74, 467-476. doi:10.1161/HYPERTENSIONAHA.119.13342. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31352815/
6. Colbran, Laura L, Ramos-Almodovar, Fabian C, Mathieson, Iain. . A gene-level test for directional selection on gene expression. In Genetics, 224, . doi:10.1093/genetics/iyad060. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37036411/
7. Diggle, C P, Shires, M, McRae, C, Asipu, A, Bonthron, D T. 2010. Both isoforms of ketohexokinase are dispensable for normal growth and development. In Physiological genomics, 42A, 235-43. doi:10.1152/physiolgenomics.00128.2010. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20841500/