Ddx6-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ddx6-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-01751

品系全称

C57BL/6JCya-Ddx6em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-13209-Ddx6-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ddx6-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-01751) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DEAD-box helicase 6
基因别称
1110001P04Rik,C430015D01Rik,E230023J21Rik,HLR2,mRCK/P54,p54,rck
染色体号
Chr 9 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001110826.1 | Ensembl: ENSMUST00000170489
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~2.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:104976Mice exhibit lethality prior to E11.5, decreased embryo size, embryonic growth retardation, caudal body truncation, and delayed primitive streak formation.
Ddx6,也称为RNA解旋酶Ddx6,是一种DEAD-box家族的RNA解旋酶,广泛存在于从单细胞真核生物到脊椎动物的物种中。它在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括RNA代谢、基因表达调控、细胞分化和发育等。Ddx6主要通过影响mRNA的储存、翻译抑制和降解来调节基因表达。

Ddx6在胚胎干细胞和成体祖细胞中发挥着重要作用。研究发现,抑制Ddx6的表达可以使人类和小鼠的胚胎干细胞进入一种分化抵抗的“超多能”状态,这种状态可以轻松地重新编程为类似于植入前胚胎的幼稚状态[1]。此外,Ddx6还在成体祖细胞中控制自我更新和分化的平衡,其作用具有情境依赖性。机制上,Ddx6通过P小体介导靶mRNA的翻译抑制。当Ddx6活性丧失时,P小体会溶解并释放编码命运指令性转录和染色质因子的mRNA,这些mRNA重新进入核糖体池。这些靶标的翻译增加会影响细胞命运,通过重新连接未分化细胞类型的增强子、异染色质和DNA甲基化景观[1]。

Ddx6还与肿瘤的发生和发展密切相关。研究发现,Ddx6在胶质母细胞瘤中参与放疗和化疗的抵抗性。通过全基因组筛选,发现Ddx6是胶质母细胞瘤中治疗抵抗性的候选基因。Ddx6的敲低可以抑制肿瘤的生长,并提高对放疗的敏感性[2]。

此外,Ddx6在早期小鼠胚胎发生中也发挥着重要作用。研究发现,Ddx6通过参与miRNA介导的基因沉默过程来抑制BMP信号通路的异常抑制。Ddx6的缺失导致BMP信号通路负调控因子的异常上调,并伴随Nodal和相关基因的表达增强。Ddx6敲除的胚胎干细胞获得更高的多能性,并倾向于神经谱系的分化。在原肠形成过程中,Nodal和Eomes的表达异常扩张,可能促进了内胚层的谱系分化,同时抑制了中胚层的分化[3]。

Ddx6还与炎症性疾病的发生有关。研究发现,Ddx6在非免疫细胞中通过IL-6放大器机制参与NF-κB的过度激活,进而促进慢性炎症的发生。Ddx6的敲低可以抑制NF-κB信号通路和IL-6放大器的激活,从而抑制炎症性疾病的发生[4]。

此外,Ddx6还参与跨代基因沉默的调控。研究发现,P小体和生殖颗粒之间的相互作用对于跨代基因沉默至关重要。Ddx6作为P小体的一部分,与CAR-1/LSM14等P小体成分共同参与生殖颗粒的亚细胞器形成和小RNA沉默因子的浓缩。Ddx6的缺失会导致跨代基因沉默能力的丧失[5]。

最后,Ddx6还通过与CNOT1的直接结合参与miRNA介导的基因沉默。研究发现,Ddx6与CNOT1的大支架亚基直接相互作用,类似于翻译起始因子eIF4A与eIF4G的相互作用。这种相互作用对于miRNA介导的基因沉默至关重要[6]。

综上所述,Ddx6是一种重要的RNA解旋酶,参与调控RNA代谢、基因表达、细胞分化和发育等生物学过程。Ddx6在肿瘤、炎症性疾病和跨代基因沉默等方面发挥着重要作用。Ddx6的研究有助于深入理解RNA代谢和基因表达的调控机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1,2,3,4,5,6]。

参考文献:
1. Di Stefano, Bruno, Luo, En-Ching, Haggerty, Chuck, Yeo, Gene W, Hochedlinger, Konrad. 2019. The RNA Helicase DDX6 Controls Cellular Plasticity by Modulating P-Body Homeostasis. In Cell stem cell, 25, 622-638.e13. doi:10.1016/j.stem.2019.08.018. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31588046/
2. Cho, Yu Jin, Kang, Wonyoung, Kim, Sung Heon, Hwang, Young-Il, Nam, Do-Hyun. 2016. Involvement of DDX6 gene in radio- and chemoresistance in glioblastoma. In International journal of oncology, 48, 1053-62. doi:10.3892/ijo.2016.3328. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26783102/
3. Kim, Jessica, Muraoka, Masafumi, Okada, Hajime, Ajima, Rieko, Saga, Yumiko. 2022. The RNA helicase DDX6 controls early mouse embryogenesis by repressing aberrant inhibition of BMP signaling through miRNA-mediated gene silencing. In PLoS genetics, 18, e1009967. doi:10.1371/journal.pgen.1009967. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36197846/
4. Naito, Seiichiro, Tanaka, Hiroki, Jiang, Jing-Jing, Hashimoto, Shigeru, Murakami, Masaaki. 2024. DDX6 is involved in the pathogenesis of inflammatory diseases via NF-κB activation. In Biochemical and biophysical research communications, 703, 149666. doi:10.1016/j.bbrc.2024.149666. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38377944/
5. Du, Zhenzhen, Shi, Kun, Brown, Jordan S, Lee, Heng-Chi, Zhang, Donglei. 2023. Condensate cooperativity underlies transgenerational gene silencing. In Cell reports, 42, 112859. doi:10.1016/j.celrep.2023.112859. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37505984/
6. Rouya, Christopher, Siddiqui, Nadeem, Morita, Masahiro, Fabian, Marc R, Sonenberg, Nahum. 2014. Human DDX6 effects miRNA-mediated gene silencing via direct binding to CNOT1. In RNA (New York, N.Y.), 20, 1398-409. doi:10.1261/rna.045302.114. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25035296/