Casp12-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Casp12-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-01334

品系全称

C57BL/6JCya-Casp12em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-12364-Casp12-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Casp12-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-01334) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
caspase 12
基因别称
-
染色体号
Chr 9 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_009808.4 | Ensembl: ENSMUST00000027009
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~6
敲除长度
~6364 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1312922Homozygous mice for some mutations of this gene display resistance to ER stress-induced apoptosis.
Caspase 12(CASP12)是一种半胱氨酸蛋白酶,属于Caspase家族的成员,这个家族的蛋白酶在细胞凋亡中扮演着关键角色。Caspase 12主要在哺乳动物细胞中表达,其活性受到内质网应激(ERS)的调节。在内质网应激情况下,Caspase 12可以介导细胞凋亡的线粒体通路,通过切割Caspase 9来激活Caspase 3,进而引发凋亡级联反应。

Caspase 12在多种疾病中具有潜在的诊断和预后价值。例如,在宫颈癌中,Caspase 12的表达水平与患者的临床诊断和预后相关。研究表明,Caspase 12低表达组的宫颈癌患者3年生存率显著低于高表达组,这表明Caspase 12的表达水平可以作为宫颈癌患者的诊断和预后生物标志物[1]。

除了在癌症中的作用,Caspase 12还参与其他生物学过程。例如,在肝脏纤维化过程中,Caspase 12是miR-155的一个新靶点。研究发现,抗菌肽YD可以通过抑制miR-155的表达来上调Caspase 12的水平,从而减轻炎症反应,抑制肝脏纤维化的进展[5]。

在蛋白质结构预测方面,Caspase 12也引起了研究者的兴趣。例如,在CASP12实验中,研究者评估了各种模型准确性估计方法在Caspase 12中的性能。这些方法包括基于整体模型的评分和基于局部结构的评分,以及用于评估模型准确性的不同模型评估软件包的得分[2]。此外,CASP12还评估了蛋白质组装预测的准确性。研究者发现,在30个寡聚体目标中,共提交了1624个寡聚体模型,其中一些模型在界面补丁和残基接触水平上与参考结构相似[3]。这些研究有助于提高蛋白质结构预测的准确性,为生物学研究和药物开发提供重要的信息。

在蛋白质结构预测方面,Rosetta软件在CASP12中表现出色。Rosetta利用共进化信息进行接触预测,并生成蛋白质模型,这些模型在某些情况下比已知的晶体结构更好。此外,Rosetta的原子精细优化和分子动力学模拟可以进一步提高模型的质量[4]。

此外,Caspase 12还参与了软骨细胞凋亡的调节。研究发现,内质网应激可以通过PI3K/AKT信号通路诱导软骨细胞的凋亡,而抑制PI3K/AKT信号通路可以减少内质网应激诱导的软骨细胞凋亡[6]。

综上所述,Caspase 12是一种重要的半胱氨酸蛋白酶,在细胞凋亡、炎症反应和肝脏纤维化等生物学过程中发挥重要作用。Caspase 12的表达水平与宫颈癌患者的临床诊断和预后相关,可以作为宫颈癌患者的诊断和预后生物标志物。此外,Caspase 12还参与了软骨细胞凋亡的调节,抑制PI3K/AKT信号通路可以减少内质网应激诱导的软骨细胞凋亡。Caspase 12的研究有助于深入理解细胞凋亡和炎症反应的分子机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Feng, Guo, Beilei, Zhang, Caizhi, Chen, Wen, Zou. . Analysis of CASP12 diagnostic and prognostic values in cervical cancer based on TCGA database. In Bioscience reports, 39, . doi:10.1042/BSR20192706. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31804677/
2. Kryshtafovych, Andriy, Monastyrskyy, Bohdan, Fidelis, Krzysztof, Schwede, Torsten, Tramontano, Anna. 2017. Assessment of model accuracy estimations in CASP12. In Proteins, 86 Suppl 1, 345-360. doi:10.1002/prot.25371. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28833563/
3. Lafita, Aleix, Bliven, Spencer, Kryshtafovych, Andriy, Schwede, Torsten, Capitani, Guido. 2017. Assessment of protein assembly prediction in CASP12. In Proteins, 86 Suppl 1, 247-256. doi:10.1002/prot.25408. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29071742/
4. Ovchinnikov, Sergey, Park, Hahnbeom, Kim, David E, DiMaio, Frank, Baker, David. 2017. Protein structure prediction using Rosetta in CASP12. In Proteins, 86 Suppl 1, 113-121. doi:10.1002/prot.25390. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28940798/
5. Yan, Zhibin, Wang, Dan, An, Chunmei, Jiang, Xianxing, Xie, Junqiu. 2020. The antimicrobial peptide YD attenuates inflammation via miR-155 targeting CASP12 during liver fibrosis. In Acta pharmaceutica Sinica. B, 11, 100-111. doi:10.1016/j.apsb.2020.07.004. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33532183/
6. Zhou, Libo, Wu, Fan, Wang, Jing, Wu, Gaoyi, Su, Yucheng. 2024. Effects of endoplasmic reticulum stress on chondrocyte apoptosis via the PI3K/AKT signaling pathway. In Tissue & cell, 87, 102340. doi:10.1016/j.tice.2024.102340. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38447334/