Epop-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Epop-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-00302

品系全称

C57BL/6JCya-Epopem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-103551-Epop-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Epop-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-00302) were purchased from Cyagen.
交付类型
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性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
elongin BC and polycomb repressive complex 2 associated protein
基因别称
E13,E130012A19Rik,esPRC2p48
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_175332.3 | Ensembl: ENSMUST00000052281
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~1105 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
EPOP,全称为Elongin BC and Polycomb Repressive Complex 2-associated protein,是一种与多梳抑制复合物2(PRC2)相关的蛋白。PRC2是一种重要的染色质调节复合物,参与调控多种发育基因的转录抑制。EPOP是PRC2.1复合物的特有辅助亚基,与多梳抑制复合物1(PRC1)共同作用,通过催化组蛋白H3尾部赖氨酸27的单、双、三甲基化(H3K27me3),使染色质紧密,进而抑制目标基因的转录。

EPOP与转录延伸因子Elongin BC相互作用,并与H2B去泛素化酶USP7协同调节转录过程,类似于MYC蛋白的功能。EPOP在人类癌症中通常上调,其缺失会损害多种人类癌细胞系的增殖。EPOP通过与Elongin BC和USP7的相互作用,在维持基因表达的平衡中发挥重要作用,从而影响细胞命运决定和早期分化的连续体[1]。

EPOP通过与Elongin BC和USP7的相互作用,调节PRC2.1的寡聚状态,从而影响其与染色质的结合。EPOP的突变体能够增强基因组范围内MTF2和H3K27me3的富集,表明EPOP在维持染色质平衡方面发挥重要作用[2]。

EPOP在多能干细胞中与Elongin BC相互作用,共同维持基因表达的平衡。Elongin BC被EPOP招募到染色质上,与PRC2相互作用,共同维持低水平的基因表达[3]。EPOP和Elongin BC的功能性连接表明,维持激活和抑制信号之间的平衡是多能干细胞染色质的一个更普遍特征。

EPOP和Elongin BC在控制转录活性方面具有双重作用。EPOP与Elongin BC相互作用,调节基因转录,影响H3K4me3广泛激活和H3K27me3多梳抑制染色质区域的转录活性[4]。

PRC2在细胞谱系承诺和胚胎发育中发挥重要作用。PRC2通过催化组蛋白H3尾部赖氨酸27的甲基化,与PRC1协同抑制目标基因的转录。PRC2存在两种变体复合物,即PRC2.1和PRC2.2,它们在胚胎发育的不同阶段发挥不同的作用[5]。

PRC2的组成和功能在进化过程中发生了显著的变化。在进化过程中,PRC2复合物的成员和功能发生了变化,以适应不同的生物学需求。PRC2.1亚复合物获得了多个新功能,这对染色质调节功能具有重要意义[6]。

通过设计肽抑制转录调节因子Elongin BC的蛋白-蛋白相互作用可以有效地干扰其生物学功能。Elongin BC异二聚体(ELOB/C)与BC-box基序结合,对于癌细胞生长至关重要。研究报道了一种模拟EPOP高亲和力BC-box的肽,该肽能够紧密地结合ELOB/C二聚体,阻断其与其他相互作用蛋白的结合,从而抑制癌细胞生长[7]。

PRC2.1和PRC2.2协同调节H3K27三甲基化。PRC2.1和PRC2.2共享大多数目标基因,它们在维持H3K27me3的动态平衡中发挥重要作用。PRC2.1和PRC2.2的缺失会导致SUZ12的全局错位,表明它们在维持染色质状态和基因表达中发挥重要作用[8]。

PRC2的调节与细胞周期转换相关。在多能干细胞中,PRC2亚基在不同的细胞周期阶段被招募到谱系特异性基因启动子上。PRC2亚基的招募变化促进RNA合成和RNA聚合酶II结合的变化,从而影响细胞分化。PRC2的调节与细胞周期转换的耦合为细胞分化提供了一个协调机制[9]。

Suz12具有独特的结构平台,能够定义不同的PRC2全复合物以进行染色质结合。Suz12包含两个独特的结构平台,分别与Aebp2和Phf19竞争结合,以及与Jarid2和EPOP共同占据的Suz12表面。这些结构平台对于PRC2的染色质结合和功能发挥至关重要[10]。

综上所述,EPOP是一种与PRC2相关的蛋白,在调节基因表达和维持染色质平衡中发挥重要作用。EPOP与Elongin BC和USP7相互作用,调节PRC2.1的寡聚状态和染色质结合,从而影响基因转录。EPOP的缺失会损害癌细胞的增殖,表明其在癌症发生中具有重要作用。EPOP的研究有助于深入理解染色质调节和基因表达调控的机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Liefke, Robert, Karwacki-Neisius, Violetta, Shi, Yang. . EPOP Interacts with Elongin BC and USP7 to Modulate the Chromatin Landscape. In Molecular cell, 64, 659-672. doi:10.1016/j.molcel.2016.10.019. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27863226/
2. Gong, Lihu, Liu, Xiuli, Yang, Xin, Xing, Chao, Liu, Xin. 2024. EPOP Restricts PRC2.1 Targeting to Chromatin by Directly Modulating Enzyme Complex Dimerization. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.09.10.612337. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39314288/
3. Beringer, Malte, Pisano, Paola, Di Carlo, Valerio, Wierer, Michael, Di Croce, Luciano. . EPOP Functionally Links Elongin and Polycomb in Pluripotent Stem Cells. In Molecular cell, 64, 645-658. doi:10.1016/j.molcel.2016.10.018. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27863225/
4. Ferrari, Karin Johanna, Lavarone, Elisa, Pasini, Diego. . The Dual Role of EPOP and Elongin BC in Controlling Transcriptional Activity. In Molecular cell, 64, 637-638. doi:10.1016/j.molcel.2016.11.009. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27863221/
5. Loh, Chet H, Veenstra, Gert Jan C. 2022. The Role of Polycomb Proteins in Cell Lineage Commitment and Embryonic Development. In Epigenomes, 6, . doi:10.3390/epigenomes6030023. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35997369/
6. Fischer, Sabrina, Weber, Lisa Marie, Liefke, Robert. 2022. Evolutionary adaptation of the Polycomb repressive complex 2. In Epigenetics & chromatin, 15, 7. doi:10.1186/s13072-022-00439-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35193659/
7. Fischer, Sabrina, Trinh, Van Tuan, Simon, Clara, Liefke, Robert, Vázquez, Olalla. 2023. Peptide-mediated inhibition of the transcriptional regulator Elongin BC induces apoptosis in cancer cells. In Cell chemical biology, 30, 766-779.e11. doi:10.1016/j.chembiol.2023.05.012. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37354906/
8. Healy, Evan, Mucha, Marlena, Glancy, Eleanor, Koseki, Haruhiko, Bracken, Adrian P. 2019. PRC2.1 and PRC2.2 Synergize to Coordinate H3K27 Trimethylation. In Molecular cell, 76, 437-452.e6. doi:10.1016/j.molcel.2019.08.012. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31521505/
9. Asenjo, Helena G, Gallardo, Amador, López-Onieva, Lourdes, Carmona-Sáez, Pedro, Landeira, David. 2020. Polycomb regulation is coupled to cell cycle transition in pluripotent stem cells. In Science advances, 6, eaay4768. doi:10.1126/sciadv.aay4768. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32181346/
10. Chen, Siming, Jiao, Lianying, Shubbar, Murtada, Yang, Xin, Liu, Xin. . Unique Structural Platforms of Suz12 Dictate Distinct Classes of PRC2 for Chromatin Binding. In Molecular cell, 69, 840-852.e5. doi:10.1016/j.molcel.2018.01.039. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29499137/