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Esp34-KO 基因敲除小鼠

Esp34-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Esp34-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-00071

品系全称

C57BL/6JCya-Esp34em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-100126773-Esp34-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Esp34-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-00071) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
exocrine gland secreted peptide 34
基因别称
Gm20410
染色体号
Chr 17 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_001177585.1 | Ensembl: ENSMUST00000178654
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~180 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
基因Esp34是一种在生物信息学领域中被广泛研究的基因。它涉及到了基因复制和基因丢失的进化过程，以及这些过程如何导致不同物种之间基因数量的差异。基因复制后，通常两个副本会以大致相同的速率积累序列变化。但在某些情况下，序列变化的积累是非常不均匀的，其中一个副本会与另一个副本显著分化。这种现象被称为“非对称进化”，在串联基因复制后比在基因组复制后更常见，并且可以产生全新的基因[1]。

在乳腺癌研究中，BRCA1和BRCA2是两个与遗传性乳腺癌综合征相关的高外显率基因。除了这些基因外，还有一些中低外显率的基因也与乳腺癌风险相关，如CHEK2、ATM、BRIP1、PALB2和RAD51C。基因组关联研究（GWAS）揭示了与乳腺癌风险略微增加或降低相关的常见低外显率等位基因。目前，只有高外显率基因在临床实践中被广泛使用。随着下一代测序技术的发展，预计所有家族性乳腺癌基因都将包括在遗传测试中。然而，在将多基因面板测试完全纳入临床工作流程之前，还需要对中低风险变异的临床管理进行更多研究[2]。

基因回路工程是后基因组研究的核心内容之一。基因和蛋白质之间的连接性产生了分子网络图，这些图类似于复杂的电路。要系统地理解这些网络，需要开发描述电路的数学框架。从工程的角度来看，构建和分析构成网络的底层子模块是构建此类框架的自然途径。近年来，在测序和基因工程方面的实验进展使得设计、实施和数学建模合成基因网络成为可能。这些发展标志着基因回路学科的兴起，为预测和评估细胞过程的动态提供了一个框架。合成基因网络也将导致新的细胞控制逻辑形式，这可能在功能基因组学、纳米技术和基因与细胞治疗方面具有重要作用[3]。

基因敲除技术是一种常用的方法，用于探索基因功能。基因敲除会产生完全的基因功能丧失，其最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe的全基因组敲除分析中，基因组中大约四分之一的基因可以是必需的。基因必需性是基因型-表型关系的一部分，会受到背景效应的影响，并且可能会由于基因-基因相互作用而变化。特别是对于一些必需基因，由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子得到挽救。这种“必需性的规避”（BOE）基因-基因相互作用是一种被忽视的遗传抑制类型。最近的一项系统性分析显示，裂殖酵母中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到规避[4]。

基因调控网络是控制基因表达和细胞功能的关键系统。它们由一系列相互作用的基因和蛋白质组成，这些基因和蛋白质通过转录因子和调节蛋白等分子相互连接。基因调控网络的研究对于理解发育、分化和疾病等生物学过程至关重要[5]。

PlantCARE是一个植物顺式作用调控元件数据库，提供了植物顺式作用调控元件、增强子和抑制子的信息。这些调控元件通过位置矩阵、共识序列和在特定启动子序列上的单个位点来表示。数据库还提供了与EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接，以及关于转录位点的数据，这些数据主要从文献中提取，并辅以越来越多的计算机预测数据。数据库还提供了新的功能，可以搜索查询序列中的植物顺式作用调控元件，并提供了链接到新的聚类和基序搜索方法，以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送，并在审查后添加到数据库中[6]。

基因片段是基因的一部分，它们可能包含基因的功能区域，如启动子、编码区或非编码区。这些片段可能在基因表达调控中发挥重要作用，并且在基因重组和进化中可能具有重要作用[7]。

植物抗性基因在植物防御反应中发挥着重要作用。这些基因编码的蛋白质可以识别病原体相关分子模式（PAMPs）或效应蛋白，并激活植物的抗病性。抗性基因依赖的植物防御反应包括多种信号转导途径，这些途径最终导致植物抗病相关基因的表达和抗病相关代谢物的产生[8]。

MHC基因的表达受到多种转录因子的调控。这些转录因子与MHC基因的启动子相互作用，影响MHC基因的表达水平。最近的研究揭示了与MHC基因启动子相互作用的蛋白质，以及编码这些蛋白质的基因，如H-2RIIBP/RXR beta、NK kappa B、I-kappa B、hXBP-1和NF-Y。新的技术，如基因组体内足迹分析，提供了关于这些启动子上蛋白质-DNA相互作用状态的见解。新的研究还加深了对MHC相关基因的理解[9]。

基因的定义是一个复杂的科学问题，涉及到基因的结构、功能和表达。基因是DNA序列的一部分，负责编码蛋白质或RNA分子。基因的表达受到多种因素的调控，包括启动子、增强子、沉默子和转录因子等。基因的定义对于理解基因的功能和进化具有重要意义[10]。

综上所述，基因Esp34是一个涉及基因复制、基因丢失和非对称进化的基因。它与其他基因一样，在生物信息学领域中被广泛研究，并且对生物学过程和疾病的发生发展具有重要作用。通过对基因Esp34的研究，我们可以深入理解基因的进化机制、功能和表达调控，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/

资料下载

S-KO-00071_6J_100126773_Esp34_Exon 3_A_strategy.pdf
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