Prdm11-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Prdm11-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-00042

品系全称

C57BL/6JCya-Prdm11em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-100042784-Prdm11-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Prdm11-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-00042) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
PR domain containing 11
基因别称
8030443D09Rik,Gm29694,Gm707
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001368848.1 | Ensembl: ENSMUST00000238863
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~263 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2685553Mice homozygous for a null allele show increased cell numbers in bronchioalveolar lavages and changes in B cell, CD4+ T cell and neutrophil counts following ovalbumin airway challenge, and a small decrease in megakaryocytic progenitors and a small increase in hematopoietic progenitor cell proliferation.
PRDM11,也称为PR-domain containing 11,是一种编码转录因子的基因。PRDM11基因属于PR-domain(PRDM)家族,这个家族的基因编码的转录因子在细胞分化、发育和疾病发生中发挥着重要作用。PRDM11基因包含一个PRDF1-RIZ(PR)同源域和若干个锌指结构域。PRDM11基因在动物发育过程中涉及多种生物学功能,包括细胞增殖、凋亡、免疫调节和肿瘤抑制等。

PRDM11基因在淋巴瘤的发生发展中发挥重要作用。一项研究发现,PRDM11基因的缺失会促进MYC基因驱动的淋巴瘤发生。在Eµ-Myc小鼠模型中,PRDM11基因敲除小鼠的淋巴瘤发生速度加快,而PRDM11基因过表达则会抑制细胞增殖并诱导细胞凋亡。此外,PRDM11基因缺失的弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的总体生存率较差,属于非生发中心B细胞样亚型。这些结果表明,PRDM11基因是一种潜在的肿瘤抑制因子,它控制着关键致癌基因的表达,并为B细胞淋巴瘤的发生发展提供了新的机制见解[1]。

PRDM11基因在脂肪细胞增殖中也发挥着重要作用。研究发现,牛源microRNA-2400可以促进牛前脂肪细胞的增殖。MicroRNA-2400过表达增加了前脂肪细胞的增殖速率,并通过结合PRDM11 mRNA的3'非编码区(3'UTR)来下调PRDM11的表达。这表明,microRNA-2400可以通过靶向PRDM11来促进前脂肪细胞的增殖[2]。

PRDM11基因在乳腺癌的预后和免疫治疗中也具有重要意义。研究发现,基于染色质调节相关基因的基因模型可以预测乳腺癌患者的生存状况。在这个模型中,PRDM11基因被确定为6个与染色质调节相关的差异表达基因之一。该基因模型在预测乳腺癌患者的预后方面表现出良好的预测性能。此外,该模型还可以用于评估乳腺癌患者的免疫细胞浸润和免疫治疗疗效[3]。

PRDM11基因在鱼类发育和生殖中也发挥作用。研究发现,在自交的雌雄同体鱼类Kryptolebias marmoratus中,PRDM11基因编码的组蛋白甲基转移酶在胚胎发育和成年组织中表达。PRDM11基因的表达模式在胚胎发育过程中变化较大,高峰期出现在原肠胚阶段,随后逐渐降低。此外,PRDM11基因在雄性大脑中的表达高于雌雄同体大脑,而在雌雄同体卵巢睾丸和雄性睾丸中表现出特定的表达模式。这些结果表明,PRDM11基因可能在K. marmoratus的发育、生殖和神经发生中发挥重要作用[4]。

PRDM11基因在气道炎症反应中也发挥着重要作用。研究发现,PRDM11基因敲除小鼠在卵白蛋白(OVA)致敏和反复OVA气道挑战后,其B细胞数量、CD4+ T细胞数量和支气管肺泡灌洗液中中性粒细胞数量发生变化。此外,PRDM11基因敲除小鼠的肺组织中基因表达发生了广泛变化。这些结果表明,PRDM11基因可能参与调节气道炎症反应和气道平滑肌重塑[5]。

PRDM11基因在进化过程中经历了多次基因复制和基因丢失事件。研究发现,在93种不同物种的基因组中,共鉴定出976个PRDM基因。这些基因被分为14个不同的亚家族,其中11个亚家族在两侧对称动物中具有祖先特征。此外,3个亚家族(PRDM5、PRDM11和PRDM17)在早期脊椎动物进化过程中获得。这些结果表明,PRDM基因家族在动物进化过程中经历了复杂的进化过程,并在不同物种中发挥着多样的生物学功能[6]。

PRDM11基因在抗血小板治疗中可能发挥重要作用。研究发现,使用人工智能(AI)辅助方法可以识别与抗血小板药物反应相关的遗传因素。研究发现,在糖尿病患者中,氯吡格雷抵抗的发生率较高。此外,AI辅助的全基因组关联研究发现,一个包含20个单核苷酸多态性(SNP)的SNP标记与9个蛋白质编码基因相关,其中包括PRDM11基因。这些结果表明,PRDM11基因可能参与调节抗血小板药物的反应[7]。

PRDM11基因在膀胱癌的发生发展中发挥重要作用。研究发现,NSUN2介导的R-loop稳定化是膀胱癌进展和顺铂敏感性的关键驱动因素。NSUN2可以与PRDM11基因的启动子区域结合,并通过招募EZH2来促进PRDM11基因的表观遗传沉默,从而促进膀胱癌的进展。此外,NSUN2敲低可以降低膀胱癌细胞对顺铂的敏感性,并导致DNA损伤水平的增加。这些结果表明,PRDM11基因在膀胱癌的发生发展中发挥重要作用[8]。

PRDM11基因在肺功能中也具有重要意义。研究发现,全基因组关联分析发现,PRDM11基因与肺功能指标用力肺活量(FVC)相关。该研究在52,253个个体中进行了FVC的全基因组关联研究,并在32,917个欧洲血统的个体中进行了后续研究。研究发现在或接近EFEMP1、BMP6、MIR129-2-HSD17B12、PRDM11、WWOX和KCNJ2等基因附近存在与FVC相关的6个新区域。这些结果表明,PRDM11基因可能参与调节肺功能和肺疾病的发病机制[9]。

PRDM11基因在近单倍体急性淋巴母细胞白血病(ALL)中也发挥着重要作用。研究发现,近单倍体ALL的预后较差,而高倍体ALL的预后较好。研究发现,使用下一代测序(NGS)技术可以区分近单倍体ALL和真正的高倍体ALL。研究发现,PRDM11基因在近单倍体ALL中存在纯合子非同义编码突变,这些突变可能影响PRDM11基因的蛋白质功能。这些结果表明,PRDM11基因在近单倍体ALL的发生发展中发挥重要作用[10]。

综上所述,PRDM11基因在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞增殖、凋亡、免疫调节、肿瘤抑制、脂肪细胞增殖、乳腺癌预后和免疫治疗、鱼类发育和生殖、气道炎症反应、抗血小板治疗、膀胱癌发生发展、肺功能和肺疾病、近单倍体ALL等。PRDM11基因的研究有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Fog, Cathrine Kolster, Asmar, Fazila, Côme, Christophe, Grønbæk, Kirsten, Lund, Anders Henrik. 2014. Loss of PRDM11 promotes MYC-driven lymphomagenesis. In Blood, 125, 1272-81. doi:10.1182/blood-2014-03-560805. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25499759/
2. Wei, Yao, Cui, Ya Feng, Tong, Hui Li, Zhang, Wei Wei, Yan, Yun Qin. 2016. MicroRNA-2400 promotes bovine preadipocyte proliferation. In Biochemical and biophysical research communications, 478, 1054-9. doi:10.1016/j.bbrc.2016.08.038. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27514450/
3. Feng, Dongxu, Li, Wenbing, Wu, Wei, Shi, Wenjie, Li, Huichao. 2023. Chromatin Regulator-Related Gene Signature for Predicting Prognosis and Immunotherapy Efficacy in Breast Cancer. In Journal of oncology, 2023, 2736932. doi:10.1155/2023/2736932. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36755810/
4. Fellous, Alexandre, Earley, Ryan L, Silvestre, Frederic. 2018. The Kdm/Kmt gene families in the self-fertilizing mangrove rivulus fish, Kryptolebias marmoratus, suggest involvement of histone methylation machinery in development and reproduction. In Gene, 687, 173-187. doi:10.1016/j.gene.2018.11.046. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30458291/
5. Horsch, Marion, Aguilar-Pimentel, Juan Antonio, Bönisch, Clemens, de Angelis, Martin Hrabĕ, Beckers, Johannes. 2015. Cox4i2, Ifit2, and Prdm11 Mutant Mice: Effective Selection of Genes Predisposing to an Altered Airway Inflammatory Response from a Large Compendium of Mutant Mouse Lines. In PloS one, 10, e0134503. doi:10.1371/journal.pone.0134503. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26263558/
6. Vervoort, Michel, Meulemeester, David, Béhague, Julien, Kerner, Pierre. 2015. Evolution of Prdm Genes in Animals: Insights from Comparative Genomics. In Molecular biology and evolution, 33, 679-96. doi:10.1093/molbev/msv260. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26560352/
7. Yeh, Chi-Hsiao, Chou, Yi-Ju, Tsai, Tsung-Hsien, Sytwu, Huey-Kang, Tsai, Ting-Fen. 2022. Artificial-Intelligence-Assisted Discovery of Genetic Factors for Precision Medicine of Antiplatelet Therapy in Diabetic Peripheral Artery Disease. In Biomedicines, 10, . doi:10.3390/biomedicines10010116. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35052795/
8. Wu, Yuqing, Ying, Yufan, Zhang, Fenghao, Xie, Liping, Zheng, Xiangyi. 2024. NSUN2-mediated R-loop stabilization as a key driver of bladder cancer progression and cisplatin sensitivity. In Cancer letters, 611, 217416. doi:10.1016/j.canlet.2024.217416. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39732321/
9. Loth, Daan W, Soler Artigas, María, Gharib, Sina A, Tobin, Martin D, London, Stephanie J. 2014. Genome-wide association analysis identifies six new loci associated with forced vital capacity. In Nature genetics, 46, 669-77. doi:10.1038/ng.3011. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24929828/
10. Chen, Cai, Bartenhagen, Christoph, Gombert, Michael, Hu, Jianda, Borkhardt, Arndt. 2013. Next-generation-sequencing-based risk stratification and identification of new genes involved in structural and sequence variations in near haploid lymphoblastic leukemia. In Genes, chromosomes & cancer, 52, 564-79. doi:10.1002/gcc.22054. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23508829/