Krtap4-25-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Krtap4-25-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-00029

品系全称

C57BL/6JCya-Krtap4-25em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-100040248-Krtap4-25-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Krtap4-25-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-00029) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
keratin associated protein 4-25
基因别称
2310045F10Rik,Gm11563
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001126320.2 | Ensembl: ENSMUST00000092695
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~502 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Gm11563是一种未知的基因,在已知的生物信息数据库中并未找到关于该基因的具体信息。基因Gm11563可能是一个假定的基因,或者是一个尚未被广泛研究的基因。然而,我们可以从已知的基因研究中获取一些线索,来推测Gm11563可能的功能和重要性。

首先,基因复制和基因丢失是动物基因组进化过程中的常见事件,两者之间的平衡关系对物种间基因数量的差异产生了重要影响。在基因复制后,两个子基因通常以大致相同的速度积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,一个基因副本会与另一个副本发生显著差异。这种“不对称进化”在串联基因复制后比全基因组复制后更为常见,可以产生新的基因。例如,在蛾、软体动物和哺乳动物的复制同源盒基因中,不对称进化产生了新的同源盒基因,并被招募到新的发育角色中[1]。

此外,乳腺癌是一种异质性疾病,大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常见于乳腺癌高发的家庭,与多个高、中、低渗透性的易感基因有关。家族连锁研究表明,BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53等高渗透性基因负责遗传综合征。此外,家族和人群研究方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关[2]。

在基因工程方面,基因电路是后基因组时代研究的一个重点,旨在理解细胞现象如何从基因和蛋白质的连接中产生。这种连接生成分子网络图,类似于复杂的电子电路,需要发展一个数学框架来描述电路。从工程角度来看,构建和分析构成网络的底层子模块是通往这一框架的自然途径。测序和基因工程的最新实验进展使得设计、实施和建模合成基因网络成为可能,从而产生了基因电路学科。合成基因网络将导致新的逻辑形式的细胞控制,这在功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗方面具有潜在的重要应用[3]。

基因敲除是生物学中常用的方法,用于探索基因功能。基因敲除会产生完全丧失功能的基因型,最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。在酵母中,全基因组敲除分析表明,基因组中约有四分之一的基因可能是必需的。与基因型-表型关系一样,基因必需性也受背景效应的影响,并可能因基因-基因相互作用而变化。对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子得到拯救。这种“必需性绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种尚未充分研究的遗传抑制类型。最近的系统分析表明,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用绕过[4]。

基因调控网络是生物信息学中一个重要的研究领域,旨在理解基因表达如何受到调控,从而影响细胞过程和生物体的整体功能。基因调控网络研究有助于揭示基因表达模式,预测基因功能,并理解疾病发生机制[5]。

PlantCARE是一个植物顺式作用调控元件数据库,提供了植物顺式作用调控元件、增强子和抑制子的信息。PlantCARE数据库通过位置矩阵、一致性序列和特定启动子序列上的单个位点来表示调控元件。它还提供了与EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接,并提供了转录因子位点的置信度水平、功能信息和在启动子上的位置。PlantCARE数据库还可以用于搜索查询序列中的植物顺式作用调控元件,并提供了新的聚类和基序搜索方法来研究共表达基因簇[6]。

基因片段是基因序列的一部分,可能在基因表达和调控中发挥作用。基因片段的研究有助于理解基因结构和功能,以及基因表达调控的机制[7]。

植物的抗病反应依赖于抗病基因的表达。抗病基因的表达可以激活植物的抗病反应,从而保护植物免受病原体的侵害。抗病基因的表达受到多种因素的调控,包括病原体相关分子模式(PAMPs)、效应蛋白和信号传导途径[8]。

MHC基因的表达受到多种转录因子的调控,包括H-2RIIBP/RXR beta、NK kappa B、I-kappa B、hXBP-1和NF-Y。这些转录因子与MHC基因的启动子相互作用,影响MHC基因的表达。此外,基因组原位足迹分析等新技术为研究MHC基因的调控提供了新的见解[9]。

基因的定义是生物学中的一个基本问题。基因是生物体遗传信息的基本单位,负责编码蛋白质或RNA分子,从而影响生物体的结构和功能。基因的定义随着科学技术的不断发展而演变,从最初的结构和功能定义到现代的分子和遗传定义[10]。

综上所述,基因Gm11563可能是一个未知的基因,但在已知的基因研究中,我们可以找到一些线索来推测其可能的功能和重要性。基因复制和基因丢失是动物基因组进化过程中的常见事件,可以产生新的基因。乳腺癌和其他疾病的发生与多个基因的突变和表达异常有关。基因工程和基因电路研究为理解基因功能和调控提供了新的工具和方法。基因调控网络和基因表达调控研究有助于揭示基因表达模式,预测基因功能,并理解疾病发生机制。PlantCARE数据库和其他基因数据库提供了丰富的基因信息,有助于研究基因结构和功能。基因片段和植物抗病基因的研究有助于理解基因表达调控的机制。MHC基因的表达受到多种转录因子的调控,影响免疫系统的功能。基因的定义随着科学技术的不断发展而演变,从最初的结构和功能定义到现代的分子和遗传定义。基因Gm11563的研究可能有助于我们更好地理解基因功能和调控,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/