Pym1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Pym1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-18730

品系全称

C57BL/6JCya-Pym1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-78428-Pym1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pym1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-18730) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
PYM homolog 1, exon junction complex associated factor
基因别称
A030010B05Rik,Pym,Wibg
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_030100.4 | Ensembl: ENSMUST00000163377
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~2.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Pym1基因编码的蛋白,也称为PYM1,是一种与剪接和翻译过程密切相关的蛋白质。在剪接过程中,外显子连接复合物(EJC)被沉积在mRNA上,作为基因内含子和外显子结构的标志,并在细胞质中指导转录后过程。PYM1作为EJC的解组装因子,参与EJC的去除和循环。研究表明,EJC的组装中间体对PYM1不敏感,而完全组装的EJC则会被PYM1从剪接后的mRNA上分离。这种解组装过程涉及PYM1与EJC蛋白MAGOH-Y14的结合。当细胞中PYM1过表达时,EJC与剪接后mRNA的结合会被破坏,并且无义介导的mRNA降解被抑制。相反,当细胞中缺乏PYM1时,EJC会在剪接后的mRNA上积累,并且EJC蛋白的循环受损。因此,PYM1是EJC解组装因子,在体外和活细胞中发挥作用,并拮抗EJC的重要功能[3]。

PYM1在翻译过程中也发挥着重要作用。研究表明,PYM1可以与细胞质中的EJC结合,并通过另一个独立的区域与40S核糖体亚基和48S前起始复合物结合。此外,PYM1的敲低会降低由包含内含子的前mRNA产生的报告蛋白的翻译效率。因此,PYM1可能作为EJC携带的剪接后mRNA与翻译机器之间的桥梁,增强mRNA的翻译[4]。

PYM1还与病毒感染有关。研究表明,西尼罗病毒(WNV)、登革热病毒和寨卡病毒的外壳蛋白与一组保守的蛋白质相互作用,这些蛋白质影响病毒感染。这些蛋白质包括EJC循环因子PYM1,它对所有三种病毒都具有抗病毒作用。EJC在无义介导的降解(NMD)中发挥作用,研究发现EJC和NMD都具有抗病毒作用,并且EJC蛋白RBM8A直接与WNV RNA结合。为了对抗这种作用,黄病毒感染会抑制NMD,并且外壳蛋白-PYM1的相互作用会干扰EJC蛋白的功能和定位。PYM1的耗竭会减弱RBM8A与病毒RNA的结合,这表明WNV通过隔离PYM1来保护病毒RNA免受降解。这些数据表明,病毒和宿主之间在调节NMD和EJC方面存在着复杂的相互作用[1]。

PYM1还与生殖性状有关。在大型白猪中,全基因组关联研究(GWAS)发现,PYM1基因与细胞增殖、DNA修复和代谢相关,这表明PYM1可能参与调节生殖性状[2]。

PYM1还与Kaposi肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)的ORF57蛋白相互作用,增强病毒无内含子mRNA的翻译。ORF57蛋白与48S前起始复合物和40S核糖体亚基相互作用,并与PYM1直接结合。详细生化分析表明,ORF57将PYM1招募到无内含子的KSHV mRNA上,然后PYM1促进ORF57和细胞翻译机器的结合。因此,PYM1可能通过与ORF57蛋白的相互作用来增强无内含子KSHV转录本的翻译[5]。

此外,PYM1还与BCR-ABL1-STAT5信号通路相关。研究发现,新型萘醌-香豆素杂化物NPQ-C6可以抑制BCR-ABL1-STAT5信号通路,并降低伊马替尼耐药慢性粒细胞白血病细胞的存活率。NPQ-C6通过抑制BCR-ABL1和STAT5的表达来抑制该信号通路,并下调c-MYC和PYM-1的表达。此外,NPQ-C6还抑制STAT5/STAT3依赖的转录和DNA结合活性。这些结果表明,NPQ-C6可能是治疗BCR-ABL1-STAT5相关恶性肿瘤的新型多激酶调节剂[6]。

综上所述,PYM1是一种与剪接和翻译过程密切相关的蛋白质,参与EJC的解组装和mRNA的翻译。PYM1还与病毒感染、生殖性状和信号通路相关,在多种生物学过程中发挥重要作用。进一步研究PYM1的功能和机制,有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Li, Minghua, Johnson, Jeffrey R, Truong, Billy, Cherry, Sara, Ramage, Holly. 2019. Identification of antiviral roles for the exon-junction complex and nonsense-mediated decay in flaviviral infection. In Nature microbiology, 4, 985-995. doi:10.1038/s41564-019-0375-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30833725/
2. Zhang, Hao, Bao, Shiqian, Zhao, Xiaona, Li, Fuzhong, Zhang, Wuping. 2024. Genome-Wide Association Study and Phenotype Prediction of Reproductive Traits in Large White Pigs. In Animals : an open access journal from MDPI, 14, . doi:10.3390/ani14233348. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39682314/
3. Gehring, Niels H, Lamprinaki, Styliani, Kulozik, Andreas E, Hentze, Matthias W. . Disassembly of exon junction complexes by PYM. In Cell, 137, 536-48. doi:10.1016/j.cell.2009.02.042. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19410547/
4. Diem, Michael D, Chan, Chia C, Younis, Ihab, Dreyfuss, Gideon. 2007. PYM binds the cytoplasmic exon-junction complex and ribosomes to enhance translation of spliced mRNAs. In Nature structural & molecular biology, 14, 1173-9. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18026120/
5. Boyne, James R, Jackson, Brian R, Taylor, Adam, Macnab, Stuart A, Whitehouse, Adrian. 2010. Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus ORF57 protein interacts with PYM to enhance translation of viral intronless mRNAs. In The EMBO journal, 29, 1851-64. doi:10.1038/emboj.2010.77. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20436455/
6. Martín-Rodríguez, Patricia, Guerra, Borja, Hueso-Falcón, Idaira, Estévez-Braun, Ana, Fernández-Pérez, Leandro. 2019. A Novel Naphthoquinone-Coumarin Hybrid That Inhibits BCR-ABL1-STAT5 Oncogenic Pathway and Reduces Survival in Imatinib-Resistant Chronic Myelogenous Leukemia Cells. In Frontiers in pharmacology, 9, 1546. doi:10.3389/fphar.2018.01546. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30687103/