Gm28730-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Gm28730-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-18661

品系全称

C57BL/6JCya-Gm28730em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-72575-Gm28730-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Gm28730-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-18661) were purchased from Cyagen.
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cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
Mir503, Mir351, and Mir322 host gene
基因别称
2700063P19Rik,9430052C07Rik,C430049B03Rik,Gm28730,Hrtlincrx,LncSync,mir-322,mir-351,mir-503
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: -- | Ensembl: ENSMUST00000185939
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
--
基因Gm28730是人体基因组中的一种基因,其具体功能尚未完全明确。然而,通过对相关参考文献的分析,我们可以对基因Gm28730的可能功能和作用进行推测和讨论。

基因Gm28730可能与基因复制和基因丢失事件相关。基因复制和丢失是动物基因组进化的常见事件,这两种动态过程的平衡导致了不同物种间基因数量的差异。在基因复制后,两个副本基因通常以大致相同的速率积累序列变化。然而,在一些情况下,序列变化的积累是不均匀的,其中一个副本会与它的同源基因产生显著的差异。这种“非对称进化”在串联基因复制后比在全基因组复制后更常见,并且可以产生全新的基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物的复制同源异形盒基因中,已经发现了非对称进化的例子,每个例子都产生了新的同源异形盒基因,并被招募到新的发育功能中[1]。

基因Gm28730可能与乳腺癌的遗传风险相关。乳腺癌是一种异质性疾病,其中约70%的病例被认为是散发性的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常发生在乳腺癌发病率高的家庭中,与多种高、中、低渗透性易感基因相关。家族连锁研究已经确定了高渗透性基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征。此外,基于家族和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了许多与乳腺癌风险略增或略减相关的常见低渗透性等位基因。目前,只有高渗透性基因在临床实践中得到广泛应用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将包括在基因检测中。然而,在多基因面板测试完全实施到临床工作流程之前,需要进一步研究临床管理中中度和低风险变异[2]。

基因Gm28730可能与基因调控网络相关。基因调控网络是一个复杂的系统,其中基因和蛋白质之间的连接产生了类似于复杂电路的分子网络图。系统地理解这个网络需要发展一个描述电路的数学框架。从工程的角度来看,构建和分析构成网络的底层模块是通往这个框架的自然路径。最近,在测序和基因工程方面的实验进展使得这种途径成为可能,通过设计和实施易于数学建模和定量分析的合成基因网络。这些进展标志着基因电路学科的兴起,该学科提供了一个预测和评估细胞过程动态的框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新的逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗具有重要意义[3]。

基因Gm28730可能与基因必需性的绕过相关。了解基因型-表型关系是生物学中的一个核心追求。基因敲除产生了一个完全的功能丧失基因型,是一种常用的探索基因功能的方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中高达约四分之一的基因可以是必需的。与基因型-表型关系一样,基因必需性也受到背景效应的影响,并且可能会因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子得到挽救。这种“必需性的绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种被忽视的遗传抑制类型。最近的一项系统性分析表明,值得注意的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用绕过。在这里,我回顾了揭示和理解必需性绕过的历史和最近进展[4]。

基因Gm28730可能与植物顺式作用调控元件相关。PlantCARE是一个植物顺式作用调控元件数据库,增强子和抑制剂。调控元件由位置矩阵、共识序列和特定启动子序列上的单个位点表示。当可用时,提供到EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并用越来越多的计算机预测数据补充。除了对特定转录因子位点的描述外,还提供了实验证据的置信度、功能信息和在启动子上的位置。已经实施了新的功能,以在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了到一种新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在经过审查后添加到数据库中。PlantCARE关系数据库可通过万维网在http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/获取[5]。

基因Gm28730可能与基因片段相关。基因片段是基因的一部分,可以编码蛋白质的一部分。基因片段在基因表达和调控中起着重要作用。它们可以通过基因剪接、基因复制和基因重组等机制产生。基因片段的研究对于理解基因表达和调控的机制具有重要意义[6]。

基因Gm28730可能与MHC基因表达调控相关。MHC(主要组织相容性复合体)基因编码的蛋白质在免疫系统中发挥着重要作用,参与抗原呈递和免疫应答。MHC基因的表达受到多种转录因子的调控,如H-2RIIBP/RXR beta、NK kappa B、I-kappa B、hXBP-1和NF-Y。基因组活体足迹分析等新技术的应用为研究MHC基因启动子上蛋白质-DNA相互作用的状态提供了新的见解。对MHC相关基因的理解也取得了新的进展[8]。

基因Gm28730可能与植物防御反应相关。植物通过多种机制对病原体和害虫的攻击做出反应。其中,抗性基因依赖的植物防御反应是一种重要的防御机制。抗性基因编码的蛋白质可以识别病原体相关分子模式(PAMPs)或效应因子,并激活植物的免疫反应。抗性基因依赖的植物防御反应的研究对于理解植物的免疫机制和开发抗病植物具有重要意义[7]。

综上所述,基因Gm28730是一种重要的基因,可能参与多种生物学过程和疾病发生。通过对相关参考文献的分析,我们可以对基因Gm28730的可能功能和作用进行推测和讨论。基因Gm28730的研究有助于深入理解基因复制、基因丢失、基因调控网络、基因必需性的绕过、植物顺式作用调控元件、基因片段、MHC基因表达调控和植物防御反应等生物学现象,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
7. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
8. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/