Vps29-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Vps29-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-18619

品系全称

C57BL/6JCya-Vps29em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-56433-Vps29-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Vps29-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-18619) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
VPS29 retromer complex component
基因别称
2010015D08Rik,PEP11
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_019780 | Ensembl: ENSMUST00000155671
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~4
敲除长度
~4.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Vps29,即Vacuolar protein sorting-associated protein 29,是一种在细胞内蛋白质分选过程中发挥重要作用的蛋白质。Vps29作为Retromer复合体的一部分,参与细胞内蛋白质从内体到高尔基体或质膜的回收。Retromer复合体由Vps26、Vps29和Vps35三个亚基组成,负责选择和运输货物蛋白。Vps29在维持细胞内蛋白质的平衡和定位中发挥着关键作用,同时与多种生物学过程相关,包括细胞极性的建立和维持、神经退行性疾病的发生等。

在肿瘤学领域,Vps29与肝癌的发生和发展密切相关。研究表明,Vps29在多种类型的癌症中表达上调,包括肝癌。在肝癌患者中,Vps29的高表达往往预示着不良预后。Vps29被证实是肝癌患者的一个独立预后因素,并且具有很高的诊断价值。此外,Vps29的表达与临床特征、DNA甲基化、免疫微环境、肿瘤突变负荷和药物敏感性等也密切相关。Vps29的表达与DNA甲基化水平呈负相关,多个甲基化位点与Vps29的表达和肝癌患者的预后相关。Vps29的表达与免疫细胞浸润失调相关,包括CD8+ T细胞、嗜酸性粒细胞、中性粒细胞、Tcm、NK CD56bright细胞、TFH、Th2细胞、Th17细胞等。药物敏感性分析表明,Vps29可以指示不同表达亚组对10种常见抗肿瘤药物的治疗反应[1]。

在免疫治疗领域,Vps29也与免疫治疗耐药性相关。研究表明,癌症干细胞特征与免疫治疗耐药性相关,而Vps29作为癌症干细胞特征基因之一,与免疫治疗耐药性密切相关。Vps29基因列表显著富集了3%的排名前50的基因,这些基因可能在增强肿瘤免疫反应中发挥重要作用。此外,Vps29的表达与肿瘤免疫微环境相关,Vps29高表达的患者往往具有较差的免疫治疗反应[2]。

在神经退行性疾病领域,Vps29也与tau蛋白病的发生和发展相关。研究表明,Vps29是tau蛋白病理过程的遗传修饰因子之一,参与tau蛋白的传播和聚集。在tau蛋白病的模型中,抑制Vps29的表达可以抑制tau蛋白的传播和聚集,为tau蛋白病的治疗提供了新的思路[3]。

在病毒感染领域,Vps29也与病毒感染相关。研究表明,Vps29是冠状病毒、流感病毒和丝状病毒等多种病毒感染的关键宿主因子。Vps29的缺陷会导致内体形态和酸度的改变,影响病毒感染过程。Vps29在病毒感染中的作用具有双重性,既可以增强某些病毒的感染能力,也可以抑制其他病毒的感染[4]。

综上所述,Vps29是一种在多种生物学过程中发挥重要作用的蛋白质,包括细胞内蛋白质分选、肿瘤发生发展、免疫治疗耐药性、神经退行性疾病和病毒感染等。Vps29的研究有助于深入理解这些生物学过程的机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Yao, Y-Q, Lv, J-L. . Potential functions and causal associations of VPS29 in hepatocellular carcinoma: a bioinformatic and Mendelian randomization study. In European review for medical and pharmacological sciences, 27, 9586-9600. doi:10.26355/eurrev_202310_34131. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37916325/
2. Zhang, Zhen, Wang, Zi-Xian, Chen, Yan-Xing, Qiu, Miao-Zhen, Xu, Rui-Hua. 2022. Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data reveals a pan-cancer stemness signature predicting immunotherapy response. In Genome medicine, 14, 45. doi:10.1186/s13073-022-01050-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35488273/
3. Parra Bravo, Celeste, Giani, Alice Maria, Madero-Perez, Jesus, Gong, Shiaoching, Gan, Li. 2024. Human iPSC 4R tauopathy model uncovers modifiers of tau propagation. In Cell, 187, 2446-2464.e22. doi:10.1016/j.cell.2024.03.015. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38582079/
4. Poston, Daniel, Weisblum, Yiska, Hobbs, Alvaro, Bieniasz, Paul D. 2022. VPS29 Exerts Opposing Effects on Endocytic Viral Entry. In mBio, 13, e0300221. doi:10.1128/mbio.03002-21. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35229640/