Tyw3-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Tyw3-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-18373

品系全称

C57BL/6JCya-Tyw3em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-209584-Tyw3-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tyw3-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-18373) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae)
基因别称
5230400J09Rik
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172474 | Ensembl: ENSMUST00000052774
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~4.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
TYW3基因,也称为tRNA wybutosine synthase 3,是编码tRNA修饰酶的一种基因。该基因位于1号染色体上,主要负责在tRNA上合成超修饰核苷酸wybutosine(yW),这是一种在真核生物中发现的特异性的三环核苷。yW在tRNA的3'位点上,靠近反密码子,对维持正确的密码子-反密码子相互作用至关重要,从而确保蛋白质合成的准确性[4]。

根据Noma等人的研究,yW的合成需要五种酶,包括TYW1、TYW2、TYW3和TYW4,它们在酵母中分别由YPL207w、YML005w、YOL141w和YGL050w基因编码[4]。这些酶在yW的合成过程中协同作用,形成一个多酶复合物,参与yW的逐步合成。此外,Noma等人的研究还表明,植物中的同源基因是一个大融合蛋白,包含TYW2和TYW3的C端结构域以及TYW4的C端结构域,这表明在植物中yW的合成也可能通过类似的多酶复合物进行[4]。

除了在yW合成中的作用外,TYW3基因的表达还与一些疾病的发生和发展有关。例如,Qi等人通过全基因组关联分析发现,TYW3/CRYZ基因附近的单核苷酸多态性(SNP)与循环中的抵抗素水平相关,抵抗素是一种与胰岛素抵抗、炎症以及2型糖尿病和心血管疾病风险相关的多肽激素[1]。此外,Wei等人发现TYW3/CRYZ基因是中国汉族人群中肌萎缩侧索硬化症(ALS)的易感基因之一,这表明TYW3基因的突变可能与ALS的发病机制有关[2]。

此外,Du等人发现TYW3基因在食管癌(ESCA)患者中表达下调,并且是预测ESCA患者预后的独立因素之一[3]。这些研究结果提示,TYW3基因可能在多种疾病的发生和发展中发挥重要作用,但其具体作用机制尚需进一步研究。

除了上述研究结果外,还有其他研究探讨了TYW3基因的功能和作用机制。例如,Hildonen等人通过全基因组DNA甲基化分析发现,TYW3基因附近的DNA甲基化水平与双胞胎出生体重的差异相关,这表明TYW3基因的甲基化状态可能与生长发育有关[6]。此外,Laboulaye等人通过定位转座子插入位点发现,TYW3基因的表达受到邻近基因的调控,这提示TYW3基因的表达可能与基因组位置有关[5]。

综上所述,TYW3基因在yW合成、疾病发生和发展以及生长发育等方面发挥着重要作用。尽管TYW3基因的具体作用机制尚需进一步研究,但已有的研究结果已经为我们深入了解TYW3基因的功能和作用提供了重要的线索。未来,对TYW3基因的深入研究有望为相关疾病的诊断、治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Qi, Qibin, Menzaghi, Claudia, Smith, Shelly, Liu, Yongmei, Qi, Lu. 2012. Genome-wide association analysis identifies TYW3/CRYZ and NDST4 loci associated with circulating resistin levels. In Human molecular genetics, 21, 4774-80. doi:10.1093/hmg/dds300. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22843503/
2. Wei, Ling, Tian, Yanghua, Chen, Yongping, Shang, Huifang, Wang, Kai. 2019. Identification of TYW3/CRYZ and FGD4 as susceptibility genes for amyotrophic lateral sclerosis. In Neurology. Genetics, 5, e375. doi:10.1212/NXG.0000000000000375. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31872054/
3. Du, Hailei, Li, Yong, Pang, Shuai, Hang, Junbiao, Chen, Ling. 2023. Development and validation of a prognostic model based on RNA binding proteins in patients with esophageal cancer. In Journal of thoracic disease, 15, 6178-6191. doi:10.21037/jtd-23-1307. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38090289/
4. Noma, Akiko, Kirino, Yohei, Ikeuchi, Yoshiho, Suzuki, Tsutomu. 2006. Biosynthesis of wybutosine, a hyper-modified nucleoside in eukaryotic phenylalanine tRNA. In The EMBO journal, 25, 2142-54. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16642040/
5. Laboulaye, Mallory A, Duan, Xin, Qiao, Mu, Whitney, Irene E, Sanes, Joshua R. 2018. Mapping Transgene Insertion Sites Reveals Complex Interactions Between Mouse Transgenes and Neighboring Endogenous Genes. In Frontiers in molecular neuroscience, 11, 385. doi:10.3389/fnmol.2018.00385. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30405348/
6. Chen, Mubo, Baumbach, Jan, Vandin, Fabio, Christiansen, Lene, Tan, Qihua. 2016. Differentially Methylated Genomic Regions in Birth-Weight Discordant Twin Pairs. In Annals of human genetics, 80, 81-7. doi:10.1111/ahg.12146. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26831219/