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Banp-flox 基因敲除小鼠

Banp-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Banp-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-18212

品系全称

C57BL/6JCya-Banpem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-53325-Banp-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Banp-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-18212) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
BTG3 associated nuclear protein
基因别称
SMAR1
染色体号
Chr 8 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_016812.4 | Ensembl: ENSMUST00000170857
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5~6
敲除长度
~2.6 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
Banp，即Btg3-associated nuclear protein（Btg3相关核蛋白），是一种在哺乳动物基因组中具有重要功能的转录因子。Banp能够结合特定的DNA序列，如CGCG元素，并激活CpG岛（CGI）启动子控制的基因转录。这种激活作用对于维持细胞代谢、发育和生存至关重要。

Banp的DNA结合活性受到其BEN结构域的调控。BEN结构域是一种DNA结合结构域，能够识别并结合特定的DNA序列。Banp的BEN结构域能够结合CGCG序列或包含AAA的基质附着区（MAR）DNA序列。Banp的BEN结构域主要通过静电相互作用与DNA结合，并具有一定的碱基特异性相互作用，如与TC基序的相互作用。

Banp的转录调控功能受到DNA甲基化的影响。DNA甲基化是一种表观遗传修饰，能够抑制基因表达。Banp结合位点的DNA甲基化会阻碍Banp的结合，从而抑制基因的转录。Banp的结合位点在异常甲基化的CGI启动子中存在差异，这可能与癌症细胞的异常基因表达有关。

Banp在细胞周期中也发挥着重要作用。Banp参与DNA损伤应答和有丝分裂过程中的染色体分离。Banp的缺失会导致细胞周期停滞和细胞凋亡。Banp通过激活DNA复制叉调节因子wrnip1和染色体分离调节因子cenpt和ncapg的转录，来修复DNA损伤并促进染色体分离。Banp在细胞周期进展和细胞生存中发挥着重要作用。

Banp的表达和功能还受到circRNA的调控。circRNA是一种非编码RNA，具有多种生物学功能。circ-BANP是一种由Banp基因产生的circRNA。circ-BANP能够与miR-503结合，并抑制miR-503的表达。miR-503能够靶向LARP1，从而抑制LARP1的表达。circ-BANP通过抑制miR-503的表达，导致LARP1的表达增加，进而促进肺癌细胞的生长、迁移和侵袭。

Banp在多种癌症中发挥重要作用。Banp的表达与肝癌、结直肠癌和肺癌的恶性进展相关。circ-BANP的过表达与肝癌的恶性进展相关。circ-BANP能够与let-7f-5p结合，并抑制let-7f-5p的表达。let-7f-5p能够靶向TLR4，从而抑制TLR4的表达。circ-BANP通过抑制let-7f-5p的表达，导致TLR4的表达增加，进而激活TLR4/STAT3信号通路，促进肝癌细胞的增殖、侵袭、迁移和上皮-间质转化。

综上所述，Banp是一种重要的转录因子，参与调控基因表达和细胞周期。Banp的DNA结合活性受到其BEN结构域的调控，并受到DNA甲基化的影响。Banp在细胞周期进展和细胞生存中发挥着重要作用。Banp的表达和功能还受到circRNA的调控。Banp在多种癌症中发挥重要作用，为癌症的治疗和预防提供了新的思路和策略[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10]。

参考文献：
1. Grand, Ralph S, Burger, Lukas, Gräwe, Cathrin, Vermeulen, Michiel, Schübeler, Dirk. 2021. BANP opens chromatin and activates CpG-island-regulated genes. In Nature, 596, 133-137. doi:10.1038/s41586-021-03689-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34234345/
2. Li, Guoming, Kong, Jian, Dong, Shuying, Wu, Shilun, Sun, Wenbing. 2022. Circular BANP knockdown inhibits the malignant progression of residual hepatocellular carcinoma after insufficient radiofrequency ablation. In Chinese medical journal, , . doi:10.1097/cm9.00000000000001822. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35941728/
3. Babu, Swathy, Takeuchi, Yuki, Masai, Ichiro. 2022. Banp regulates DNA damage response and chromosome segregation during the cell cycle in zebrafish retina. In eLife, 11, . doi:10.7554/eLife.74611. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35942692/
4. Zhu, Mingchen, Xu, Yijun, Chen, Yun, Yan, Feng. 2017. Circular BANP, an upregulated circular RNA that modulates cell proliferation in colorectal cancer. In Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie, 88, 138-144. doi:10.1016/j.biopha.2016.12.097. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28103507/
5. Li, Guoming, Kong, Jian, Dong, Shuying, Wu, Shilun, Sun, Wenbing. 2022. Circular BANP knockdown inhibits the malignant progression of residual hepatocellular carcinoma after insufficient radiofrequency ablation. In Chinese medical journal, 135, 1578-87. doi:10.1097/CM9.0000000000001822. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34985013/
6. Han, Jingquan, Zhao, Guibin, Ma, Xiao, Wang, Yue, Cui, Jian. 2018. CircRNA circ-BANP-mediated miR-503/LARP1 signaling contributes to lung cancer progression. In Biochemical and biophysical research communications, 503, 2429-2435. doi:10.1016/j.bbrc.2018.06.172. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29969631/
7. Chen, Guang, Li, Yongjun, Zhang, Ailing, Gao, Lijun. . Circular RNA Circ-BANP Regulates Oxidized Low-density Lipoprotein-induced Endothelial Cell Injury Through Targeting the miR-370/Thioredoxin-interacting Protein Axis. In Journal of cardiovascular pharmacology, 77, 349-359. doi:10.1097/FJC.0000000000000964. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33298736/
8. Liu, Ke, Zhang, Jin, Xiao, Yuqing, Hughes, Timothy R, Min, Jinrong. 2023. Structural insights into DNA recognition by the BEN domain of the transcription factor BANP. In The Journal of biological chemistry, 299, 104734. doi:10.1016/j.jbc.2023.104734. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37086783/
9. Kurniawan, Fredy, Prasanth, Supriya G. 2022. A BEN-domain protein and polycomb complex work coordinately to regulate transcription. In Transcription, 13, 82-87. doi:10.1080/21541264.2022.2105128. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35904285/
10. Villar, Sara, Ariceta, Beñat, Agirre, Xabier, Prósper, Felipe, Montesinos, Pau. 2022. The transcriptomic landscape of elderly acute myeloid leukemia identifies B7H3 and BANP as a favorable signature in high-risk patients. In Frontiers in oncology, 12, 1054458. doi:10.3389/fonc.2022.1054458. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36505804/

资料下载

S-CKO-18212_6J_53325_Banp_Exon 5~6_strategy.pdf
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