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Nabp1-flox 基因敲除小鼠

Nabp1-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Nabp1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-18191

品系全称

C57BL/6JCya-Nabp1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-109019-Nabp1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Nabp1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-18191) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
nucleic acid binding protein 1
基因别称
4930434H03Rik，4930442A21Rik，4930488J04Rik，4933440J18Rik，5830411E10Rik，Nbp1，Obfc2a，Ssb2
染色体号
Chr 1 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_028696 | Ensembl: ENSMUST00000027279
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5
敲除长度
~0.9 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1923258Mice homozygous for a knock-out allele are viable, fertile and overtly normal with no detectable changes in thymopoiesis, splenic development, or spermatogenesis despite a reduction in testis weight.
更多信息
NABP1，也称为hSSB2（人类单链DNA结合蛋白2），是一种在多种生物过程中发挥重要作用的蛋白质。NABP1是一种单链核酸结合蛋白，主要定位于细胞核，在DNA修复、转录终止和细胞对DNA损伤的反应中发挥着重要作用。NABP1的基因编码一个包含OB（寡核苷酸/寡糖结合）基序的22 kDa蛋白质，该基序在NABP1和其密切相关蛋白NABP2之间高度保守。NABP1的表达受到RORgamma2（视黄酸相关孤儿受体gamma2）的调节，在野生型小鼠的胸腺中高度表达，而在RORgamma-/-小鼠中则被显著抑制。在胸腺发生过程中，NABP1 mRNA的表达仅限于CD4+CD8+胸腺细胞，这与RORgamma2的表达模式相似，提示NABP1的表达可能直接或间接地受到RORgamma2的调节[1]。

NABP1在DNA损伤反应中的作用尤为重要。研究表明，NABP1在细胞对紫外线B（UVB）辐射的响应中起着关键作用。UVB辐射会生成环丁烷嘧啶二聚体（CPD），这些损伤需要通过核苷酸切除修复（NER）途径进行快速检测和修复以维持遗传密码的完整性。NABP1在UVB照射后水平升高，并迅速结合到染色质上。NABP1的缺失会导致复制蛋白A（RPA32）磷酸化显著减少，并损害RPA32在UV诱导的DNA损伤位点上的定位。此外，NABP1的缺失还会导致NER蛋白XPC延迟到达损伤位点，从而使细胞对UVB的敏感性增加。NABP1对单链DNA中的单个CPD和双链DNA中的双碱基错配具有亲和力，提示NABP1可能在DNA损伤的识别和修复中发挥重要作用[3]。

NABP1还与转录终止过程有关。NABP1和NABP2与INTS3结合形成整合子复合物，后者与RNA聚合酶II结合并调节特定靶基因的表达。整合子复合物切割snRNA作为其成熟形式的一部分，并与转录终止密切相关。此外，整合子还结合到复制依赖性组蛋白的3'端以及具有聚腺苷酸转录本的基因的启动子近端区域。整合子亚基的耗尽会导致转录终止失败，组蛋白mRNA处理的破坏，以及snRNA和组蛋白mRNA的聚腺苷化。整合子对基因的启动子近端结合负调控了那些通常具有聚腺苷酸转录本的基因的表达[2]。

除了在DNA损伤修复和转录终止中的作用外，NABP1还与其他疾病的发生发展相关。例如，NABP1的基因多态性与喉鳞状细胞癌（LSCC）患者的生存率相关。研究发现，NABP1附近的单核苷酸多态性（SNP）与LSCC患者的生存率相关，表明NABP1可能作为临床标记物，用于预测患者生存率和指导个体化治疗决策[4]。此外，NABP1还与亨廷顿病的发病机制有关。研究发现，在亨廷顿病的无症状和有症状阶段之间，NABP1基因的表达存在差异，提示NABP1可能在亨廷顿病的发病机制中发挥重要作用[5]。

综上所述，NABP1是一种在DNA修复、转录终止和细胞对DNA损伤的反应中发挥重要作用的蛋白质。NABP1的表达受到RORgamma2的调节，在胸腺发生过程中具有特定的表达模式。NABP1在DNA损伤修复和转录终止中的作用与其对单链核酸的结合能力有关。此外，NABP1还与其他疾病的发生发展相关，包括喉鳞状细胞癌和亨廷顿病。NABP1的研究有助于深入理解其在DNA损伤修复和转录终止中的作用，以及其在疾病发生发展中的潜在机制。

参考文献：
1. Kang, Hong Soon, Beak, Ju Youn, Kim, Yong-Sik, Grissom, Sherry F, Jetten, Anton M. . NABP1, a novel RORgamma-regulated gene encoding a single-stranded nucleic-acid-binding protein. In The Biochemical journal, 397, 89-99. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16533169/
2. Skaar, Jeffrey R, Ferris, Andrea L, Wu, Xiaolin, Hughes, Stephen H, Pagano, Michele. 2015. The Integrator complex controls the termination of transcription at diverse classes of gene targets. In Cell research, 25, 288-305. doi:10.1038/cr.2015.19. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25675981/
3. Boucher, Didier, Kariawasam, Ruvini, Burgess, Joshua, Khanna, Kum Kum, Richard, Derek J. 2021. hSSB2 (NABP1) is required for the recruitment of RPA during the cellular response to DNA UV damage. In Scientific reports, 11, 20256. doi:10.1038/s41598-021-99355-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34642383/
4. Shen, Zhen, Ren, Wanli, Bai, Yanxia, Cao, Peilong, Shao, Yuan. . DIRC3 and near NABP1 genetic polymorphisms are associated laryngeal squamous cell carcinoma patient survival. In Oncotarget, 7, 79596-79604. doi:10.18632/oncotarget.12865. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27793000/
5. Christodoulou, Christiana C, Zachariou, Margarita, Tomazou, Marios, Zamba-Papanicolaou, Eleni, Spyrou, George M. 2020. Investigating the Transition of Pre-Symptomatic to Symptomatic Huntington's Disease Status Based on Omics Data. In International journal of molecular sciences, 21, . doi:10.3390/ijms21197414. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33049985/

资料下载

S-CKO-18191_6J_109019_Nabp1_Exon 5_strategy.pdf
S-CKO-18191_6J_109019_Nabp1_Exon 5_strategy.pdf
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