Arhgef38-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Arhgef38-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-17836

品系全称

C57BL/6JCya-Arhgef38em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-77669-Arhgef38-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Arhgef38-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-17836) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
Rho guanine nucleotide exchange factor 38
基因别称
9130221D24Rik,D630013G24Rik
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001368752 | Ensembl: ENSMUST00000147041
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Arhgef38,也称为Rho Guanine Nucleotide Exchange Factor 38,是一种重要的Rho家族小GTPase的激活因子。Rho家族小GTPase是一类在细胞信号传导中发挥关键作用的蛋白质,它们在细胞骨架重组、细胞粘附、细胞迁移和细胞增殖等生物学过程中发挥着重要作用。Arhgef38通过促进Rho家族小GTPase的激活,进而调节这些生物学过程。Arhgef38在多种疾病中发挥重要作用,包括癫痫、乳腺癌、前列腺癌、唇腭裂和双相情感障碍等。

在癫痫研究中,Arhgef38基因变异与GASH/Sal模型中的癫痫易感性相关。GASH/Sal是一种听觉诱发性癫痫仓鼠模型,其特征是声音诱导的癫痫发作,与人类癫痫患者中观察到的全身性强直阵挛发作相似。通过对GASH/Sal动物及其相应对照动物进行全外显子组测序(WES),研究人员发现Arhgef38基因存在高影响变异,并且在GASH/Sal模型中表达水平升高。此外,Arhgef38基因变异与人类癫痫患者中的基因变异有相似之处,这为癫痫的遗传学研究提供了有价值的线索[1]。

在乳腺癌研究中,Arhgef38基因变异与乳腺癌风险相关。研究发现,ARHGEF38基因中的一个低频错义变异rs61751053与整体乳腺癌风险相关,而另一个常见变异rs76664032与三阴性乳腺癌(TNBC)风险相关。这些发现表明Arhgef38基因变异可能在乳腺癌的发生发展中发挥重要作用[2]。

在前列腺癌研究中,Arhgef38基因表达水平升高与前列腺癌的侵袭性和预后不良相关。研究发现,ARHGEF38基因在前列腺癌组织中表达水平显著高于良性前列腺增生组织,且与Gleason评分呈正相关。此外,ARHGEF38基因的表达水平与前列腺癌的侵袭性和转移性相关,提示ARHGEF38基因可能作为前列腺癌的预后生物标志物[3]。

在唇腭裂研究中,Arhgef38基因变异与唇腭裂的发生相关。通过对唇腭裂患者的全基因组拷贝数变异(CNV)分析,研究人员发现ARHGEF38基因缺失与唇腭裂的发生相关。此外,Arhgef38基因的CRISPR-Cas9突变导致非洲爪蟾和斑马鱼出现类似于人类唇腭裂的颅面畸形,进一步支持了Arhgef38基因在唇腭裂发生中的重要作用[4]。

在双相情感障碍研究中,Arhgef38基因的DNA甲基化水平改变与双相情感障碍和自杀行为相关。研究发现,在自杀死亡的双相情感障碍患者中,ARHGEF38基因中的一个DNA甲基化区域(DMR)显著低甲基化。此外,Arhgef38基因的DNA甲基化水平改变与多个生物学通路相关,包括轴突引导信号通路、钙信号通路、β-肾上腺素能信号通路和鸦片信号通路[5]。

综上所述,Arhgef38基因在多种疾病中发挥重要作用,包括癫痫、乳腺癌、前列腺癌、唇腭裂和双相情感障碍等。Arhgef38基因变异和表达水平改变与这些疾病的发生发展密切相关。Arhgef38基因的研究有助于深入理解这些疾病的发病机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Díaz-Casado, Elena, Gómez-Nieto, Ricardo, de Pereda, José M, Jara-Acevedo, María, López, Dolores E. 2020. Analysis of gene variants in the GASH/Sal model of epilepsy. In PloS one, 15, e0229953. doi:10.1371/journal.pone.0229953. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32168507/
2. Jia, Guochong, Ping, Jie, Guo, Xingyi, Haiman, Christopher A, Zheng, Wei. 2024. Genome-wide association analyses of breast cancer in women of African ancestry identify new susceptibility loci and improve risk prediction. In Nature genetics, 56, 819-826. doi:10.1038/s41588-024-01736-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38741014/
3. Liu, Kun, Wang, Aixiang, Ran, Longke, Sen, Wang, Song, Fangzhou. 2019. ARHGEF38 as a novel biomarker to predict aggressive prostate cancer. In Genes & diseases, 7, 217-224. doi:10.1016/j.gendis.2019.03.004. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32215291/
4. Lansdon, Lisa A, Dickinson, Amanda, Arlis, Sydney, Murray, Jeffrey C, Manak, J Robert. 2022. Genome-wide analysis of copy-number variation in humans with cleft lip and/or cleft palate identifies COBLL1, RIC1, and ARHGEF38 as clefting genes. In American journal of human genetics, 110, 71-91. doi:10.1016/j.ajhg.2022.11.012. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36493769/
5. Liang, Xiangdong, Wang, Yanchao, Pei, Long, Tan, Xiaoliang, Dong, Chunhui. 2022. Identification of Prostate Cancer Risk Genetics Biomarkers Based on Intergraded Bioinformatics Analysis. In Frontiers in surgery, 9, 856446. doi:10.3389/fsurg.2022.856446. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35372462/