Slu7-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Slu7-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-17835

品系全称

C57BL/6JCya-Slu7em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-193116-Slu7-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Slu7-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-17835) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae)
基因别称
D11Ertd730e,D3Bwg0878e
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_198936 | Ensembl: ENSMUST00000020681
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~2.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
SLU7(Splicing factor synergistic lethal with U5 snRNA 7)是一种重要的剪接因子,对于维持基因表达的多样性和精确性至关重要。它最初被发现对于3'剪接位点的正确选择是必需的,这直接影响了细胞中基因转录本的多样性。SLU7不仅参与剪接过程,还参与调控基因表达的不同层次,包括表观遗传DNA重塑、转录调控和蛋白质稳定性。

SLU7在多种生物学过程中发挥关键作用。例如,SLU7对于维持肝脏分化、基因组完整性和细胞周期进展至关重要。SLU7的异常表达与人类疾病有关,包括癌症。有趣的是,尽管SLU7在癌症细胞中起着关键作用,但它也是癌症细胞存活所必需的。因此,SLU7在生理和病理学中的重要作用使其成为治疗人类癌症的潜在靶点[1]。

近年来,研究发现SLU7与环状RNA(circRNA)的功能密切相关。例如,circCAPG可以翻译成一种名为CAPG-171aa的多肽,该多肽通过破坏丝氨酸/苏氨酸激酶38(STK38)与SMAD特异性E3泛素连接酶1(SMURF1)的结合,从而防止MEKK2泛素化和蛋白酶体降解,促进肿瘤生长。此外,SLU7可以调节circCAPG的生物生成,通过结合到circRNA转录物的侧翼Alu序列上[2]。

SLU7还在DNA甲基化中发挥作用。研究发现SLU7对于维持DNMT1蛋白的稳定性和正确的DNA甲基化至关重要。SLU7是参与DNA甲基化维持的蛋白复合物的组成部分,与DNMT1、其适配蛋白UHRF1和组蛋白甲基转移酶G9a相互作用,并在染色质水平上控制它们的完整性。SLU7通过促进DNMT1与HDAC1和去泛素化酶USP7的相互作用,防止DNMT1的乙酰化和降解,从而确保DNMT1的稳定性[3]。

SLU7对于维持肝细胞的核因子4α(HNF4α)的稳定性也至关重要。HNF4α是一种重要的转录因子,对于维持肝脏的分化至关重要。SLU7通过其能力保护肝脏免受氧化应激,从而维持HNF4α1蛋白的稳定性。SLU7被确定为应激颗粒蛋白组的关键成分,是细胞抗氧化机制的重要组成部分。SLU7的表达减少与人类和患病小鼠肝脏中HNF4α P1到P2的使用转换相关。Slu7杂合子/杂合子小鼠表现出对慢性肝损伤和急性肝损伤的敏感性增加、氧化应激增强以及肝功能的明显受损。通过使用表达SLU7的腺相关病毒(AAV-SLU7)感染CCl4损伤的小鼠,可以预防肝脏损伤和肝细胞去分化[4]。

在肝损伤和人类肝细胞癌(HCC)中,无义介导的RNA降解(NMD)过程受到抑制。SLU7与NMD效应因子UPF1相互作用并维持其水平,SLU7对于正确的NMD是必需的。在肝损伤期间激活的caspase导致SLU7的切割和降解。SLU7和UPF1水平的下调以及NMD的抑制是导致肝脏转录组恶性重塑的新分子途径。此外,我们发现caspase的激活是肝病进展过程中SLU7表达下调的机制,这是凋亡和肝细胞癌发生之间新的联系[5]。

SLU7对于维持肝脏稳态至关重要。SLU7的敲低导致人类肝细胞和小鼠肝脏中前mRNA剪接和基因表达发生深刻变化,导致葡萄糖和脂质代谢受损、对关键代谢激素的抵抗以及向胎儿样基因表达模式的逆转。此外,SLU7的丢失还增加了肝细胞增殖并诱导向肿瘤样糖酵解表型的转变。Slu7控制着肝细胞分化所必需的多个基因的剪接和/或表达,包括富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子3(Srsf3)和肝细胞核因子4α(Hnf4α),对于cAMP调节的基因转录至关重要。这些数据表明,SLU7是肝细胞身份和静息状态的中心调节因子[6]。

SARS-CoV-2的非结构蛋白12(NSP12)利用多种宿主剪接因子进行复制和剪接调控。SLU7是与SARS-CoV-2 NSP12相互作用的宿主蛋白之一。当SLU7或PPIL3被敲除时,SARS-CoV-2的进入效率显著降低,这表明宿主基因组的异常剪接是导致这一现象的原因。此外,SARS-CoV-2 RdRp的聚合酶活性和稳定性受到三种剪接因子不同程度的影响。NSP12及其来自SARS-CoV和MERS-CoV的同源物抑制了细胞基因的选择性剪接,这些剪接受到三种剪接因子的影响。这些研究表明SARS-CoV-2 NSP12可以与各种剪接因子相互作用,从而影响病毒进入、复制和基因剪接[7]。

SLU7和Prp18在酵母前mRNA剪接的第二步中协同作用。SLU7蛋白含有两个功能重要的结构域:一个锌指结构域和一个Prp18相互作用结构域。SLU7与Prp18的物理相互作用对于它们在剪接过程中的协同作用至关重要。第二步因子被招募到剪接体中的顺序是:SLU7 --> Prp18 --> Prp22。所有三个蛋白都在第二步完成后与成熟的mRNA一起从剪接体中释放出来[8]。

SLU7是一种重要的剪接因子,对于维持基因表达的多样性和精确性至关重要。SLU7不仅参与剪接过程,还参与调控基因表达的不同层次,包括表观遗传DNA重塑、转录调控和蛋白质稳定性。SLU7在多种生物学过程中发挥关键作用,包括维持肝脏分化、基因组完整性和细胞周期进展。SLU7的异常表达与人类疾病有关,包括癌症。SLU7与环状RNA的功能密切相关,可以调节circCAPG的生物生成。SLU7还在DNA甲基化中发挥作用,对于维持DNMT1蛋白的稳定性和正确的DNA甲基化至关重要。SLU7对于维持肝细胞的核因子4α(HNF4α)的稳定性也至关重要。SLU7在肝损伤和人类肝细胞癌(HCC)中,无义介导的RNA降解(NMD)过程受到抑制。SLU7对于维持肝脏稳态至关重要。SLU7与SARS-CoV-2的非结构蛋白12(NSP12)相互作用,影响病毒进入、复制和基因剪接。SLU7和Prp18在酵母前mRNA剪接的第二步中协同作用。

综上所述,SLU7是一种重要的剪接因子,对于维持基因表达的多样性和精确性至关重要。SLU7不仅参与剪接过程,还参与调控基因表达的不同层次,包括表观遗传DNA重塑、转录调控和蛋白质稳定性。SLU7在多种生物学过程中发挥关键作用,包括维持肝脏分化、基因组完整性和细胞周期进展。SLU7的异常表达与人类疾病有关,包括癌症。SLU7与环状RNA的功能密切相关,可以调节circCAPG的生物生成。SLU7还在DNA甲基化中发挥作用,对于维持DNMT1蛋白的稳定性和正确的DNA甲基化至关重要。SLU7对于维持肝细胞的核因子4α(HNF4α)的稳定性也至关重要。SLU7在肝损伤和人类肝细胞癌(HCC)中,无义介导的RNA降解(NMD)过程受到抑制。SLU7对于维持肝脏稳态至关重要。SLU7与SARS-CoV-2的非结构蛋白12(NSP12)相互作用,影响病毒进入、复制和基因剪接。SLU7和Prp18在酵母前mRNA剪接的第二步中协同作用。这些研究表明SLU7在多种生物学过程中发挥重要作用,包括基因表达调控、细胞分化、发育、代谢和疾病发生。SLU7的研究有助于深入理解基因表达调控的机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Gárate-Rascón, María, Recalde, Miriam, Rojo, Carla, Arechederra, María, Berasain, Carmen. 2022. SLU7: A New Hub of Gene Expression Regulation-From Epigenetics to Protein Stability in Health and Disease. In International journal of molecular sciences, 23, . doi:10.3390/ijms232113411. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36362191/
2. Song, Runjie, Guo, Peilan, Ren, Xin, Liu, Jiali, Li, Xiangdong. 2023. A novel polypeptide CAPG-171aa encoded by circCAPG plays a critical role in triple-negative breast cancer. In Molecular cancer, 22, 104. doi:10.1186/s12943-023-01806-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37408008/
3. Recalde, Miriam, Gárate-Rascón, María, Elizalde, María, Arechederra, María, Berasain, Carmen. . The splicing regulator SLU7 is required to preserve DNMT1 protein stability and DNA methylation. In Nucleic acids research, 49, 8592-8609. doi:10.1093/nar/gkab649. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34331453/
4. Gárate-Rascón, María, Recalde, Miriam, Jimenez, Maddalen, Arechederra, María, Berasain, Carmen. 2021. Splicing Factor SLU7 Prevents Oxidative Stress-Mediated Hepatocyte Nuclear Factor 4α Degradation, Preserving Hepatic Differentiation and Protecting From Liver Damage. In Hepatology (Baltimore, Md.), 74, 2791-2807. doi:10.1002/hep.32029. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34170569/
5. Rojo, Carla, Gárate-Rascón, María, Recalde, Miriam, Arechederra, María, Berasain, Carmen. 2024. Caspases compromise SLU7 and UPF1 stability and NMD activity during hepatocarcinogenesis. In JHEP reports : innovation in hepatology, 6, 101118. doi:10.1016/j.jhepr.2024.101118. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39105183/
6. Elizalde, María, Urtasun, Raquel, Azkona, María, Ávila, Matías A, Berasain, Carmen. 2014. Splicing regulator SLU7 is essential for maintaining liver homeostasis. In The Journal of clinical investigation, 124, 2909-20. doi:10.1172/JCI74382. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24865429/
7. Yang, Li, Zeng, Xiao-Tao, Luo, Rong-Hua, Zheng, Yong-Tang, Cheng, Wei. . SARS-CoV-2 NSP12 utilizes various host splicing factors for replication and splicing regulation. In Journal of medical virology, 96, e29396. doi:10.1002/jmv.29396. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38235848/
8. James, Shelly-Ann, Turner, William, Schwer, Beate. . How Slu7 and Prp18 cooperate in the second step of yeast pre-mRNA splicing. In RNA (New York, N.Y.), 8, 1068-77. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12212850/