Ldb1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ldb1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-17753

品系全称

C57BL/6JCya-Ldb1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-16825-Ldb1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ldb1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-17753) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
LIM domain binding 1
基因别称
CLIM2,NLI
染色体号
Chr 19 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001113408 | Ensembl: ENSMUST00000185355
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~11
敲除长度
~5.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:894762Mice homozygous for disruptions in this gene die as embryos at E9.5-E10 with impaired primitive erythropoiesis and vascular development.
Ldb1(Lim domain binding protein 1)是一种保守的、广泛表达的蛋白质,它作为一种增强子环化因子,在调节基因表达中发挥着重要作用。Ldb1可以与不同的转录因子形成复合物,共同调控细胞特异性的基因表达。研究表明,Ldb1在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括红细胞生成、肝细胞基因表达、棕色脂肪组织功能和能量稳态等。

在红细胞生成过程中,Ldb1与Gata1、Tal1和Klf1等转录因子形成Ldb1复合物,共同调节红细胞基因的表达。Ldb1复合物可以介导长距离启动子-增强子相互作用,从而激活红细胞基因的表达。此外,Ldb1复合物还可以与Klf1协同作用,进一步调节红细胞基因的表达。这些发现为理解红细胞基因表达的全球调节机制提供了基础[1][5]。

在肝细胞基因表达中,Ldb1通过与肝转录因子HNF4A、FOXA1、TCF7和GATA4等相互作用,调节肝脏基因的表达。Ldb1可以通过占据增强子元件,并与肝转录因子协同作用,介导增强子-启动子相互作用,从而调节肝脏基因的表达。研究发现,Ldb1在肝脏代谢功能中发挥着重要作用,其缺陷会导致代谢基因表达失调和葡萄糖耐受不良[2]。

Ldb1还可以组织多增强子网络,以调节基因表达。研究发现,Ldb1可以直接和广泛地促进增强子-启动子环的形成,即使在缺乏CTCF、cohesin或YY1的情况下,Ldb1介导的接触也可以形成。此外,Ldb1还可以与SSBP2相互作用,稳定Ldb1,促进其在基因调控中的作用[3][6]。

除了在红细胞生成和肝细胞基因表达中的重要作用外,Ldb1还参与调节棕色脂肪组织(BAT)的功能。研究发现,Ldb1在BAT中表达,并通过占据Ucp1上游调节域,调节Ucp1的表达,从而影响BAT的产热和能量代谢。此外,Ldb1还可以与Lmo2、Lmo4和Lhx8等LIM结构域因子相互作用,共同调节BAT的功能。研究发现,Ldb1在维持全身葡萄糖和胰岛素耐受性、能量消耗和冷耐受性方面发挥着重要作用[4]。

综上所述,Ldb1作为一种重要的增强子环化因子,在调节基因表达中发挥着重要作用。Ldb1通过与不同的转录因子相互作用,共同调控红细胞生成、肝细胞基因表达、棕色脂肪组织功能和能量稳态等生物学过程。对Ldb1的深入研究有助于深入理解基因表达的调控机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Love, Paul E, Warzecha, Claude, Li, LiQi. 2013. Ldb1 complexes: the new master regulators of erythroid gene transcription. In Trends in genetics : TIG, 30, 1-9. doi:10.1016/j.tig.2013.10.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24290192/
2. Liu, Guoyou, Wang, Lei, Wess, Jürgen, Dean, Ann. . Enhancer looping protein LDB1 regulates hepatocyte gene expression by cooperating with liver transcription factors. In Nucleic acids research, 50, 9195-9211. doi:10.1093/nar/gkac707. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36018801/
3. Aboreden, Nicholas G, Lam, Jessica C, Goel, Viraat Y, Hansen, Anders S, Blobel, Gerd A. 2024. LDB1 establishes multi-enhancer networks to regulate gene expression. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.08.23.609430. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39229045/
4. Kepple, Jessica D, Liu, Yanping, Kim, Teayoun, Young, Martin, Hunter, Chad S. 2021. The transcriptional co-regulator LDB1 is required for brown adipose function. In Molecular metabolism, 53, 101284. doi:10.1016/j.molmet.2021.101284. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34198011/
5. Li, LiQi, Freudenberg, Johannes, Cui, Kairong, Jothi, Raja, Love, Paul E. 2013. Ldb1-nucleated transcription complexes function as primary mediators of global erythroid gene activation. In Blood, 121, 4575-85. doi:10.1182/blood-2013-01-479451. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23610375/
6. Wang, Hongyang, Kim, Juhyun, Wang, Zhizhi, Dean, Ann, Xu, Wenqing. 2019. Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117, 1042-1048. doi:10.1073/pnas.1914181117. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31892537/